#北大科研#【单细胞转录组数据研究整合新进展！】日前，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、北京大学生命科学学院生物信息中心（CBI）、蛋白质与植物基因研究国家重点实验室的高歌课题组，在期刊Nature Communications上发表了生物信息学论文，论文中，作者建立了一个涵盖2,989,582个单细胞、8个物种、27个不同的组织器官的数据库，称为Animal Cell Atlas (ACA)。同时，该课题还提供了在线检索平台和Python软件包Cell BLAST，为有效利用现有数据进行细胞注释和跨数据集研究提供了新的工具和资源。
#北大科研#【单细胞转录组数据研究整合新进展！】日前，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、北京大学生命科学学院生物信息中心（CBI）、蛋白质与植物基因研究国家重点实验室的高歌课题组，在期刊Nature Communications上发表了生物信息学论文，论文中，作者建立了一个涵盖2,989,582个单细胞、8个物种、27个不同的组织器官的数据库，称为Animal Cell Atlas (ACA)。同时，该课题还提供了在线检索平台和Python软件包Cell BLAST，为有效利用现有数据进行细胞注释和跨数据集研究提供了新的工具和资源。
【Nature Commun.｜新工具！北京大学研究团队开发单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库】作为细胞异质性研究的重要工具，近年来单细胞转录组测序技术蓬勃发展，并积累了大量研究数据。然而，精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战：一、数据集之间的批次效应（batch effect）会显著影响细胞检索的可靠性；二、目前缺少跨物种和平台、具有高质量注释的单细胞转录组数据库。
日前，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、北京大学生命科学学院生物信息中心（CBI）、蛋白质与植物基因研究国家重点实验室高歌课题组在Nature Communications上发表生物信息学论文。该课题提供了在线检索平台，用户可以直接上传待注释的单细胞转录组数据，用ACA中的参考数据集进行细胞检索和自动注释；同时也提供了Python软件包Cell BLAST ，用户可以使用软件包在自定义的参考数据集上进行模型训练、检索和定制化分析。
https://t.cn/A6yoGnUn
日前，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、北京大学生命科学学院生物信息中心（CBI）、蛋白质与植物基因研究国家重点实验室高歌课题组在Nature Communications上发表生物信息学论文。该课题提供了在线检索平台，用户可以直接上传待注释的单细胞转录组数据，用ACA中的参考数据集进行细胞检索和自动注释；同时也提供了Python软件包Cell BLAST ，用户可以使用软件包在自定义的参考数据集上进行模型训练、检索和定制化分析。
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