第八届园丁奖阳台组《001号》啦啦的自由花园
坐标:成都
园龄:2年
可用面积:5平米
作者:LALADEMI(啦啦:开心)
爱上养花这件事,好像是冥冥之中,与生活产生了紧密的关联。
童年看家人种花养鱼,爷爷做的假山盆景,鱼儿围绕在缩小的石头山下游泳,爸爸将这些美好事物用油彩一张张记录在了画布上。第八届园丁奖阳台组《001号》啦啦的自由花园 https://t.cn/A6oIGI4X
坐标:成都
园龄:2年
可用面积:5平米
作者:LALADEMI(啦啦:开心)
爱上养花这件事,好像是冥冥之中,与生活产生了紧密的关联。
童年看家人种花养鱼,爷爷做的假山盆景,鱼儿围绕在缩小的石头山下游泳,爸爸将这些美好事物用油彩一张张记录在了画布上。第八届园丁奖阳台组《001号》啦啦的自由花园 https://t.cn/A6oIGI4X
气泡图如何看(2)
我们今天重点分析高级气泡图!
那么遇到这类图该怎么看呢?
Emmmmm,还是那句话,天下各图本一家,看看横坐标纵坐标都代表什么呢?
根据文章作者的分析目的,气泡图各参数有以下几种意义(图1):
Y轴:代表细胞的生物学功能(诸如生物过程BP,分子功能MF,细胞组分CC)或者各分子发挥功能的通路(如代谢途径,致癌途径等等);
X轴:常见的有这三种——GeneRatio是你的基因列表富集到目的通路基因数占基因列表包含基因集总基因比例,richFactor是富集到目标通路基因数占比,BgRatio是目标通路基因占通路集总基因比例。总之一个词,比例;
气泡面积大小:富集基因的数量;
气泡颜色:富集显著性,即P value 或 Q value数值的大小。
看下图(图2)实例:
以最下面的这个气泡为例,所筛选出来的差异基因有2.5%(横坐标)富集在致癌途径(纵坐标)中,基因数量是9个(气泡大小),且相关性较高(红色)。
当然,实际阅读文献过程中,作者可能会根据自己需要进行个性化调整,大家要注意识别横坐标纵坐标的意义!#生物信息学##医学sci##生信分析##气泡图#
我们今天重点分析高级气泡图!
那么遇到这类图该怎么看呢?
Emmmmm,还是那句话,天下各图本一家,看看横坐标纵坐标都代表什么呢?
根据文章作者的分析目的,气泡图各参数有以下几种意义(图1):
Y轴:代表细胞的生物学功能(诸如生物过程BP,分子功能MF,细胞组分CC)或者各分子发挥功能的通路(如代谢途径,致癌途径等等);
X轴:常见的有这三种——GeneRatio是你的基因列表富集到目的通路基因数占基因列表包含基因集总基因比例,richFactor是富集到目标通路基因数占比,BgRatio是目标通路基因占通路集总基因比例。总之一个词,比例;
气泡面积大小:富集基因的数量;
气泡颜色:富集显著性,即P value 或 Q value数值的大小。
看下图(图2)实例:
以最下面的这个气泡为例,所筛选出来的差异基因有2.5%(横坐标)富集在致癌途径(纵坐标)中,基因数量是9个(气泡大小),且相关性较高(红色)。
当然,实际阅读文献过程中,作者可能会根据自己需要进行个性化调整,大家要注意识别横坐标纵坐标的意义!#生物信息学##医学sci##生信分析##气泡图#
第八届园丁奖露台组《030号》洛基花园
坐标:河南方城
面积:260平米·
园龄:2年
作者:Amelia
花园就像一个过滤器,它承载着小时候的梦想,在我的生活中扮演着重要的绝色。疫情带来的一个“契机”,让从小一直喜欢花草植物的我萌生了莳花弄草的想法。第八届园丁奖露台组《030号》洛基花园 https://t.cn/A6oGbXzW
坐标:河南方城
面积:260平米·
园龄:2年
作者:Amelia
花园就像一个过滤器,它承载着小时候的梦想,在我的生活中扮演着重要的绝色。疫情带来的一个“契机”,让从小一直喜欢花草植物的我萌生了莳花弄草的想法。第八届园丁奖露台组《030号》洛基花园 https://t.cn/A6oGbXzW
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