#早安##早安泉州# 泉州17日晴,气温6℃到13℃,东风3级;中暑指数1级,不会中暑;感冒指数4级,感冒高发,注意防范;紫外线指数3级,中等,需遮阳与涂防晒霜;人体舒适度-2级,冷,不舒适;夜晨舒适度-3级,寒冷,很不舒适;穿衣指数6级, 穿冬棉衣类;郊游指数3级,天气还可以,出来玩玩吧;森林火险2级,低度危险,难燃烧,难蔓延。
今天上午上班天气晴,气温9度左右;中午下班天气晴,气温12度左右;下午上班天气晴,气温13度左右;傍晚下班天气晴,气温10度左右。泉州市气象台02月17日06时发布,附一张今晨最低气温。终于可以洗洗晒晒了。@泉州公安 @泉州交警 @福建气象 @知天气 @福建闽南网 https://t.cn/z8tklrN https://t.cn/z8tklrN
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2019新型冠状病毒:10个基因团伙制造“惊天大案”
2020-02-11 18:46:24 来源: 科技日报 作者: 张积森
冠状,指病毒的独特形状,作为一种大型病毒家族,冠状病毒常见于哺乳类和鸟类中。
与动植物基因组相比,2019新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组实在太简约,但并不简单。那么,2019-nCoV基因组中的这几个基因又是怎样“朋比为奸”的?
2019-nCoV基因组简约但并不简单
根据NCBI数据库中,2019-nCoV的NC_045512.2版本,2019新型冠状病毒的基因组序列是具有29903bp的单链RNA(ss-RNA)。这么少的遗传信息物质,却拥有10个基因,并经济高效地编码了这10个蛋白,而在许多高等生物中一个长点的基因就可以是30Kbp以上,可见这个病毒RNA基因组的简约。我们人类拥有30亿个碱基对、2万多个基因,但在2019-nCoV用不到人类万分之一的碱基序列、二千分之一的基因的攻击下,我们却节节溃败,这就是它的不简单。
在2019-nCoV基因组中,最长基因编码4405个氨基酸,这个蛋白是非结构性多蛋白,包括多个复制酶功能域。复制酶是一种依赖于RNA的RNA聚合酶,RNA聚合酶是RNA生成的催化剂。由于2019-nCoV不存在RNA病毒复制所需的RNA聚合酶,只有进入宿主细胞后,直接以病毒基因组RNA为翻译模板,表达出病毒RNA聚合酶。进而是应用这个酶完成负链亚基因组RNA的转录合成、各种结构蛋白mRNA的合成,从而进行病毒基因组RNA的复制。
冠状病毒感染会重新排列宿主细胞膜,以组装复制/转录复合体,在其中发生病毒基因组的复制和病毒mRNA的转录。在之前的基因组研究中,报告过已知nsp3和nsp4的共存会引起膜重排,但尚不清楚这两种蛋白相互作用的潜在机制。通过使用SARS-CoV的感染性cDNA克隆和复制子系统,nsp3-nsp4相互作用的丧失消除了病毒复制。所以如果能改变这个基因的复制酶功能域,或许可以揭示治疗乙型冠状病毒感染的抗病毒靶标。
2019-nCoV里的“护卫”“冲锋兵”“运输兵”
在冠状病毒基因组中,有三个基因是该病毒的“护卫”“冲锋兵”以及“运输兵”。
第一个S基因,编码刺突糖蛋白,这是用于包病毒的外壳的蛋白。第二个M基因,编码膜糖蛋白,负责营养物质的跨膜运输、新生病毒出芽释放与病毒外包膜的形成。另外E基因,是很短的编码75个氨基酸的小包膜糖蛋白,可以与包膜结合的蛋白。这三个家伙就形成了病毒蛋白的脂肪膜,把这个病毒“老大”(30K的单链RNA)给包起来。其实单链的RNA是十分不稳定,且容易变异,而且由于人体有大量的RNA酶会迅速消灭RNA,它只有在蛋白外壳的保护和引导下,才能进入人体“撒野”。
此外,该基因组中,如ORF3a和近缘病毒不同株系比对显得更“积极”,相似度为75%—91%,应该是冠状病毒变异的先驱基因,但功能不太明确;ORF7a是一个单次穿膜蛋白,和最近缘病毒的同源基因相似度较高,在84%以上,这个基因可能是冠状病毒的基本功能基因,从而序列较保守;ORF8是一个很诡异的基因,功能不太明确,但蛋白序列变异大,可能受自然选择压力较小,要不然变异率不会这么高;ORF10是一个核衣壳磷蛋白,该蛋白将病毒基因组包装到螺旋核糖核衣壳(RNP)中,并在病毒自组装过程中起基本作用。它是一种具有多种活性的蛋白质,与近缘病毒的同源基因相似度高达90%,这可能是因为该基因负责着病毒基因组包装的看家功能。
2019-nCoV与最近缘病毒的全基因组相似覆盖度为88%,相似度为82%。由于病毒没有化石,很难从基因组分化的角度判断不同病毒世代变异率。因而,2019-nCoV和地球的许多病毒一样,长期在人类周围,人类永远无法真正意义地“消灭”它们,只能驱离这10个基因早点远离我们的基因,从而避免它们进入人体当起“统治者”,指导里面2万多个基因里的部分“叛变者”的产物为它服务。
(作者系福建农林大学海峡联合研究院基因组中心常务副主任、教授)
2020-02-11 18:46:24 来源: 科技日报 作者: 张积森
冠状,指病毒的独特形状,作为一种大型病毒家族,冠状病毒常见于哺乳类和鸟类中。
与动植物基因组相比,2019新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组实在太简约,但并不简单。那么,2019-nCoV基因组中的这几个基因又是怎样“朋比为奸”的?
2019-nCoV基因组简约但并不简单
根据NCBI数据库中,2019-nCoV的NC_045512.2版本,2019新型冠状病毒的基因组序列是具有29903bp的单链RNA(ss-RNA)。这么少的遗传信息物质,却拥有10个基因,并经济高效地编码了这10个蛋白,而在许多高等生物中一个长点的基因就可以是30Kbp以上,可见这个病毒RNA基因组的简约。我们人类拥有30亿个碱基对、2万多个基因,但在2019-nCoV用不到人类万分之一的碱基序列、二千分之一的基因的攻击下,我们却节节溃败,这就是它的不简单。
在2019-nCoV基因组中,最长基因编码4405个氨基酸,这个蛋白是非结构性多蛋白,包括多个复制酶功能域。复制酶是一种依赖于RNA的RNA聚合酶,RNA聚合酶是RNA生成的催化剂。由于2019-nCoV不存在RNA病毒复制所需的RNA聚合酶,只有进入宿主细胞后,直接以病毒基因组RNA为翻译模板,表达出病毒RNA聚合酶。进而是应用这个酶完成负链亚基因组RNA的转录合成、各种结构蛋白mRNA的合成,从而进行病毒基因组RNA的复制。
冠状病毒感染会重新排列宿主细胞膜,以组装复制/转录复合体,在其中发生病毒基因组的复制和病毒mRNA的转录。在之前的基因组研究中,报告过已知nsp3和nsp4的共存会引起膜重排,但尚不清楚这两种蛋白相互作用的潜在机制。通过使用SARS-CoV的感染性cDNA克隆和复制子系统,nsp3-nsp4相互作用的丧失消除了病毒复制。所以如果能改变这个基因的复制酶功能域,或许可以揭示治疗乙型冠状病毒感染的抗病毒靶标。
2019-nCoV里的“护卫”“冲锋兵”“运输兵”
在冠状病毒基因组中,有三个基因是该病毒的“护卫”“冲锋兵”以及“运输兵”。
第一个S基因,编码刺突糖蛋白,这是用于包病毒的外壳的蛋白。第二个M基因,编码膜糖蛋白,负责营养物质的跨膜运输、新生病毒出芽释放与病毒外包膜的形成。另外E基因,是很短的编码75个氨基酸的小包膜糖蛋白,可以与包膜结合的蛋白。这三个家伙就形成了病毒蛋白的脂肪膜,把这个病毒“老大”(30K的单链RNA)给包起来。其实单链的RNA是十分不稳定,且容易变异,而且由于人体有大量的RNA酶会迅速消灭RNA,它只有在蛋白外壳的保护和引导下,才能进入人体“撒野”。
此外,该基因组中,如ORF3a和近缘病毒不同株系比对显得更“积极”,相似度为75%—91%,应该是冠状病毒变异的先驱基因,但功能不太明确;ORF7a是一个单次穿膜蛋白,和最近缘病毒的同源基因相似度较高,在84%以上,这个基因可能是冠状病毒的基本功能基因,从而序列较保守;ORF8是一个很诡异的基因,功能不太明确,但蛋白序列变异大,可能受自然选择压力较小,要不然变异率不会这么高;ORF10是一个核衣壳磷蛋白,该蛋白将病毒基因组包装到螺旋核糖核衣壳(RNP)中,并在病毒自组装过程中起基本作用。它是一种具有多种活性的蛋白质,与近缘病毒的同源基因相似度高达90%,这可能是因为该基因负责着病毒基因组包装的看家功能。
2019-nCoV与最近缘病毒的全基因组相似覆盖度为88%,相似度为82%。由于病毒没有化石,很难从基因组分化的角度判断不同病毒世代变异率。因而,2019-nCoV和地球的许多病毒一样,长期在人类周围,人类永远无法真正意义地“消灭”它们,只能驱离这10个基因早点远离我们的基因,从而避免它们进入人体当起“统治者”,指导里面2万多个基因里的部分“叛变者”的产物为它服务。
(作者系福建农林大学海峡联合研究院基因组中心常务副主任、教授)
科技系统动作不断,科研项目创新成果“剑指”病毒
2020-02-06 19:03:40 来源: 科技日报 作者: 盛利
自新型冠状病毒感染的肺炎疫情出现以来,按照科技部抓紧推动新型肺炎疫情防控应急科技攻关的部署,各地正积极整合产学研力量,围绕一线疫情防控紧迫需求和重点突破方向,部署新型肺炎科技攻关专项。截至6日,山西、陕西、四川、福建、广西等地的省、市各级科技部门,开辟科研项目“绿色通道”,采取随时申报、随时受理等多种形式,“剑指”新型肺炎科技攻关。
紧急开辟科研项目“绿色通道”
在四川成都市,科技主管部门专题研究科技支撑新型冠状病毒感染肺炎防控应急工作,提出大力支持在成都的医疗(疾控)机构、高校院所、科技型企业实施新型冠状病毒感染肺炎防控应急科技攻关项目。
目前,成都市科技局围绕新型冠状肺炎治疗、防控及快速筛查等领域,筛选出23项科技攻关任务,并对涉及近期应急攻关任务需求的“新型冠状病毒肺炎防控关键技术的优化与推广应用”等8个项目,建立“绿色通道”立即组织启动科技攻关,为科技防疫提供资金支持和保障,累计经费280万元均纳入2020年第一批医疗健康领域科技项目。
在陕西,新型冠状病毒感染的肺炎疫情发生后,省科技厅设立了“新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急防治”专项计划,采取“定向委托+绿色通道”的方式,简化申报立项程序,引导科研单位和科技人员积极投入到抗击疫情科研攻关。截至3日,首批8个应急科技项目已经付诸实施,初步形成“后方科研+前方实践”的攻关模式。
疫情防控产品加速驰援一线
在福建省,新型肺炎疫情发生后,该省紧急启动应急科研攻关,成立以厅主要领导为组长的科技攻关协调组,以及15名相关专家组成的科研攻关专家咨询组,建立省、市、县三级科技系统科研攻关部署等制度,努力形成全省科研攻关合力。
该省已采取“先研究、后立项”“边申报、边研究”等措施,迅速组织动员全省优势科研力量,加大科研攻关力度,推动多项疫情防控产品研发进展顺利并取得初步成果,发挥了科研攻关在早诊断、早治疗方面的作用。
福建省科技厅副厅长林伯德表示,目前厦门大学李庆阁团队应用于新型冠状病毒的核酸提取试剂备案注册成功,每周可向市场供应4.2万人份;福州大学林峻团队研发的新型冠状病毒检测试剂盒,己通过快速通道申报“国家第三类医疗器械证书”,获批后每周可向市场供应7万人份以上。
此外,厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心科研团队也开展新型冠状病毒快速诊断技术和产品的研发,并与香港大学等单位建立产学研紧密联合攻关联盟,正加紧开展疫苗的研发工作。阿吉安(福州)基因、厦门艾德生物、厦门宝太生物等企业也已紧急研制新型冠状病毒检测试剂盒,正申请进入国家药监局的快速审批通道。
科研项目“随时申报、随时受理”
在山西,省科技厅已凝练并发布《山西省“新型冠状病毒(2019-nCoV)防控研究”专项项目指南》,面向全社会组织科研力量开展应急防控技术科研攻关。为应对疫情防控迫切需求,《指南》简化申报程序、放宽申报条件,在春节假期采用信息化、网络化手段实现“随时申报、随时受理”,鼓励开展跨区域联合研究。目前,该省已围绕新型肺炎的诊疗方案、有效药物筛选、病毒溯源和中西医结合等,研究确定首批项目14项,并优先给予每个项目启动资金,后续经费将根据项目进展、疫情防控效果和需求预算,进行统筹推进。
在广西,科技部门已发布《新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急科技攻关专项项目申报指南》。继2月3日紧急启动首批新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急科技攻关专项项目后,科技厅瞄准疫情防控产品研发、疫病防治技术、临床诊治技术等3个重点方向,已启动第二批新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急科研攻关专项项目。本着“急事急办、特事特办”的原则,全天候开通科技管理信息平台。
新闻发布会现场 柯秀香摄(图)
2020-02-06 19:03:40 来源: 科技日报 作者: 盛利
自新型冠状病毒感染的肺炎疫情出现以来,按照科技部抓紧推动新型肺炎疫情防控应急科技攻关的部署,各地正积极整合产学研力量,围绕一线疫情防控紧迫需求和重点突破方向,部署新型肺炎科技攻关专项。截至6日,山西、陕西、四川、福建、广西等地的省、市各级科技部门,开辟科研项目“绿色通道”,采取随时申报、随时受理等多种形式,“剑指”新型肺炎科技攻关。
紧急开辟科研项目“绿色通道”
在四川成都市,科技主管部门专题研究科技支撑新型冠状病毒感染肺炎防控应急工作,提出大力支持在成都的医疗(疾控)机构、高校院所、科技型企业实施新型冠状病毒感染肺炎防控应急科技攻关项目。
目前,成都市科技局围绕新型冠状肺炎治疗、防控及快速筛查等领域,筛选出23项科技攻关任务,并对涉及近期应急攻关任务需求的“新型冠状病毒肺炎防控关键技术的优化与推广应用”等8个项目,建立“绿色通道”立即组织启动科技攻关,为科技防疫提供资金支持和保障,累计经费280万元均纳入2020年第一批医疗健康领域科技项目。
在陕西,新型冠状病毒感染的肺炎疫情发生后,省科技厅设立了“新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急防治”专项计划,采取“定向委托+绿色通道”的方式,简化申报立项程序,引导科研单位和科技人员积极投入到抗击疫情科研攻关。截至3日,首批8个应急科技项目已经付诸实施,初步形成“后方科研+前方实践”的攻关模式。
疫情防控产品加速驰援一线
在福建省,新型肺炎疫情发生后,该省紧急启动应急科研攻关,成立以厅主要领导为组长的科技攻关协调组,以及15名相关专家组成的科研攻关专家咨询组,建立省、市、县三级科技系统科研攻关部署等制度,努力形成全省科研攻关合力。
该省已采取“先研究、后立项”“边申报、边研究”等措施,迅速组织动员全省优势科研力量,加大科研攻关力度,推动多项疫情防控产品研发进展顺利并取得初步成果,发挥了科研攻关在早诊断、早治疗方面的作用。
福建省科技厅副厅长林伯德表示,目前厦门大学李庆阁团队应用于新型冠状病毒的核酸提取试剂备案注册成功,每周可向市场供应4.2万人份;福州大学林峻团队研发的新型冠状病毒检测试剂盒,己通过快速通道申报“国家第三类医疗器械证书”,获批后每周可向市场供应7万人份以上。
此外,厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心科研团队也开展新型冠状病毒快速诊断技术和产品的研发,并与香港大学等单位建立产学研紧密联合攻关联盟,正加紧开展疫苗的研发工作。阿吉安(福州)基因、厦门艾德生物、厦门宝太生物等企业也已紧急研制新型冠状病毒检测试剂盒,正申请进入国家药监局的快速审批通道。
科研项目“随时申报、随时受理”
在山西,省科技厅已凝练并发布《山西省“新型冠状病毒(2019-nCoV)防控研究”专项项目指南》,面向全社会组织科研力量开展应急防控技术科研攻关。为应对疫情防控迫切需求,《指南》简化申报程序、放宽申报条件,在春节假期采用信息化、网络化手段实现“随时申报、随时受理”,鼓励开展跨区域联合研究。目前,该省已围绕新型肺炎的诊疗方案、有效药物筛选、病毒溯源和中西医结合等,研究确定首批项目14项,并优先给予每个项目启动资金,后续经费将根据项目进展、疫情防控效果和需求预算,进行统筹推进。
在广西,科技部门已发布《新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急科技攻关专项项目申报指南》。继2月3日紧急启动首批新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急科技攻关专项项目后,科技厅瞄准疫情防控产品研发、疫病防治技术、临床诊治技术等3个重点方向,已启动第二批新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急科研攻关专项项目。本着“急事急办、特事特办”的原则,全天候开通科技管理信息平台。
新闻发布会现场 柯秀香摄(图)
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