金粟兰目基因组信息被揭示 或可助解开达尔文“恼人之谜”
11月26日,《自然·通讯》在线发表了来自兰州大学刘建全团队的文章《四川金粟兰基因组揭示被子植物早期分化历程》,填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息,并对被子植物的早期演化历程提供了更为翔实的证据。
被子植物是地球上分布范围最广、多样化最高、适应性最强的陆生植物类群,极大地影响了其他生物类群的演化进程。然而,由于被子植物在早期经历了快速的辐射进化,其内部演化关系迟迟未被解决,这一问题也被称为达尔文的“恼人之谜”。
目前被子植物被划分为无油樟目、睡莲目、木兰藤目和核心被子植物。无油樟目、睡莲目、木兰藤目是被子植物的基部类群,系统发育关系相对稳定,而核心被子植物包含了约99.95%的被子植物,又可被划分为双子叶、单子叶、木兰类、金鱼藻目和金粟兰目5大类群,它们之间的演化关系一直存在争议。
近年来,随着各类群代表物种的全基因组测序相继完成,其各自的进化历程均有了可靠的证据。刘建全团队在2020年首次报道了金鱼藻和芡实的基因组,证明了核心被子植物内部存在广泛的不完全谱系分选和杂交事件是导致树形冲突的主要原因。但是金粟兰目一直未有基因组报道,其演化历程以及整个核心被子植物的演化过程还有待深入分析。为此,该团队再次利用Nanopore、Illumina和Hi-C技术,构建了第一个金粟兰目植物(四川金粟兰)的高质量染色体级别基因组,并使用多种分析方法对上述问题进行了深入的阐述。
通过使用多种系统发育基因组学分析,研究团队进行串联树和溯祖树的构建,同时评估长枝吸引、物种选择和同源聚类方法等的影响,使用多套数据集合和多种分析方法,获得了高可信度的拓扑结构,即金粟兰目和木兰类具有最近的亲缘关系,且它们一起与金鱼藻目+双子叶植物构成姊妹关系,而单子叶植物是其他所有核心被子植物的姊妹枝。
同时,作者也发现了大量的基因树或叶绿体树与物种树不一致的情况,因此着重评估了不完全谱系分选(ILS)和杂交事件对此冲突的贡献。
此外,本研究还鉴定了四川金粟兰独有的一次WGD事件,同时5大核心被子植物分枝的加倍事件都不共享;鉴定了花发育相关的基因家族,解析了其特有花器官的可能形成原因;鉴定了萜类合成和木质部形成相关的基因家族,为今后研究其简单木质部形成和萜类物种合成通路演化提供了基础。
该研究报道了高质量的四川金粟兰基因组,填补了核心被子植物金粟兰目的基因组信息,并通过多种分析策略和方法,深入揭示了核心被子植物间的复杂演化历程。该成果对于早期被子植物的起源、辐射进化以及适应性演化提供数据支撑和理论基础。
来源:科技日报
11月26日,《自然·通讯》在线发表了来自兰州大学刘建全团队的文章《四川金粟兰基因组揭示被子植物早期分化历程》,填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息,并对被子植物的早期演化历程提供了更为翔实的证据。
被子植物是地球上分布范围最广、多样化最高、适应性最强的陆生植物类群,极大地影响了其他生物类群的演化进程。然而,由于被子植物在早期经历了快速的辐射进化,其内部演化关系迟迟未被解决,这一问题也被称为达尔文的“恼人之谜”。
目前被子植物被划分为无油樟目、睡莲目、木兰藤目和核心被子植物。无油樟目、睡莲目、木兰藤目是被子植物的基部类群,系统发育关系相对稳定,而核心被子植物包含了约99.95%的被子植物,又可被划分为双子叶、单子叶、木兰类、金鱼藻目和金粟兰目5大类群,它们之间的演化关系一直存在争议。
近年来,随着各类群代表物种的全基因组测序相继完成,其各自的进化历程均有了可靠的证据。刘建全团队在2020年首次报道了金鱼藻和芡实的基因组,证明了核心被子植物内部存在广泛的不完全谱系分选和杂交事件是导致树形冲突的主要原因。但是金粟兰目一直未有基因组报道,其演化历程以及整个核心被子植物的演化过程还有待深入分析。为此,该团队再次利用Nanopore、Illumina和Hi-C技术,构建了第一个金粟兰目植物(四川金粟兰)的高质量染色体级别基因组,并使用多种分析方法对上述问题进行了深入的阐述。
通过使用多种系统发育基因组学分析,研究团队进行串联树和溯祖树的构建,同时评估长枝吸引、物种选择和同源聚类方法等的影响,使用多套数据集合和多种分析方法,获得了高可信度的拓扑结构,即金粟兰目和木兰类具有最近的亲缘关系,且它们一起与金鱼藻目+双子叶植物构成姊妹关系,而单子叶植物是其他所有核心被子植物的姊妹枝。
同时,作者也发现了大量的基因树或叶绿体树与物种树不一致的情况,因此着重评估了不完全谱系分选(ILS)和杂交事件对此冲突的贡献。
此外,本研究还鉴定了四川金粟兰独有的一次WGD事件,同时5大核心被子植物分枝的加倍事件都不共享;鉴定了花发育相关的基因家族,解析了其特有花器官的可能形成原因;鉴定了萜类合成和木质部形成相关的基因家族,为今后研究其简单木质部形成和萜类物种合成通路演化提供了基础。
该研究报道了高质量的四川金粟兰基因组,填补了核心被子植物金粟兰目的基因组信息,并通过多种分析策略和方法,深入揭示了核心被子植物间的复杂演化历程。该成果对于早期被子植物的起源、辐射进化以及适应性演化提供数据支撑和理论基础。
来源:科技日报
上半年郑州市博文翰街新馆的一个沿黄九省文物展
黄河沿岸九个省区的流经顺序是青川甘宁蒙山陕豫鲁
看着看着发现一个很神奇的巧合:
风起洛阳的三位主演刚好来自黄河上中下游三个省份
黄轩生于兰州
王一博生于洛阳
宋茜生于青岛
顺序刚好是随着黄河顺流而下的
(黄河到了下游成为地上河,因此下游很多地方只是黄河流经的区域而不是黄河流域)
感觉风起洛阳的播出也会有间接对黄河流域生态保护和高质量发展有所助力
各个省区的展板写得很有意思
我们看看谁家拿不出一句唐诗[求饶]
黄河沿岸九个省区的流经顺序是青川甘宁蒙山陕豫鲁
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黄轩生于兰州
王一博生于洛阳
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(黄河到了下游成为地上河,因此下游很多地方只是黄河流经的区域而不是黄河流域)
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#伯远xevier[超话]# #into1伯远 正统唱跳ace#
好了!终于把18年玛丽黛佳的商演都搬完到小破站了!一共8个视频,弄成了视频列表,喜欢考古的朋友们可以看评论区!场次分别为:
2018-04-21 西安第一天
2018-04-22 西安 第二天
2018-06-02 山西原平
2018-07-15 兰州
2018-09-23 广州
2018-09-28 哈尔滨
2018-10-01 克拉玛依
2018-10-07 吉林市
然后一些观看推荐:
喜欢舞台的直接看第二场西安,兰州,还有哈尔滨就可以了。这三场相对来说,镜头比较稳定,也不算卡,音质也算听的过去。动图1-3就是来自第二场西安,动图4来自兰州。
喜欢听伯远采访,讲心灵鸡汤的朋友们也可以去看第一场西安和山西原平两场。画质比较高糊但也算听的过去。而且玩的游戏也其实不错,可以了解一下我们汤伯远对化妆品的了解[doge]
其他三场,广州,克拉玛依,还有吉林市基本都是卡成PPT,所以不看也无所谓,除非你像我,喜欢追求观看完整。
最后,其实还有一场的,19年的锦州。但那场直播的有效片段连两分钟都不够,所以就打算不搬了。想要看的朋友们可以直接去一直播 (指路看评论区)
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2018-04-21 西安第一天
2018-04-22 西安 第二天
2018-06-02 山西原平
2018-07-15 兰州
2018-09-23 广州
2018-09-28 哈尔滨
2018-10-01 克拉玛依
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