颜宁回应了网传被Alphafold降维打击失业被迫海归的说法,探讨了AlphaFold与结构生物学之间的关系。
颜宁说,AlphaFold属于蛋白质预测模型,专注于折叠,但对结构生物学来说,在折叠之外,有三大理解问题,AI无能为力。
1、理解蛋白质的动态变化。(Anton3电脑的分子模拟致力于模拟这种时域变化,但是做大的蛋白应该困难重重,而且很慢。relay对此有制药方面应用,这些应用的insight似乎还停留在比较直觉的地步,临床证据也不够强。)
2、理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用。
3、理解在细胞原位里的状态。(这个我没有懂是什么意思。)
目前上述领域缺乏足够数据对AI进行训练,因此模型无法对其提供正确预测。
一个典型的例子,就是去年颜宁团队发表了Cav2.2结构的成果。这是一种神经组织N型电压门控钙离子通道,与人体痛觉传导有关。解析其结构有助于了解通道调控机理,也为相关止痛药设计研发提供思路。
因为发表晚了一步,没有放到数据库给到AlphaFold训练。于是经由它预测出来的结构,就与实验结果严重不符。
最后,颜宁表示:“真正的研究者都乐于拥抱技术进步,善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。事实上,我期待AI越来越强大,如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现,那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。”$谷歌C(GOOG)$ $Schrodinger(SDGR)$ $Relay Therapeutics(RLAY)$
颜宁说,AlphaFold属于蛋白质预测模型,专注于折叠,但对结构生物学来说,在折叠之外,有三大理解问题,AI无能为力。
1、理解蛋白质的动态变化。(Anton3电脑的分子模拟致力于模拟这种时域变化,但是做大的蛋白应该困难重重,而且很慢。relay对此有制药方面应用,这些应用的insight似乎还停留在比较直觉的地步,临床证据也不够强。)
2、理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用。
3、理解在细胞原位里的状态。(这个我没有懂是什么意思。)
目前上述领域缺乏足够数据对AI进行训练,因此模型无法对其提供正确预测。
一个典型的例子,就是去年颜宁团队发表了Cav2.2结构的成果。这是一种神经组织N型电压门控钙离子通道,与人体痛觉传导有关。解析其结构有助于了解通道调控机理,也为相关止痛药设计研发提供思路。
因为发表晚了一步,没有放到数据库给到AlphaFold训练。于是经由它预测出来的结构,就与实验结果严重不符。
最后,颜宁表示:“真正的研究者都乐于拥抱技术进步,善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。事实上,我期待AI越来越强大,如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现,那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。”$谷歌C(GOOG)$ $Schrodinger(SDGR)$ $Relay Therapeutics(RLAY)$
日记一则:
阴天,最贴近重庆脾性的天气。可爱的漫画在这种防控状态下增添扑面而来的珍贵生气。巴黎评论这个主题适合我碎片看,慢看。把这些有厚度的,孤独的声音分留给每日一些。在树林散心的间隙中,趁被蚊子咬出包之前垫垫胃。有这些能触碰到的,性感丰盛的生命礼物,智性恋被骗得舒坦。
地球这个住所很好很好,以至于我不知道写画多少次才足够纪念关于它的一个小细胞。不谈制造与解决,光是先刹住车不丢弃,原本就拥有多少数不清的宝藏呀(铲子都挖累了)…
阴天,最贴近重庆脾性的天气。可爱的漫画在这种防控状态下增添扑面而来的珍贵生气。巴黎评论这个主题适合我碎片看,慢看。把这些有厚度的,孤独的声音分留给每日一些。在树林散心的间隙中,趁被蚊子咬出包之前垫垫胃。有这些能触碰到的,性感丰盛的生命礼物,智性恋被骗得舒坦。
地球这个住所很好很好,以至于我不知道写画多少次才足够纪念关于它的一个小细胞。不谈制造与解决,光是先刹住车不丢弃,原本就拥有多少数不清的宝藏呀(铲子都挖累了)…
“一念放下,万般自在”
人生,是一条漫长的旅程。每一步,都是修行。
活在这珍贵的人间,会有花开的喜悦,也有花落的伤感,花开花落总关情。
站在岁月的渡口,回首凝望。过往,是一道模糊的风景,远了淡了。
时光,是一个匆匆的过客,来了走了。感情,是一壶暖暖的茶,浓了淡了。缘分,是一阵轻盈的风,聚了散了。
看清,才能豁达。看淡,才能从容。看透,才是成熟。
看透一个人,一定是被伤害过。放下一段情,一定是哭泣过,绝望过。经历过,才会成长。
心若不动,风奈若何?
时间推着我们向前走,往事不必再回头。忘掉那些不愉快,人总要学会与自己和解。
原谅别人,也是在成全自己。放下过去,也是在成就未来。生活没有那么完美,但也没有那么糟糕。错过了昨夜的星辰,依然能看到今天晨曦升起的太阳。失去了一片绿地,依然能够在转角处,遇到半亩花田。
那些遗憾,总会以另一种方式来偿还。
余生不将就,以一颗明媚的心,饱满地生活。给生活一个微笑,少一点抱怨,多一份感恩。那些想要的美好,终会不约而至。
往后的人生,学会做减法,减少自己的欲望和执念,保持心灵的丰盈和富足。
闲看一溪云,静读一卷书,淡品一盏茶。醒时邀陪明月,醉时枕花而眠。
心平气和,更能感受自然万物的美。春天的千娇百媚,夏天的大雨滂沱,秋天的落叶纷飞,冬天的煮雪烹茶,都是生命的馈赠。静下来,慢下来,发现美,感受美,美就在身边。
哪怕什么都不想,静静地坐在窗边,望着辽远的天空发呆,彻底将自己放空。
凡事看淡一点,随缘自在。不必纠结那些得不到的和已失去的。得不到的,也许是机缘未到。已失去的,也许从未真正属于过你。不是自己的,强求也没有用。是自己的,兜兜转转还会再回来。
佛家有语曰:
“放下悭贪是布施,放下恶业是持戒,放下懈怠是精进,放下嗔恚是忍辱,放下散乱是禅定,放下愚痴是般若,放下虚伪是真诚,放下污染是清净,放下傲慢是平等,放下自私是慈悲。”
放下过往的云烟,向前走,就能看到柳暗花明的明天。不念过去,不畏将来。
回归自我,用善良做人生的底色,修得一颗云水禅心,淡看世事沧桑。
三毛曾说:“我来不及认真地年轻,待明白过来时,只能选择认真地老去 ”。岁月很长,不必慌张。忠于自己的内心,走好脚下的路。
笑看花落,坐看云起。人生最美的风景,是内心的淡定与从容。
路一程山水,度一段年华。
修一树菩提,织一锦烟霞。
人生,是一条漫长的旅程。每一步,都是修行。
活在这珍贵的人间,会有花开的喜悦,也有花落的伤感,花开花落总关情。
站在岁月的渡口,回首凝望。过往,是一道模糊的风景,远了淡了。
时光,是一个匆匆的过客,来了走了。感情,是一壶暖暖的茶,浓了淡了。缘分,是一阵轻盈的风,聚了散了。
看清,才能豁达。看淡,才能从容。看透,才是成熟。
看透一个人,一定是被伤害过。放下一段情,一定是哭泣过,绝望过。经历过,才会成长。
心若不动,风奈若何?
时间推着我们向前走,往事不必再回头。忘掉那些不愉快,人总要学会与自己和解。
原谅别人,也是在成全自己。放下过去,也是在成就未来。生活没有那么完美,但也没有那么糟糕。错过了昨夜的星辰,依然能看到今天晨曦升起的太阳。失去了一片绿地,依然能够在转角处,遇到半亩花田。
那些遗憾,总会以另一种方式来偿还。
余生不将就,以一颗明媚的心,饱满地生活。给生活一个微笑,少一点抱怨,多一份感恩。那些想要的美好,终会不约而至。
往后的人生,学会做减法,减少自己的欲望和执念,保持心灵的丰盈和富足。
闲看一溪云,静读一卷书,淡品一盏茶。醒时邀陪明月,醉时枕花而眠。
心平气和,更能感受自然万物的美。春天的千娇百媚,夏天的大雨滂沱,秋天的落叶纷飞,冬天的煮雪烹茶,都是生命的馈赠。静下来,慢下来,发现美,感受美,美就在身边。
哪怕什么都不想,静静地坐在窗边,望着辽远的天空发呆,彻底将自己放空。
凡事看淡一点,随缘自在。不必纠结那些得不到的和已失去的。得不到的,也许是机缘未到。已失去的,也许从未真正属于过你。不是自己的,强求也没有用。是自己的,兜兜转转还会再回来。
佛家有语曰:
“放下悭贪是布施,放下恶业是持戒,放下懈怠是精进,放下嗔恚是忍辱,放下散乱是禅定,放下愚痴是般若,放下虚伪是真诚,放下污染是清净,放下傲慢是平等,放下自私是慈悲。”
放下过往的云烟,向前走,就能看到柳暗花明的明天。不念过去,不畏将来。
回归自我,用善良做人生的底色,修得一颗云水禅心,淡看世事沧桑。
三毛曾说:“我来不及认真地年轻,待明白过来时,只能选择认真地老去 ”。岁月很长,不必慌张。忠于自己的内心,走好脚下的路。
笑看花落,坐看云起。人生最美的风景,是内心的淡定与从容。
路一程山水,度一段年华。
修一树菩提,织一锦烟霞。
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