【科研进展】詹祥江实验室揭示猎隼青藏高原适应的遗传机制：北极基因渗入与染色质调控
青藏高原，被称为“世界第三极”，与北极地区具有相似的极寒气候，栖息于两地的某些哺乳动物展现出相似的低温适应表型（例如厚重的毛发、庞大的体型等）。那么是否存在两极地物种间与低温适应相关的基因流动呢？除低温外，高原动物还面临着低氧、强紫外（UV）辐射等极端环境的生存挑战，过去人们对高原动物的适应性进化研究中，大多围绕低氧适应，而对低温、强UV环境的适应机制仍所知甚少。
2022年10月27日，中国科学院动物研究所詹祥江实验室在国际综合期刊Nature Communications 杂志在线发表了题为“Arctic introgression and chromatin regulation facilitated rapid Qinghai-Tibet Plateau colonization by an avian predator”（doi: 10.1038/s41467-022-34138-3）的研究论文。在该研究中，团队结合多组学分析和功能实验，首次发现了北极近缘物种对于青藏高原动物适应性进化的遗传贡献，并系统性地探讨了高原动物如何适应低温、低氧、强UV胁迫的遗传机制。
猎隼(Falco cherrug)，是青藏高原的代表性猛禽，广泛分布于欧亚大陆和北非的内陆草原和丘陵地区，在我国还分布于新疆、内蒙、东北等地区。而其近缘种矛隼（F. rusticolus）现在主要栖息于北极和亚北极地区的冻土苔原和森林苔原地带。该项研究主要基于三代测序技术，组装了染色体水平的猎隼基因组。并对源自欧亚大陆的三大主要繁殖地的30只猎隼个体，和欧亚北极地区的10只矛隼个体进行了种群基因组学研究。研究发现东部猎隼种群中超过20%的等位基因位点来源于矛隼渗入（Introgression）。对两者历史栖息地模拟发现，末次盛冰期（LGM）时期矛隼从北极向南迁移，在西伯利亚南部与猎隼发生杂交，有趣的是其婚配方式主要以雌性矛隼与雄性猎隼杂交为主。种群遗传学的结果揭示猎隼逐步扩散至青藏高原的可能路线是：1）约4.1（3.8-7.8）万年前，猎隼从中欧地区扩散到亚洲东部；2）LGM时期，东部猎隼种群与矛隼杂交；3）约1.0（0.8-1.2）万年前，猎隼种群从蒙古拓殖至青藏高原地区。这使得研究人员能够系统地研究猎隼在青藏高原快速的适应性进化过程。
低温适应方面，发现生活在寒冷地区的高原猎隼比西部猎隼体型更大，体重更重，这一现象符合贝格曼法则。在高原猎隼基因组中发现了两个相关的渗入基因：SCMH1和SCARB1。SCMH1内含子上的渗入片段具有更强的抑制效应，使基因表达下降，进而可能使其下游与身体发育相关的HOX基因表达上调，引起猎隼体型增大。此外，渗入型的SR-B1P121L（由SCARB1编码）氨基酸突变，有利于高原猎隼清除血液中更多的胆固醇，降低寒冷条件下脂质增加的负效应。由此可见，从北极近缘种中渗入的关键基因，有助于猎隼更好地栖息于青藏高原的低温环境。
低氧适应方面，利用基因组、三维基因组和转录组分析，发现高原猎隼基因组中一段受选择最强的区域（500 Kb），折叠成一个拓扑结构域（TAD），使得该区段内的调控元件与血红蛋白基因间的互作增强，促进血红蛋白表达量显著升高，响应低氧压力。
强UV适应方面，通过比较羽毛的反射光谱发现，高原猎隼呈现更深的羽色。基因组上与色素沉积相关的基因ASIP的一段内含子区受到正选择。高原型片段的增强效应减弱，因而减少了ASIP基因的表达，促进真黑色素的合成，这可能减少了UV对高原猎隼的损伤。
该研究聚焦于高原动物适应极端环境的遗传机制，组织多国科学家联合攻关，利用基因组学、表观基因组学和功能基因组学技术，阐明了猎隼快速拓殖青藏高原的过程，发现了由北极姊妹种矛隼渗入的2个低温适应关键基因，并揭示了非编码区突变在低氧、强UV适应相关基因表达调控中的重要作用，为动物适应高原极端生境提供了新的见解。该研究由中国科学院动物研究所主导，蒙古野生动物科学与保护中心、斯洛伐克猛禽保护中心、俄罗斯科学院乌拉尔分院等多个国家的单位合作完成，并得到三江源国家公园的大力支持。动物研究所博士研究生胡莉、龙娟、林依为论文共同第一作者，詹祥江研究员和潘胜凯助理研究员为共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、中国科学院战略性先导科技专项、第三次新疆综合科学考察研究和第二次青藏高原综合科学考察研究等项目的支持。
文章链接: https://t.cn/A6oHRy1s
阅读原文：https://t.cn/A6oHRyBv
青藏高原，被称为“世界第三极”，与北极地区具有相似的极寒气候，栖息于两地的某些哺乳动物展现出相似的低温适应表型（例如厚重的毛发、庞大的体型等）。那么是否存在两极地物种间与低温适应相关的基因流动呢？除低温外，高原动物还面临着低氧、强紫外（UV）辐射等极端环境的生存挑战，过去人们对高原动物的适应性进化研究中，大多围绕低氧适应，而对低温、强UV环境的适应机制仍所知甚少。
2022年10月27日，中国科学院动物研究所詹祥江实验室在国际综合期刊Nature Communications 杂志在线发表了题为“Arctic introgression and chromatin regulation facilitated rapid Qinghai-Tibet Plateau colonization by an avian predator”（doi: 10.1038/s41467-022-34138-3）的研究论文。在该研究中，团队结合多组学分析和功能实验，首次发现了北极近缘物种对于青藏高原动物适应性进化的遗传贡献，并系统性地探讨了高原动物如何适应低温、低氧、强UV胁迫的遗传机制。
猎隼(Falco cherrug)，是青藏高原的代表性猛禽，广泛分布于欧亚大陆和北非的内陆草原和丘陵地区，在我国还分布于新疆、内蒙、东北等地区。而其近缘种矛隼（F. rusticolus）现在主要栖息于北极和亚北极地区的冻土苔原和森林苔原地带。该项研究主要基于三代测序技术，组装了染色体水平的猎隼基因组。并对源自欧亚大陆的三大主要繁殖地的30只猎隼个体，和欧亚北极地区的10只矛隼个体进行了种群基因组学研究。研究发现东部猎隼种群中超过20%的等位基因位点来源于矛隼渗入（Introgression）。对两者历史栖息地模拟发现，末次盛冰期（LGM）时期矛隼从北极向南迁移，在西伯利亚南部与猎隼发生杂交，有趣的是其婚配方式主要以雌性矛隼与雄性猎隼杂交为主。种群遗传学的结果揭示猎隼逐步扩散至青藏高原的可能路线是：1）约4.1（3.8-7.8）万年前，猎隼从中欧地区扩散到亚洲东部；2）LGM时期，东部猎隼种群与矛隼杂交；3）约1.0（0.8-1.2）万年前，猎隼种群从蒙古拓殖至青藏高原地区。这使得研究人员能够系统地研究猎隼在青藏高原快速的适应性进化过程。
低温适应方面，发现生活在寒冷地区的高原猎隼比西部猎隼体型更大，体重更重，这一现象符合贝格曼法则。在高原猎隼基因组中发现了两个相关的渗入基因：SCMH1和SCARB1。SCMH1内含子上的渗入片段具有更强的抑制效应，使基因表达下降，进而可能使其下游与身体发育相关的HOX基因表达上调，引起猎隼体型增大。此外，渗入型的SR-B1P121L（由SCARB1编码）氨基酸突变，有利于高原猎隼清除血液中更多的胆固醇，降低寒冷条件下脂质增加的负效应。由此可见，从北极近缘种中渗入的关键基因，有助于猎隼更好地栖息于青藏高原的低温环境。
低氧适应方面，利用基因组、三维基因组和转录组分析，发现高原猎隼基因组中一段受选择最强的区域（500 Kb），折叠成一个拓扑结构域（TAD），使得该区段内的调控元件与血红蛋白基因间的互作增强，促进血红蛋白表达量显著升高，响应低氧压力。
强UV适应方面，通过比较羽毛的反射光谱发现，高原猎隼呈现更深的羽色。基因组上与色素沉积相关的基因ASIP的一段内含子区受到正选择。高原型片段的增强效应减弱，因而减少了ASIP基因的表达，促进真黑色素的合成，这可能减少了UV对高原猎隼的损伤。
该研究聚焦于高原动物适应极端环境的遗传机制，组织多国科学家联合攻关，利用基因组学、表观基因组学和功能基因组学技术，阐明了猎隼快速拓殖青藏高原的过程，发现了由北极姊妹种矛隼渗入的2个低温适应关键基因，并揭示了非编码区突变在低氧、强UV适应相关基因表达调控中的重要作用，为动物适应高原极端生境提供了新的见解。该研究由中国科学院动物研究所主导，蒙古野生动物科学与保护中心、斯洛伐克猛禽保护中心、俄罗斯科学院乌拉尔分院等多个国家的单位合作完成，并得到三江源国家公园的大力支持。动物研究所博士研究生胡莉、龙娟、林依为论文共同第一作者，詹祥江研究员和潘胜凯助理研究员为共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、中国科学院战略性先导科技专项、第三次新疆综合科学考察研究和第二次青藏高原综合科学考察研究等项目的支持。
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杨宁金刚经讲义：金刚经讲义回顾总结，第二部分。金刚经说了什么——
佛还用自己昔日修忍辱行的事例来阐述以上观点。佛说自己昔日做忍辱仙人五百世，并且在某一世“修忍辱行”，被歌利王割截身体，都安住在“一切相虚妄”的见地上，无我相、人相、无可忍的事相，不起嗔念，最后才能在“忍辱行”中见到空性，最终圆满佛果。
佛说到此总结说：“善男子、善女人，发心求无上正等正觉的佛果，应‘离一切相而发心’，因诸相虚妄，离一切相便无所求、无所得，这是真正的出离心，真正的菩萨发心。”虽知一切相虚妄，实无众生可度，但每一位菩萨要发心为利益一切众生而行布施、修忍辱等，这是修证方法，回归如来果位 “破我执”的需要，而且从本质上，利益众生就是利益自己。利益众生才能功德圆满，成就佛果。
佛又举例说，如果菩萨住相修行布施，我相、所求心、人相，都会形成修行的障碍，这些障碍使人的心就像进入暗处，无法见到光明。所有的相，小到一粒微尘，轻如一片羽毛，只要你以为它实有，并在心中执着、牵挂，那粒微尘、羽毛就会遮住你的眼睛，使你一叶障目不见森林，就会充满你的全部身心世界，使你如困囚笼，如负重压，不能回归如来自在之境。
佛还说，这样的见地，乐小法的人听不进去，因为“乐小法”者只求一点神通、神变之术，求此生平安健康、宁静快乐，求此生长生不老、生活得安逸幸福。这样的人要使他离所有相，接受“一切相虚妄”的见地而去行布施、持戒、忍辱等菩萨行，暂时舍离人间的荣华富贵，他是无法接受的。因他有我见、人见、众生见、寿者见。而在佛的眼中，这一生即使寿长千岁，也只是刹那弹指间。
佛在说以上见地时，告诉弟子们，如果有人能懂得我说的一切而去修行，功德、果报之大不可思议。因这样做可以获得从轮回中解脱，可以成佛，获大自在，当然功德果报不可思议。
以上所说基本上是佛在指出弟子们刚发心容易在见地上出现的错误，而且易执着的相，在经文中属于一个部分，即我们现在版本的前十七品。
《金刚经》在第十七品之后，我们看到须菩提向佛重新提出了问题，即发心求取佛果的善男子、善女人，应该怎样安住在佛的知见道上？怎样降伏内心的烦恼、妄念？而经文中佛的回答角度有所不同。因佛在前面十七品中已将弟子们心中当下执着的相全破了一遍，现在开始谈破相后的如来果位境界了，意在令弟子返观内照、如如不动，安立于诸法无我的角度，如果这样，弟子们与佛已不二了。我们假名弟子们应安立的这个境界叫“如来真空之境”，我们看看佛是怎样说这个境界的。
一、“如来真空之境”中没有发心者。因无我、无人、无众生，那谁在发心求无上正等正觉？在此，如来用自己在燃灯佛处来举例，说我昔日在燃灯佛所修行，正因为了悟了并没有一个发心者，也无一个得果位者，所以燃灯佛才为我授记成佛。并总结说，如来者，诸法如义。即说万法都是如此，都无我、无自性，本性都是如来。
二、“如来真空之境”中无菩萨。没有一个东西可以称名为菩萨，无大如须弥山的功德之身相，也无庄严佛土这回事。
三、“如来真空之境”中有五眼六神通，但肉眼、天眼、慧眼、法眼、佛眼，所见都是虚妄，所有的眼并无生处，所见一切都自性空。
四、如来有无量化身，随众生得度的缘示现在每一道，但“真空之境”中无示现之心。在人道示现，如来也说沙子是沙，也托钵化斋，没有与众不同。
五、“如来真空之境”中无过去心、现在心、未来心、无时空、无“时空”的流逝、变异或不动，是无生。
六、“如来真空之境”中无福德。因此菩萨道上所积的福德能无量无边，圆满遍一切处。
七、“如来真空之境”中无三十二相八十随形好。
八、“如来真空之境”中无宇宙一切相，无三千大千世界。
九、“如来真空之境”中不生一念，无人说法，无人度众生。
十、“如来真空之境”中无众生，无凡夫。
十一、“如来真空之境”无所得心。
十二、“如来真空之境”诸法平等（因诸法性空）。
十三、“如来真空之境”如来也说有我，但只是假名。
十四、“如来真空之境”无所观者与能观者。
十五、“如来真空之境”于宇宙万法不说断灭，即不是抛弃或否定一切。
十六、“如来真空之境”中如来不来不去，不生不灭。
十七、“如来真空之境”中无缘起，也无性空。
十八、“如来真空之境”无任何分别知见。
十九、“如来真空之境”万法平等，不生法相。
佛还用自己昔日修忍辱行的事例来阐述以上观点。佛说自己昔日做忍辱仙人五百世，并且在某一世“修忍辱行”，被歌利王割截身体，都安住在“一切相虚妄”的见地上，无我相、人相、无可忍的事相，不起嗔念，最后才能在“忍辱行”中见到空性，最终圆满佛果。
佛说到此总结说：“善男子、善女人，发心求无上正等正觉的佛果，应‘离一切相而发心’，因诸相虚妄，离一切相便无所求、无所得，这是真正的出离心，真正的菩萨发心。”虽知一切相虚妄，实无众生可度，但每一位菩萨要发心为利益一切众生而行布施、修忍辱等，这是修证方法，回归如来果位 “破我执”的需要，而且从本质上，利益众生就是利益自己。利益众生才能功德圆满，成就佛果。
佛又举例说，如果菩萨住相修行布施，我相、所求心、人相，都会形成修行的障碍，这些障碍使人的心就像进入暗处，无法见到光明。所有的相，小到一粒微尘，轻如一片羽毛，只要你以为它实有，并在心中执着、牵挂，那粒微尘、羽毛就会遮住你的眼睛，使你一叶障目不见森林，就会充满你的全部身心世界，使你如困囚笼，如负重压，不能回归如来自在之境。
佛还说，这样的见地，乐小法的人听不进去，因为“乐小法”者只求一点神通、神变之术，求此生平安健康、宁静快乐，求此生长生不老、生活得安逸幸福。这样的人要使他离所有相，接受“一切相虚妄”的见地而去行布施、持戒、忍辱等菩萨行，暂时舍离人间的荣华富贵，他是无法接受的。因他有我见、人见、众生见、寿者见。而在佛的眼中，这一生即使寿长千岁，也只是刹那弹指间。
佛在说以上见地时，告诉弟子们，如果有人能懂得我说的一切而去修行，功德、果报之大不可思议。因这样做可以获得从轮回中解脱，可以成佛，获大自在，当然功德果报不可思议。
以上所说基本上是佛在指出弟子们刚发心容易在见地上出现的错误，而且易执着的相，在经文中属于一个部分，即我们现在版本的前十七品。
《金刚经》在第十七品之后，我们看到须菩提向佛重新提出了问题，即发心求取佛果的善男子、善女人，应该怎样安住在佛的知见道上？怎样降伏内心的烦恼、妄念？而经文中佛的回答角度有所不同。因佛在前面十七品中已将弟子们心中当下执着的相全破了一遍，现在开始谈破相后的如来果位境界了，意在令弟子返观内照、如如不动，安立于诸法无我的角度，如果这样，弟子们与佛已不二了。我们假名弟子们应安立的这个境界叫“如来真空之境”，我们看看佛是怎样说这个境界的。
一、“如来真空之境”中没有发心者。因无我、无人、无众生，那谁在发心求无上正等正觉？在此，如来用自己在燃灯佛处来举例，说我昔日在燃灯佛所修行，正因为了悟了并没有一个发心者，也无一个得果位者，所以燃灯佛才为我授记成佛。并总结说，如来者，诸法如义。即说万法都是如此，都无我、无自性，本性都是如来。
二、“如来真空之境”中无菩萨。没有一个东西可以称名为菩萨，无大如须弥山的功德之身相，也无庄严佛土这回事。
三、“如来真空之境”中有五眼六神通，但肉眼、天眼、慧眼、法眼、佛眼，所见都是虚妄，所有的眼并无生处，所见一切都自性空。
四、如来有无量化身，随众生得度的缘示现在每一道，但“真空之境”中无示现之心。在人道示现，如来也说沙子是沙，也托钵化斋，没有与众不同。
五、“如来真空之境”中无过去心、现在心、未来心、无时空、无“时空”的流逝、变异或不动，是无生。
六、“如来真空之境”中无福德。因此菩萨道上所积的福德能无量无边，圆满遍一切处。
七、“如来真空之境”中无三十二相八十随形好。
八、“如来真空之境”中无宇宙一切相，无三千大千世界。
九、“如来真空之境”中不生一念，无人说法，无人度众生。
十、“如来真空之境”中无众生，无凡夫。
十一、“如来真空之境”无所得心。
十二、“如来真空之境”诸法平等（因诸法性空）。
十三、“如来真空之境”如来也说有我，但只是假名。
十四、“如来真空之境”无所观者与能观者。
十五、“如来真空之境”于宇宙万法不说断灭，即不是抛弃或否定一切。
十六、“如来真空之境”中如来不来不去，不生不灭。
十七、“如来真空之境”中无缘起，也无性空。
十八、“如来真空之境”无任何分别知见。
十九、“如来真空之境”万法平等，不生法相。
【投稿】凌晨两点你接起她的视频，她看起来不太高兴，甚至还有点狼狈，因为她的头发上嵌着几根不知道哪儿来的羽毛，如果不是穿着睡衣，你会以为她刚和大鹅之类的动物打架去了。结果她闷闷的说，她梦到你在她枕头里藏了一枚戒指，她从梦中惊醒后就把枕头给拆了。你正准备夸她的动手能力，她突然把视频挂了，发信息说讨厌你。
你发现她真的有在生你气，因为你确实没有在她枕头里藏戒指，虽然是个梦，但你还是打过去给她道歉了。
毕竟，你真的有藏一枚戒指在她某件黑色大衣的口袋里，已经默默等了一整个秋季，不知道这个冬季能不能给她一个惊喜？
你发现她真的有在生你气，因为你确实没有在她枕头里藏戒指，虽然是个梦，但你还是打过去给她道歉了。
毕竟，你真的有藏一枚戒指在她某件黑色大衣的口袋里，已经默默等了一整个秋季，不知道这个冬季能不能给她一个惊喜？
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