#全球导视设计之美# 奥斯陆国家博物馆 | metric设计公司
针对四个馆的设施和要求使用双语寻路系统,即英语和挪威语,计了丰富的icon,用于支持其他国家的信息。采用绿色、白色和黑色的配色,标牌为石板和金属面板镶嵌的形式,简约而具有质感。部分磁吸的面板,可用于临时展览更替信息,整套导视系统高度灵活,易于维护。
针对四个馆的设施和要求使用双语寻路系统,即英语和挪威语,计了丰富的icon,用于支持其他国家的信息。采用绿色、白色和黑色的配色,标牌为石板和金属面板镶嵌的形式,简约而具有质感。部分磁吸的面板,可用于临时展览更替信息,整套导视系统高度灵活,易于维护。
火山图怎么看(2)
3)差异基因筛选阈值设置:根据差异倍数(fold change)和显著性(P-value)设定差异基因的筛选阈值
p-value:表示某个基因在分组之间的表达是否差异显著,一般认为p-value<0.05为显著。adjusted p-value:即经过统计学方法校正后的p-value,由于统计学上常用的校正方法包括“BH”、“FDR”等,所以在一些文章中,我们也会看到筛选差异基因的阈值是FDR<0.05。p值越小差异越显著,但直接用adjusted p-value画图的话点会集中在底部不美观,而-log 10 (adjusted p-value)转换后正好是反了过来,数值越大越显著,而且以10为底很容易换算回去,做出的图比较美观。
Fold Change:表示两个分组之间的差异倍数,其绝对值越大说明某基因在两组之间的表达差异也越大。该值为正时,表示差异上调;该值为负时,表示差异下调。画图时,一般转换为log2FoldChange,使展示更直观。
示例:我们按示例图中将“adjusted p-value<0.05”且“log2FoldChange的绝对值大于1”设置为差异基因筛选阈值,那么:
-log 10 (adj. p-value) > 1.30且log2FoldChange > 1的基因为红色点,即UP;
-log10 (adj. p-value) >1.30且log2FoldChange < -1的基因为蓝色点,即DOWN;
-log 10 (adj. p-value) <1.30的基因为黑色点,即NOT。 #生信分析##生物信息学##r语言绘图##火山图#
3)差异基因筛选阈值设置:根据差异倍数(fold change)和显著性(P-value)设定差异基因的筛选阈值
p-value:表示某个基因在分组之间的表达是否差异显著,一般认为p-value<0.05为显著。adjusted p-value:即经过统计学方法校正后的p-value,由于统计学上常用的校正方法包括“BH”、“FDR”等,所以在一些文章中,我们也会看到筛选差异基因的阈值是FDR<0.05。p值越小差异越显著,但直接用adjusted p-value画图的话点会集中在底部不美观,而-log 10 (adjusted p-value)转换后正好是反了过来,数值越大越显著,而且以10为底很容易换算回去,做出的图比较美观。
Fold Change:表示两个分组之间的差异倍数,其绝对值越大说明某基因在两组之间的表达差异也越大。该值为正时,表示差异上调;该值为负时,表示差异下调。画图时,一般转换为log2FoldChange,使展示更直观。
示例:我们按示例图中将“adjusted p-value<0.05”且“log2FoldChange的绝对值大于1”设置为差异基因筛选阈值,那么:
-log 10 (adj. p-value) > 1.30且log2FoldChange > 1的基因为红色点,即UP;
-log10 (adj. p-value) >1.30且log2FoldChange < -1的基因为蓝色点,即DOWN;
-log 10 (adj. p-value) <1.30的基因为黑色点,即NOT。 #生信分析##生物信息学##r语言绘图##火山图#
图:肾小球的平面模式图
肾小球是由大量的毛细血管网组成,其血管之间依靠系膜细胞(蓝色:起支撑作用)相互连接,而相邻部位没有其他血管的面积则有基底膜(绿色)和足突(黑色),基底膜和足突组成了滤过屏障,防止机体重要蛋白的丢失。Unfortunately,当机体的免疫应答超过一定的限度发展为炎症时,即来自血液的免疫复合物和肾小球本身免疫应答产生的复合物会刺激肾小球产生炎症和损伤,而这时无滤过屏障保护的,被系膜所连接部分的血管面积就会被优先损伤,而致免疫复合物沉积。又由于系膜细胞本身会伸出足突至基底膜与血管内皮处,故免疫复合物又会沉积于内皮细胞与基底膜之间。
#医涯自省#
事物都具有两面性,看似帮助机体井然有序进行生命活动的系膜细胞,却是疾病发生的首要因素。
肾小球是由大量的毛细血管网组成,其血管之间依靠系膜细胞(蓝色:起支撑作用)相互连接,而相邻部位没有其他血管的面积则有基底膜(绿色)和足突(黑色),基底膜和足突组成了滤过屏障,防止机体重要蛋白的丢失。Unfortunately,当机体的免疫应答超过一定的限度发展为炎症时,即来自血液的免疫复合物和肾小球本身免疫应答产生的复合物会刺激肾小球产生炎症和损伤,而这时无滤过屏障保护的,被系膜所连接部分的血管面积就会被优先损伤,而致免疫复合物沉积。又由于系膜细胞本身会伸出足突至基底膜与血管内皮处,故免疫复合物又会沉积于内皮细胞与基底膜之间。
#医涯自省#
事物都具有两面性,看似帮助机体井然有序进行生命活动的系膜细胞,却是疾病发生的首要因素。
✋热门推荐