【AJHG | 周楹等开发人群基因组重组率估计的新方法】基因组重组率在人类基因组的区域之间差异很大。大量研究表明,重组热点的位置是由PRDM9及其结合基序(binding motif)确定的,但是,在下游遗传学分析中构建种群重组图谱有重要意义。
近日,华盛顿大学Sharon Browning教授和其研究团队在 The American Journal of Human genetics杂志上发表文章。在这项研究中,他们开发了一种新的方法IBDrecomb,用于估算全基因组群体的重组率。IBDrecomb是基于IBD的重组估计,它使用同祖片段(identity-by-descent ,IBD)的端点来估计覆盖目标基因组的等大小窗口中的重组率。通过仔细选择用于估计的IBD片段,每个窗口的重组率与该窗口中IBD端点的数量成正比。该方法的一个潜在的缺陷是对于IBD检测高度依赖。目前已有的方法很难的估计IBD片段的准确边界,这会引入估计偏差并降低估计精度。然而,他们的模拟数据和实际数据估计都表明,他们的方法与其他方法具有类似的表现。除了发布算法程序以外,他们还发布了非洲裔美国人(African American)和欧裔美国人(EuropeanAmerican)的重组图谱。
https://t.cn/A6y4fSmL
近日,华盛顿大学Sharon Browning教授和其研究团队在 The American Journal of Human genetics杂志上发表文章。在这项研究中,他们开发了一种新的方法IBDrecomb,用于估算全基因组群体的重组率。IBDrecomb是基于IBD的重组估计,它使用同祖片段(identity-by-descent ,IBD)的端点来估计覆盖目标基因组的等大小窗口中的重组率。通过仔细选择用于估计的IBD片段,每个窗口的重组率与该窗口中IBD端点的数量成正比。该方法的一个潜在的缺陷是对于IBD检测高度依赖。目前已有的方法很难的估计IBD片段的准确边界,这会引入估计偏差并降低估计精度。然而,他们的模拟数据和实际数据估计都表明,他们的方法与其他方法具有类似的表现。除了发布算法程序以外,他们还发布了非洲裔美国人(African American)和欧裔美国人(EuropeanAmerican)的重组图谱。
https://t.cn/A6y4fSmL
LR写了两个月,Tutor都烦了但还是耐心指导我。如果还在兰卡估计每次跑着去见她并且要买好多东西谢谢她,Monika真的太好了太好了太好了。
In this way 我又有努力读书的motif,真好。有目标的时候就把事情都安排得整整有条并努力完成,感觉太棒,but这份决心不知道能维系多久呢。Anyway热乎的时候趁热打铁8⃣️。明天就可以写outline和main chapter了!
In this way 我又有努力读书的motif,真好。有目标的时候就把事情都安排得整整有条并努力完成,感觉太棒,but这份决心不知道能维系多久呢。Anyway热乎的时候趁热打铁8⃣️。明天就可以写outline和main chapter了!
|近日爱用物
▪️MOTIF时空之味
香薰柜又有新成员了
小众又高级,名字也hin特别
【晚餐后的自由交谈与沉默时刻】
前调:紫罗兰,鼠尾草,香柠檬
中调:广藿香,老鹤草,天葵
后调:檀香木,琥珀,麝香
▪️福光屋 酵母急救精华
好友推荐的日版的“小棕瓶”
最近熬夜总用它,提亮肤色抵抗暗沉
质地清透吸收快~已经囤了第二瓶了
▪️syrene 瑟如韵
之前用了水乳,这次又入了他家的海洋睡眠面膜
小何不太喜欢敷面膜睡觉
每次都是厚敷半小时洗下去
用完皮肤嘟嘟的,像喝了水一样
▪️超级种子 雪松温和洗发水
实力表白包装,仪式感满满不舍得打开
是年轻人的有机个护品牌
个人头皮比较敏感,对洗发水的选择hin谨慎
用了这一瓶发根清爽蓬松,而且不干
不用护发素也柔顺~
#爱用物[超话]#
今日分享,感谢观看
▪️MOTIF时空之味
香薰柜又有新成员了
小众又高级,名字也hin特别
【晚餐后的自由交谈与沉默时刻】
前调:紫罗兰,鼠尾草,香柠檬
中调:广藿香,老鹤草,天葵
后调:檀香木,琥珀,麝香
▪️福光屋 酵母急救精华
好友推荐的日版的“小棕瓶”
最近熬夜总用它,提亮肤色抵抗暗沉
质地清透吸收快~已经囤了第二瓶了
▪️syrene 瑟如韵
之前用了水乳,这次又入了他家的海洋睡眠面膜
小何不太喜欢敷面膜睡觉
每次都是厚敷半小时洗下去
用完皮肤嘟嘟的,像喝了水一样
▪️超级种子 雪松温和洗发水
实力表白包装,仪式感满满不舍得打开
是年轻人的有机个护品牌
个人头皮比较敏感,对洗发水的选择hin谨慎
用了这一瓶发根清爽蓬松,而且不干
不用护发素也柔顺~
#爱用物[超话]#
今日分享,感谢观看
✋热门推荐