【利用 #转录组#测序探究CSRP3对鸡 #成肌细胞#的作用】
调节鸡肌纤维类型特异性和维持性的机制还很不清楚。在哺乳动物中，CSRP3在维持典型的肌肉结构和功能方面起着非常重要的作用。
本研究探讨了CSRP3在鸡骨骼肌中的作用。首先，制备了鸡CSRP3抗体，比较了四种不同肌纤维组成的鸡骨骼肌中CSRP3基因的mRNA和蛋白表达水平。然后分析CSRP3沉默后对鸡成肌细胞转录组表达谱的影响。
结果表明，鸡骨骼肌中CSRP3基因的mRNA和蛋白表达水平均与其肌纤维类型组成相关。以Q<0.05，差异倍数大于1.5为筛选条件，共鉴定出650个差异基因。CSRP3沉默后，255个基因表达上调，395个基因表达下调。功能富集分析结果表明，心肌细胞肾上腺素能信号、脂肪细胞因子信号和apelin信号等多种通路在差异表达基因和所有表达基因中均显著（P<0.05）富集。共表达基因网络结果表明，CSRP3沉默后引起与肌原纤维组装、肌肉分化和收缩相关基因的代偿性上调（Q<0.05）。同时，CSRP3沉默后，两个快速肌球蛋白重链基因（MyH1B和MyH1E）表达上调（Q<0.05）。
这些结果表明，CSRP3在鸡肌纤维组成中发挥着重要作用，并可能通过调节MyH1B和MyH1E的表达从而影响鸡肌纤维类型的分布。
文章链接：https://t.cn/A6aq5juE
SHAN Yan-ju, JI Gai-ge, ZHANG Ming, LIU Yi-fan, TU Yun-jie, JU Xiao-jun, SHU Jing-ting, ZOU Jian-min. 2022. Use of transcriptome sequencing to explore the effect of CSRP3 on chicken myoblasts. Journal of Integrative Agriculture, in press.
#JIA优先在线文章##动物科学#
调节鸡肌纤维类型特异性和维持性的机制还很不清楚。在哺乳动物中，CSRP3在维持典型的肌肉结构和功能方面起着非常重要的作用。
本研究探讨了CSRP3在鸡骨骼肌中的作用。首先，制备了鸡CSRP3抗体，比较了四种不同肌纤维组成的鸡骨骼肌中CSRP3基因的mRNA和蛋白表达水平。然后分析CSRP3沉默后对鸡成肌细胞转录组表达谱的影响。
结果表明，鸡骨骼肌中CSRP3基因的mRNA和蛋白表达水平均与其肌纤维类型组成相关。以Q<0.05，差异倍数大于1.5为筛选条件，共鉴定出650个差异基因。CSRP3沉默后，255个基因表达上调，395个基因表达下调。功能富集分析结果表明，心肌细胞肾上腺素能信号、脂肪细胞因子信号和apelin信号等多种通路在差异表达基因和所有表达基因中均显著（P<0.05）富集。共表达基因网络结果表明，CSRP3沉默后引起与肌原纤维组装、肌肉分化和收缩相关基因的代偿性上调（Q<0.05）。同时，CSRP3沉默后，两个快速肌球蛋白重链基因（MyH1B和MyH1E）表达上调（Q<0.05）。
这些结果表明，CSRP3在鸡肌纤维组成中发挥着重要作用，并可能通过调节MyH1B和MyH1E的表达从而影响鸡肌纤维类型的分布。
文章链接：https://t.cn/A6aq5juE
SHAN Yan-ju, JI Gai-ge, ZHANG Ming, LIU Yi-fan, TU Yun-jie, JU Xiao-jun, SHU Jing-ting, ZOU Jian-min. 2022. Use of transcriptome sequencing to explore the effect of CSRP3 on chicken myoblasts. Journal of Integrative Agriculture, in press.
#JIA优先在线文章##动物科学#
【利用 #蛋白质组学#和 #转录组学#揭示优质蛋白 #玉米#中贮藏蛋白再平衡过程】
优质蛋白玉米(QPM)胚乳比普通玉米胚乳含有更高比例的赖氨酸、色氨酸和蛋氨酸等必须氨基酸，因此极大的提高了玉米的营养品质。但是，由于QPM中储藏蛋白再平衡的机制有待完善，从而阻碍了QPM的育种进程。
本研究使用蛋白质组和转录组技术对opaque2 (o2) 和QPM中储藏蛋白再平衡的过程进行探究。在Mo17o2和QPM中同时鉴定到的差异表达蛋白（DEP）的编码基因显著富集在与储藏蛋白、淀粉和氨基酸合成相关的通路中，表明相关通路在储藏蛋白再平衡的过程中发挥作用。同时发现在这些DEP中有178个前人报道过的非醇溶蛋白类型的储藏蛋白，上调表达的非醇溶蛋白富含赖氨酸、色氨酸和蛋氨酸，从而提高了QPM的蛋白品质。利用共表达网络分析筛选到一些在QPM 中起调控储藏蛋白合成作用的调控因子，这其中包括前人已经证实过的储藏蛋白的关键调控因子如O2和PBF1以及一些新发现的转录因子。
本研究鉴定到一些在QPM中上调表达的富含赖氨酸、色氨酸和蛋氨酸的非醇溶蛋白及其调控因子，该结果不仅有助于阐明QPM中蛋白品质提高的原因，揭示QPM中储藏蛋白再平衡的发生过程，也可为QPM的改良提供基因资源和理论指导。
文章链接：https://t.cn/A6aqGjCt
引用本文 >>>ZHAO Hai-liang, QIN Yao, XIAO Zi-yi, SUN Qin, GONG Dian-ming, QIU Fa-zhan 2022. Revealing the process of storage protein rebalancing in high quality protein maize by proteomic and transcriptomic. Journal of Integrative Agriculture, in press.
#JIA优先在线文章##作物科学##玉米#
优质蛋白玉米(QPM)胚乳比普通玉米胚乳含有更高比例的赖氨酸、色氨酸和蛋氨酸等必须氨基酸，因此极大的提高了玉米的营养品质。但是，由于QPM中储藏蛋白再平衡的机制有待完善，从而阻碍了QPM的育种进程。
本研究使用蛋白质组和转录组技术对opaque2 (o2) 和QPM中储藏蛋白再平衡的过程进行探究。在Mo17o2和QPM中同时鉴定到的差异表达蛋白（DEP）的编码基因显著富集在与储藏蛋白、淀粉和氨基酸合成相关的通路中，表明相关通路在储藏蛋白再平衡的过程中发挥作用。同时发现在这些DEP中有178个前人报道过的非醇溶蛋白类型的储藏蛋白，上调表达的非醇溶蛋白富含赖氨酸、色氨酸和蛋氨酸，从而提高了QPM的蛋白品质。利用共表达网络分析筛选到一些在QPM 中起调控储藏蛋白合成作用的调控因子，这其中包括前人已经证实过的储藏蛋白的关键调控因子如O2和PBF1以及一些新发现的转录因子。
本研究鉴定到一些在QPM中上调表达的富含赖氨酸、色氨酸和蛋氨酸的非醇溶蛋白及其调控因子，该结果不仅有助于阐明QPM中蛋白品质提高的原因，揭示QPM中储藏蛋白再平衡的发生过程，也可为QPM的改良提供基因资源和理论指导。
文章链接：https://t.cn/A6aqGjCt
引用本文 >>>ZHAO Hai-liang, QIN Yao, XIAO Zi-yi, SUN Qin, GONG Dian-ming, QIU Fa-zhan 2022. Revealing the process of storage protein rebalancing in high quality protein maize by proteomic and transcriptomic. Journal of Integrative Agriculture, in press.
#JIA优先在线文章##作物科学##玉米#
长沙新店｜藏在浏阳河边的超美餐酒吧
周末和小伙伴来万家丽玩，偶然看到了在浏阳河畔边的独栋两层超大餐酒吧～在室内吃完餐食再跑到超大的露营风格的露台吹吹风喝上一杯也太惬意了～
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他们家除了中餐还有西餐。环境真的很适合聚会宴请和叫上三两好友喝上一杯～
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️姜辣鸡：干锅类型的做法，鸡肉很扎实，辣椒和姜丝也炒得很入味，绝绝子～
虾仁炒藕尖：虾仁Q弹的口感加上脆爽的藕尖，真的很适合闷热的夏天来上一盘～
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店名：鸮XIAO SUPER LOUNGE
地址：浏阳河大道300号B1-301
营业时间：17:00-2:00
人均：165R#我也觉得不错#
周末和小伙伴来万家丽玩，偶然看到了在浏阳河畔边的独栋两层超大餐酒吧～在室内吃完餐食再跑到超大的露营风格的露台吹吹风喝上一杯也太惬意了～
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他们家除了中餐还有西餐。环境真的很适合聚会宴请和叫上三两好友喝上一杯～
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️姜辣鸡：干锅类型的做法，鸡肉很扎实，辣椒和姜丝也炒得很入味，绝绝子～
虾仁炒藕尖：虾仁Q弹的口感加上脆爽的藕尖，真的很适合闷热的夏天来上一盘～
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店名：鸮XIAO SUPER LOUNGE
地址：浏阳河大道300号B1-301
营业时间：17:00-2:00
人均：165R#我也觉得不错#
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