近日,华大在国际学术期刊Cell Host & Microbe上发表了一篇综述文章,基于近两年发表的人肠道病毒组数据库,系统总结了各个数据库的样本规模、样本地域组成、发现的病毒数量等信息,为后续研究的数据库选择提供了重要参考;同时,通过比较各个病毒组数据库的构建过程,总结出一套基于肠道宏基因组数据构建肠道病毒组数据库的“最佳实践”流程,对从头构建或者更新病毒数据库具有重要的指导意义。华大李俊桦研究员、杨芳明博士,华大基因学院副院长、副研究员肖敏凤为本综述论文共同第一作者,2021级在读硕士李艾欣为署名作者。
热点知事:华夏智慧库‖“超级面包虫”有望推动聚苯乙烯塑料回收利用
热塑性聚苯乙烯(PS)由于廉价和耐用,逐渐成为全球最流行的聚合物之一,但由于其缺乏有效的回收,且难以被微生物高效降解,已经引起了广泛的负面环境影响。因此,寻找新的方法手段实现PS塑料的循环利用显得迫在眉睫。
近日,澳大利亚昆士兰大学的研究人员发表题为“Insights into plastic biodegradation: community composition and functional capabilities of the superworm (Zophobas morio) microbiome in styrofoam feeding trials”的研究论文,描述了一种专门吃泡沫塑料的“超级面包虫”(大麦虫),其肠道细菌中含有特定酶,实现了PS的降解。该发现有望推动大规模回收PS塑料,为PS塑料的循环利用奠定基础。
研究人员评估了用麸皮、聚苯乙烯或饥饿条件饲养的大麦虫在3周内肠道微生物组的变化情况。对比发现喂食组的大麦虫都能完成其蛹和成虫的生命周期。通过电子显微镜证实,大麦虫肠道中的PS颗粒已被部分降解,并显示出附着的微生物细胞。通过宏基因组分析,与喂食麸皮组的大麦虫相比,喂食PS组大麦虫肠道微生物多样性较低。进一步分析发现喂食PS组的大麦虫肠道中检测到了几种具有PS和苯乙烯降解能力的编码酶,这一发现首次提出了对“超级面包虫”肠道微生物组用于降解PS代谢途径的宏基因组学见解,有助于减少PS造成的环境污染。 今日头条 https://t.cn/A6aSb4Lf
热塑性聚苯乙烯(PS)由于廉价和耐用,逐渐成为全球最流行的聚合物之一,但由于其缺乏有效的回收,且难以被微生物高效降解,已经引起了广泛的负面环境影响。因此,寻找新的方法手段实现PS塑料的循环利用显得迫在眉睫。
近日,澳大利亚昆士兰大学的研究人员发表题为“Insights into plastic biodegradation: community composition and functional capabilities of the superworm (Zophobas morio) microbiome in styrofoam feeding trials”的研究论文,描述了一种专门吃泡沫塑料的“超级面包虫”(大麦虫),其肠道细菌中含有特定酶,实现了PS的降解。该发现有望推动大规模回收PS塑料,为PS塑料的循环利用奠定基础。
研究人员评估了用麸皮、聚苯乙烯或饥饿条件饲养的大麦虫在3周内肠道微生物组的变化情况。对比发现喂食组的大麦虫都能完成其蛹和成虫的生命周期。通过电子显微镜证实,大麦虫肠道中的PS颗粒已被部分降解,并显示出附着的微生物细胞。通过宏基因组分析,与喂食麸皮组的大麦虫相比,喂食PS组大麦虫肠道微生物多样性较低。进一步分析发现喂食PS组的大麦虫肠道中检测到了几种具有PS和苯乙烯降解能力的编码酶,这一发现首次提出了对“超级面包虫”肠道微生物组用于降解PS代谢途径的宏基因组学见解,有助于减少PS造成的环境污染。 今日头条 https://t.cn/A6aSb4Lf
【Nat Methods 新工具| 杨辉团队发现和应用新Cas13X/Y系统进行高效的RNA编辑】
#bioart日历# Crisper来啦
2021年 5 月2日,中科院脑智中心(中科院神经所)杨辉团队在#Nature Methods#上在线发表了题为Programmable RNA editing with compact CRISPR–Cas13 systems from uncultivated microbes的研究论文。该研究通过对微生物大规模宏基因组数据进行计算分析发现两类新的CRISPR/Cas13系统,通过功能实验和工程化改造开发了一套高效率和高特异性的RNA编辑工具,该工具对开发基于RNA编辑的基因治疗手段具有重要的促进作用。
https://t.cn/A6aJC537
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2021年 5 月2日,中科院脑智中心(中科院神经所)杨辉团队在#Nature Methods#上在线发表了题为Programmable RNA editing with compact CRISPR–Cas13 systems from uncultivated microbes的研究论文。该研究通过对微生物大规模宏基因组数据进行计算分析发现两类新的CRISPR/Cas13系统,通过功能实验和工程化改造开发了一套高效率和高特异性的RNA编辑工具,该工具对开发基于RNA编辑的基因治疗手段具有重要的促进作用。
https://t.cn/A6aJC537
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