【科研进展】动物研究所合作团队揭示小鼠行为和神经基因的驯化机制
实验小鼠是生物学和医学研究中最常用的哺乳动物模型之一,由野生小家鼠长期驯化而来。实验小鼠和野生小家鼠在体型、生理及行为方面存在很大差异。特别是,实验室驯化下小鼠攻击行为减弱、温顺行为增强。已知实验小鼠的基因组来自Mus musculus domesticus (M. m. domesticus)、M. m. musculus、和M. m. castaneus三个小家鼠亚种,其中,M. m. domesticus和M. m. musculus在其欧洲大陆分布区相邻区域存在杂交带。由于野生小家鼠基因组数据缺乏,小鼠驯化的遗传学机制仍未完全阐明。
中国科学院动物研究所张知彬研究员领导的科研合作团队通过多年努力,收集并测定了来自我国和欧洲的11份M. m. domesticus、9份M. m. musculus、和16份M. m. castaneus野生小家鼠DNA样品及基因组序列,并与已知的36个经典近交系进行了联合分析,发现经典近交系小鼠基因组聚为独立一支,与野生小家鼠完全分开,与M. m. domesticus最为相近(图1)。结果说明,经典近交系小鼠基因组是以M. m. domesticus为主的嵌合基因组;实验室人工选择下,其遗传结构发生了很大分化。
该研究使用了核苷酸多样性分析、Fst、XP-CLR共3种方法,筛选出339个驯化基因(图2)。GO分析结果显示,驯化选择基因与脑功能和行为密切相关。通过比对NCBI小鼠基因表达数据库,发现驯化选择基因中有近40%在脑内高表达。比对MGI数据库中有关敲除/基因突变小鼠记录,发现筛选的339个驯化基因中有245个(占51%)在敲除小鼠中具有神经系统和行为的改变。RNA-Seq检测发现339个驯化基因差异表达基因比例在海马和额叶中更高。差异表达基因的GO分析表明相关基因富集于神经系统功能和行为方面。结果说明行为和神经系统的改变是实验室小鼠驯化最显著的特征。
利用基因编辑和点突变小鼠模型,发现Astn2基因内含子中的rs27900929位点突变后,小鼠更倾向于躲避实验人员手的主动接触,也更易啃咬实验人员的手(图3)。进一步分析发现,多态性位点rs27900929改变导致Astn2基因2种不同剪切体比例的改变,这一改变与上述小鼠的驯化行为变化存在关联(图3)。值得注意的是,Astn2基因与人类自闭症有关。
该研究对于今后利用小鼠模型开展生物学和医学研究及开展野生小家鼠种群的行为、神经、生理和生态调控机制奠定了基础。
本研究于2022年9月26日以“Whole-genome sequencing reveals the genetic mechanisms of domestication in classical inbred mice”为题发表在Genome Biology上。中国科学院动物研究所刘明博士、中国科学院北京基因组研究所余彩霞博士、北京诺禾致源科技股份有限公司张智超、中国医学科学院医学实验动物研究所宋铭晶博士为共同第一作者,中国科学院动物研究所张知彬研究员和中国科学院北京基因组研究所张兵研究员为共同通讯作者。来自中国科学院动物研究所农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室、国际动物学会、中国科学院动物研究所干细胞与生殖生物学国家重点实验室、中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)、北京诺禾致源科技股份有限公司、北京格致博雅生物科技有限公司、中国医学科学院医学实验动物研究所、捷克科学院脊椎动物研究所、德国园艺和森林植物保护研究所/流行病学和病原体诊断研究所、郑州大学生命科学学院、黑龙江省农业科学院植物保护研究所、华中师范大学生命科学学院、中国科学院亚热带农业研究所、中国科学院大学生物互作卓越创新中心、广东省农业科学院植物保护研究所、中国农业科学院植物保护研究所、美国佛罗里达州立大学心理学系的研究人员参与了该项研究。
该研究得到了中国科学院先导项目(XDB11050300,XDPB16)、国家自然科学基金重点项目(31330013)、中国科学院对外合作项目(152111KYSB20150023,152111KYSB20160089)、农业虫害鼠害综合治理国家重点实验室开放课题(Chinese IPM1615)以及中国科学院关键技术人才计划等基金、项目的支持。
全文链接:https://t.cn/A6ofLIHs
Liu M#, Yu C#, Zhang Z#, Song M#, Sun X, Piálek J, Jacob J, Lu J, Cong L, Zhang H, Wang Y, Li G, Feng Z, Du Z, Wang M, Wan X, Wang D, Wang YL, Li H, Wang Z, Zhang B*, Zhang Z*. Whole-genome sequencing reveals the genetic mechanisms of domestication in classical inbred mice. 2022. Genome Biology, 23: 203.
原文链接:https://t.cn/A6ofLIQv
实验小鼠是生物学和医学研究中最常用的哺乳动物模型之一,由野生小家鼠长期驯化而来。实验小鼠和野生小家鼠在体型、生理及行为方面存在很大差异。特别是,实验室驯化下小鼠攻击行为减弱、温顺行为增强。已知实验小鼠的基因组来自Mus musculus domesticus (M. m. domesticus)、M. m. musculus、和M. m. castaneus三个小家鼠亚种,其中,M. m. domesticus和M. m. musculus在其欧洲大陆分布区相邻区域存在杂交带。由于野生小家鼠基因组数据缺乏,小鼠驯化的遗传学机制仍未完全阐明。
中国科学院动物研究所张知彬研究员领导的科研合作团队通过多年努力,收集并测定了来自我国和欧洲的11份M. m. domesticus、9份M. m. musculus、和16份M. m. castaneus野生小家鼠DNA样品及基因组序列,并与已知的36个经典近交系进行了联合分析,发现经典近交系小鼠基因组聚为独立一支,与野生小家鼠完全分开,与M. m. domesticus最为相近(图1)。结果说明,经典近交系小鼠基因组是以M. m. domesticus为主的嵌合基因组;实验室人工选择下,其遗传结构发生了很大分化。
该研究使用了核苷酸多样性分析、Fst、XP-CLR共3种方法,筛选出339个驯化基因(图2)。GO分析结果显示,驯化选择基因与脑功能和行为密切相关。通过比对NCBI小鼠基因表达数据库,发现驯化选择基因中有近40%在脑内高表达。比对MGI数据库中有关敲除/基因突变小鼠记录,发现筛选的339个驯化基因中有245个(占51%)在敲除小鼠中具有神经系统和行为的改变。RNA-Seq检测发现339个驯化基因差异表达基因比例在海马和额叶中更高。差异表达基因的GO分析表明相关基因富集于神经系统功能和行为方面。结果说明行为和神经系统的改变是实验室小鼠驯化最显著的特征。
利用基因编辑和点突变小鼠模型,发现Astn2基因内含子中的rs27900929位点突变后,小鼠更倾向于躲避实验人员手的主动接触,也更易啃咬实验人员的手(图3)。进一步分析发现,多态性位点rs27900929改变导致Astn2基因2种不同剪切体比例的改变,这一改变与上述小鼠的驯化行为变化存在关联(图3)。值得注意的是,Astn2基因与人类自闭症有关。
该研究对于今后利用小鼠模型开展生物学和医学研究及开展野生小家鼠种群的行为、神经、生理和生态调控机制奠定了基础。
本研究于2022年9月26日以“Whole-genome sequencing reveals the genetic mechanisms of domestication in classical inbred mice”为题发表在Genome Biology上。中国科学院动物研究所刘明博士、中国科学院北京基因组研究所余彩霞博士、北京诺禾致源科技股份有限公司张智超、中国医学科学院医学实验动物研究所宋铭晶博士为共同第一作者,中国科学院动物研究所张知彬研究员和中国科学院北京基因组研究所张兵研究员为共同通讯作者。来自中国科学院动物研究所农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室、国际动物学会、中国科学院动物研究所干细胞与生殖生物学国家重点实验室、中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)、北京诺禾致源科技股份有限公司、北京格致博雅生物科技有限公司、中国医学科学院医学实验动物研究所、捷克科学院脊椎动物研究所、德国园艺和森林植物保护研究所/流行病学和病原体诊断研究所、郑州大学生命科学学院、黑龙江省农业科学院植物保护研究所、华中师范大学生命科学学院、中国科学院亚热带农业研究所、中国科学院大学生物互作卓越创新中心、广东省农业科学院植物保护研究所、中国农业科学院植物保护研究所、美国佛罗里达州立大学心理学系的研究人员参与了该项研究。
该研究得到了中国科学院先导项目(XDB11050300,XDPB16)、国家自然科学基金重点项目(31330013)、中国科学院对外合作项目(152111KYSB20150023,152111KYSB20160089)、农业虫害鼠害综合治理国家重点实验室开放课题(Chinese IPM1615)以及中国科学院关键技术人才计划等基金、项目的支持。
全文链接:https://t.cn/A6ofLIHs
Liu M#, Yu C#, Zhang Z#, Song M#, Sun X, Piálek J, Jacob J, Lu J, Cong L, Zhang H, Wang Y, Li G, Feng Z, Du Z, Wang M, Wan X, Wang D, Wang YL, Li H, Wang Z, Zhang B*, Zhang Z*. Whole-genome sequencing reveals the genetic mechanisms of domestication in classical inbred mice. 2022. Genome Biology, 23: 203.
原文链接:https://t.cn/A6ofLIQv
虽然数码02的剧场版只放出了前六分钟但……因为想骂所以我骂了[二哈]
大概因为它是承接lek的后作所以一开始我便带着负面情绪去看的缘故[二哈]
一开场就放波莱罗舞曲我立即看标题,没错啊是02片场啊,但这bgm一般情况下是01以及01相关剧场版用的吧,说句难听的这是01专用吧,怎么突然放02去了?哦如果说02剧场版也是01的相关作品的话,啊这……说也说得过去但哪里不太对[裂开]
然后画面一转出现空中悬浮的巨大数码蛋……行吧波莱罗都出来了,继续在02剧场版致敬01呗,啊不对,应该说这是在致敬当年的02剧场超恶魔兽的逆袭[求饶]
02众好路人啊,真的一副路人脸,特别大辅,怎么路人成这个样子,声音也很路人,要不是旁边有只V仔兽就……然后出场了几个曾在TV版世界环游出现过的俄国三人组、法国妹子、中国香港三兄弟……嗯,沃利斯肯定没戏份了,估计已经在lek透支了(。
嘉儿阿武和02四人放一起突然有股强烈违和感,肯定是因为tri.和lek里官方总让他们和02组分开的原因[白眼]
啊在电视里客串出场的太一看着头发稀疏了不少的样子,话说这不会是lek的三年后吧……
嘉儿外形直接梅诺亚化,我TM直接一个大无语,官方改造型有点新意行不?多看几眼甚至看出了素娜的模样。
光子郎成为研究数码兽的主要责任人这点还是没能和02TV结局对上诶……
嘉儿说她和太一联系时太一生气地让她不要在这种繁忙时刻找他。我……很好,02削01的战力和戏份无可厚非,但ooc,还是在别人的话里ooc这属实……[怒]
灰紫色头发的少年,剧场版新角色啊……估计就是海报里的那个小孩了,爬塔掉下去怎么不是向下掉而是向外掉呢,被风吹的吗?
飞虫兽好丑……明明TV版里是个帅哥……丑得我不想截图……
灰紫毛最后一句以我渣渣的听力水平不敢乱说还是等中文字幕上吧,似乎是要填被选召孩子的坑了?真是填坑才好,别填一个挖十个还崩人设毁设定就行(。然而它的前作是lek啊,不抱希望地观望。
咦02新剧版是继承lek的话那lek设定也继承了吧,亚古兽它们会在这一作回归?不对劲,亚古兽它们如果不是被01众特意怼爆lek设定、迎接回来的话感觉有点不太好。我个人不太喜欢亚古兽的回归是02打败boss后所得战利品中的附赠品。这里毕竟是02主场。但01众除了嘉儿阿武外又没人有数码兽,难办,除非走类似tv结局里被boss毁掉的徽章在01众身上再现的套路(。
又说起来lek是the last,02是the beginning,哈哈哈这莫名的嘲讽感[允悲]
大概因为它是承接lek的后作所以一开始我便带着负面情绪去看的缘故[二哈]
一开场就放波莱罗舞曲我立即看标题,没错啊是02片场啊,但这bgm一般情况下是01以及01相关剧场版用的吧,说句难听的这是01专用吧,怎么突然放02去了?哦如果说02剧场版也是01的相关作品的话,啊这……说也说得过去但哪里不太对[裂开]
然后画面一转出现空中悬浮的巨大数码蛋……行吧波莱罗都出来了,继续在02剧场版致敬01呗,啊不对,应该说这是在致敬当年的02剧场超恶魔兽的逆袭[求饶]
02众好路人啊,真的一副路人脸,特别大辅,怎么路人成这个样子,声音也很路人,要不是旁边有只V仔兽就……然后出场了几个曾在TV版世界环游出现过的俄国三人组、法国妹子、中国香港三兄弟……嗯,沃利斯肯定没戏份了,估计已经在lek透支了(。
嘉儿阿武和02四人放一起突然有股强烈违和感,肯定是因为tri.和lek里官方总让他们和02组分开的原因[白眼]
啊在电视里客串出场的太一看着头发稀疏了不少的样子,话说这不会是lek的三年后吧……
嘉儿外形直接梅诺亚化,我TM直接一个大无语,官方改造型有点新意行不?多看几眼甚至看出了素娜的模样。
光子郎成为研究数码兽的主要责任人这点还是没能和02TV结局对上诶……
嘉儿说她和太一联系时太一生气地让她不要在这种繁忙时刻找他。我……很好,02削01的战力和戏份无可厚非,但ooc,还是在别人的话里ooc这属实……[怒]
灰紫色头发的少年,剧场版新角色啊……估计就是海报里的那个小孩了,爬塔掉下去怎么不是向下掉而是向外掉呢,被风吹的吗?
飞虫兽好丑……明明TV版里是个帅哥……丑得我不想截图……
灰紫毛最后一句以我渣渣的听力水平不敢乱说还是等中文字幕上吧,似乎是要填被选召孩子的坑了?真是填坑才好,别填一个挖十个还崩人设毁设定就行(。然而它的前作是lek啊,不抱希望地观望。
咦02新剧版是继承lek的话那lek设定也继承了吧,亚古兽它们会在这一作回归?不对劲,亚古兽它们如果不是被01众特意怼爆lek设定、迎接回来的话感觉有点不太好。我个人不太喜欢亚古兽的回归是02打败boss后所得战利品中的附赠品。这里毕竟是02主场。但01众除了嘉儿阿武外又没人有数码兽,难办,除非走类似tv结局里被boss毁掉的徽章在01众身上再现的套路(。
又说起来lek是the last,02是the beginning,哈哈哈这莫名的嘲讽感[允悲]
#真题精读##每天进步一点点##跟Charles学英语#
[J] The absorption helps them to establish strong foundations for recollection, says Patihis, and the fantasy proneness means that they revisit those memories again and again in the coming weeks and months. Each time this initial memory trace is “replayed”, it becomes even stronger. In some ways, you probably go through that process after a big event like your wedding day — but the difference is that thanks to their other psychological tendencies, the HSAM subjects are doing it day in, day out, for the whole of their lives.
词汇:
foundation /faun'deiʃn/ n. 根据;基础
recollection /ˌrekəˈlekʃn/ n. 回忆;记忆
revisit /ˌriːˈvɪzɪt/ v. 再访;重游
initial /i'niʃl/ adj. 最初的;开始的
replay /ˈriːpleɪ/ v. 重新播放
参考译文:
派提西斯说,“投入”能帮助他们为回忆建立坚实基础,“幻想倾向”意味着他们在接下来的几周、几月里能不断重温这些记忆。这种最初的记忆每“重演”一次,就被记得更牢。在某种程度上,你可能会在一件大事发生后重温它的过程,比如你的婚礼,但不同的是,由于HSAM人群的其他心理倾向,他们会在人生中日复一日地重温。
[J] The absorption helps them to establish strong foundations for recollection, says Patihis, and the fantasy proneness means that they revisit those memories again and again in the coming weeks and months. Each time this initial memory trace is “replayed”, it becomes even stronger. In some ways, you probably go through that process after a big event like your wedding day — but the difference is that thanks to their other psychological tendencies, the HSAM subjects are doing it day in, day out, for the whole of their lives.
词汇:
foundation /faun'deiʃn/ n. 根据;基础
recollection /ˌrekəˈlekʃn/ n. 回忆;记忆
revisit /ˌriːˈvɪzɪt/ v. 再访;重游
initial /i'niʃl/ adj. 最初的;开始的
replay /ˈriːpleɪ/ v. 重新播放
参考译文:
派提西斯说,“投入”能帮助他们为回忆建立坚实基础,“幻想倾向”意味着他们在接下来的几周、几月里能不断重温这些记忆。这种最初的记忆每“重演”一次,就被记得更牢。在某种程度上,你可能会在一件大事发生后重温它的过程,比如你的婚礼,但不同的是,由于HSAM人群的其他心理倾向,他们会在人生中日复一日地重温。
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