#BioArt陪你科研每日分享[超话]##bioart分享# 祝大家青年节快乐～[冲刺][冲刺][冲刺]【NBT背靠背 | 李大力/刘明耀/伊成器、刘如谦分别开发基于腺嘌呤脱氨酶TadA-8e的高精度胞嘧啶碱基编辑系统】#基因编辑#
目前已知的人类遗传疾病约60%是由碱基突变引起的，因此开发高效精准且安全的单碱基编辑器对基础研究和人类遗传疾病的治疗具有极为重要的意义。哈佛大学David R. Liu团队分别通过将Cas9缺口酶（nickase）与APOBEC家族胞嘧啶脱氨酶以及通过分子进化得到的腺嘌呤脱氨酶TadA融合，开发出可实现C到T碱基转换的胞嘧啶碱基编辑器（Cytosine base editor, CBE）以及A到G碱基转换的腺嘌呤碱基编辑器（Adenine base editor, ABE）。这两类碱基编辑器能不依赖DNA双链断裂和同源重组修复机制，在分裂及非分裂细胞基因组DNA上实现高效的碱基转换。胞嘧啶脱氨酶催化C转变为U的过程通常伴随着尿嘧啶的切除，形成的无嘌呤无嘧啶位点最终导致潜在的C到G/A副产物的形成，因此在CBE的基础上，通过对APOBEC1的改造等策略开发了主要实现C到G碱基颠换的CGBEs。然而现有的CBEs/CGBEs均依赖于天然的胞嘧啶脱氨酶AID/APOBEC家族成员，由于胞嘧啶脱氨后会激活碱基切除修复通路，不可避免的会产生较高的indels副产物。更为重要的是现有的CBE会产生显著的不依赖于Cas9的DNA和RNA随机脱靶，而且较宽的编辑窗口引起难以避免的旁观者效应，在安全性等方面存在隐患。
2022年11月10日，华东师范大学李大力、刘明耀团队以及北京大学的伊成器课题组合作在Nature Biotechnology杂志上发表了题为Re-engineering the adenine deaminase TadA-8e for efficient and specific CRISPR-based cytosine base editing 的研究论文。该研究通过对腺嘌呤脱氨酶TadA-8e重新设计改造，创新性地构建了一系列不依赖天然胞嘧啶脱氨酶家族的“精准且安全”的新型胞嘧啶碱基编辑器—TadA-derived CGBE/CBEs (Td-CGBE/Td-CBEs)，其中Td-CGBE能高效精确地诱导C到G的转换，而进一步的分子进化获得了与BE4max活性相当但编辑窗口更窄的Td-CBEs系列。更为重要的是，消除了固有的腺嘌呤脱氨酶活性的新型CGBEs/CBEs，展现出非常低的indels事件。通过项目组前期开发最高灵敏度CBE脱靶检测技术Detect-seq，证明Td-CBEs相较于BE4max展现接近背景水平的更低的脱靶效应。
BioArt相关报道https://t.cn/A6Njq7FJ
文献原文https://t.cn/A6Njq7FM
https://t.cn/A6Njq7Fi
#bioart日历# 科研与艺术合一、集设计美学与日常实用为一身～特别感谢@华安生物 @寻因生物 @义翘神州科技 @Cytiva（思拓凡）对本次活动的赞助与支持！ 同时感谢@湖南美术出版社@湖南美术社收藏事业部 的联合推出！
目前已知的人类遗传疾病约60%是由碱基突变引起的，因此开发高效精准且安全的单碱基编辑器对基础研究和人类遗传疾病的治疗具有极为重要的意义。哈佛大学David R. Liu团队分别通过将Cas9缺口酶（nickase）与APOBEC家族胞嘧啶脱氨酶以及通过分子进化得到的腺嘌呤脱氨酶TadA融合，开发出可实现C到T碱基转换的胞嘧啶碱基编辑器（Cytosine base editor, CBE）以及A到G碱基转换的腺嘌呤碱基编辑器（Adenine base editor, ABE）。这两类碱基编辑器能不依赖DNA双链断裂和同源重组修复机制，在分裂及非分裂细胞基因组DNA上实现高效的碱基转换。胞嘧啶脱氨酶催化C转变为U的过程通常伴随着尿嘧啶的切除，形成的无嘌呤无嘧啶位点最终导致潜在的C到G/A副产物的形成，因此在CBE的基础上，通过对APOBEC1的改造等策略开发了主要实现C到G碱基颠换的CGBEs。然而现有的CBEs/CGBEs均依赖于天然的胞嘧啶脱氨酶AID/APOBEC家族成员，由于胞嘧啶脱氨后会激活碱基切除修复通路，不可避免的会产生较高的indels副产物。更为重要的是现有的CBE会产生显著的不依赖于Cas9的DNA和RNA随机脱靶，而且较宽的编辑窗口引起难以避免的旁观者效应，在安全性等方面存在隐患。
2022年11月10日，华东师范大学李大力、刘明耀团队以及北京大学的伊成器课题组合作在Nature Biotechnology杂志上发表了题为Re-engineering the adenine deaminase TadA-8e for efficient and specific CRISPR-based cytosine base editing 的研究论文。该研究通过对腺嘌呤脱氨酶TadA-8e重新设计改造，创新性地构建了一系列不依赖天然胞嘧啶脱氨酶家族的“精准且安全”的新型胞嘧啶碱基编辑器—TadA-derived CGBE/CBEs (Td-CGBE/Td-CBEs)，其中Td-CGBE能高效精确地诱导C到G的转换，而进一步的分子进化获得了与BE4max活性相当但编辑窗口更窄的Td-CBEs系列。更为重要的是，消除了固有的腺嘌呤脱氨酶活性的新型CGBEs/CBEs，展现出非常低的indels事件。通过项目组前期开发最高灵敏度CBE脱靶检测技术Detect-seq，证明Td-CBEs相较于BE4max展现接近背景水平的更低的脱靶效应。
BioArt相关报道https://t.cn/A6Njq7FJ
文献原文https://t.cn/A6Njq7FM
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#bioart日历# 科研与艺术合一、集设计美学与日常实用为一身～特别感谢@华安生物 @寻因生物 @义翘神州科技 @Cytiva（思拓凡）对本次活动的赞助与支持！ 同时感谢@湖南美术出版社@湖南美术社收藏事业部 的联合推出！
《监考完3120 Final的Troy和我：Stupid!!!》
#给了整整八页的公式表
#就差把课本给他们印出来了
#有学生举手问我要怎么代数
#甚至不管他代哪一个对结果都没影响
#还有学生问我用哪个公式
#还有学生让我帮他理解题目
#这辈子没这么离谱过
#连夜批了一个周三考试周四毕业的学生的卷子
#这门课过不了她今天就不用毕业了
#结果她考了41.5
#这辈子第二次离谱
#老板昨天: I’m so excited it’s done
#我：I’m more glad than u
#每天都在阴阳老板
#烦死了又要批卷子
#终于终于最后一波卷子
#今天继续赶due
#写了20页的年终总结
#还差1/3
#顺便参加朋友的毕业典礼
#May the fourth be with you!
#给了整整八页的公式表
#就差把课本给他们印出来了
#有学生举手问我要怎么代数
#甚至不管他代哪一个对结果都没影响
#还有学生问我用哪个公式
#还有学生让我帮他理解题目
#这辈子没这么离谱过
#连夜批了一个周三考试周四毕业的学生的卷子
#这门课过不了她今天就不用毕业了
#结果她考了41.5
#这辈子第二次离谱
#老板昨天: I’m so excited it’s done
#我：I’m more glad than u
#每天都在阴阳老板
#烦死了又要批卷子
#终于终于最后一波卷子
#今天继续赶due
#写了20页的年终总结
#还差1/3
#顺便参加朋友的毕业典礼
#May the fourth be with you!
#夕月恋文#
「小公主，再陪我下一盘棋吧？」
耳侧的碎发被拨开，身为异国质子的公主知道自己无法拒绝女王的命令，只得再次拿起棋子。女王只是不动声色地把棋盘推到自己身边，饶有兴致地注视着她为了落子，几乎要靠在自己怀里的样子。
午后的雨声被隔在墙外，昏暗的宫殿里只余下玉石碰撞的玎玲声。谁也不知道女王是否有意露出破绽，但公主明白自己必须全力以赴。兵至底线一路升格，最后一字落下，胜负已成定局。
「陛下，是我赢了。」
「Checkmate。不错，那就给你奖励吧。」
许多年后，昔年被架空的公主殿下手执佩剑，斩断了这片土地上持续百年的纷争，由弃子升格为王。那个暗流涌动的午后就像满是尘埃的镜子一样被她锁在记忆里，只是曾经那份未能编织成爱的感情，早已失去了它的归处。
她颠覆了她的棋局，心却早就是她的棋子。
————————————————————————
和fumi一起演出了筹划已久的双女主剧本，因为特别顺笔所以写成了BE，排练的时候作者本人一度哀叹好悲伤的剧情。喜欢他在舞台中心作为Aljeanne闪闪发光的样子，也喜欢此时此刻与他共演的人正是我自己。
「小公主，再陪我下一盘棋吧？」
耳侧的碎发被拨开，身为异国质子的公主知道自己无法拒绝女王的命令，只得再次拿起棋子。女王只是不动声色地把棋盘推到自己身边，饶有兴致地注视着她为了落子，几乎要靠在自己怀里的样子。
午后的雨声被隔在墙外，昏暗的宫殿里只余下玉石碰撞的玎玲声。谁也不知道女王是否有意露出破绽，但公主明白自己必须全力以赴。兵至底线一路升格，最后一字落下，胜负已成定局。
「陛下，是我赢了。」
「Checkmate。不错，那就给你奖励吧。」
许多年后，昔年被架空的公主殿下手执佩剑，斩断了这片土地上持续百年的纷争，由弃子升格为王。那个暗流涌动的午后就像满是尘埃的镜子一样被她锁在记忆里，只是曾经那份未能编织成爱的感情，早已失去了它的归处。
她颠覆了她的棋局，心却早就是她的棋子。
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和fumi一起演出了筹划已久的双女主剧本，因为特别顺笔所以写成了BE，排练的时候作者本人一度哀叹好悲伤的剧情。喜欢他在舞台中心作为Aljeanne闪闪发光的样子，也喜欢此时此刻与他共演的人正是我自己。
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