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永和九年,岁在癸丑,暮春之初,会于会稽山阴之兰亭,修禊事也。群贤毕至,少长咸集。此地有崇山峻岭,茂林修竹,又有清流激湍,映带左右,引以为流觞曲水,列坐其次。虽无丝竹管弦之盛,一觞一咏,亦足以畅叙幽情。
是日也,天朗气清,惠风和畅。仰观宇宙之大,俯察品类之盛,所以游目骋怀,足以极视听之娱,信可乐也。
夫人之相与,俯仰一世。或取诸怀抱,悟言一室之内;或因寄所托,放浪形骸之外。虽趣舍万殊,静躁不同,当其欣于所遇,暂得于己,快然自足,不知老之将至;及其所之既倦,情随事迁,感慨系之矣。向之所欣,俯仰之间,已为陈迹,犹不能不以之兴怀,况修短随化,终期于尽!古人云:“死生亦大矣。”岂不痛哉!
每览昔人兴感之由,若合一契,未尝不临文嗟悼,不能喻之于怀。固知一死生为虚诞,齐彭殇为妄作。后之视今,亦犹今之视昔,悲夫!故列叙时人,录其所述,虽世殊事异,所以兴怀,其致一也。后之览者,亦将有感于斯文
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永和九年,岁在癸丑,暮春之初,会于会稽山阴之兰亭,修禊事也。群贤毕至,少长咸集。此地有崇山峻岭,茂林修竹,又有清流激湍,映带左右,引以为流觞曲水,列坐其次。虽无丝竹管弦之盛,一觞一咏,亦足以畅叙幽情。
是日也,天朗气清,惠风和畅。仰观宇宙之大,俯察品类之盛,所以游目骋怀,足以极视听之娱,信可乐也。
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【公益诉讼守护#我的阿勒泰# 】随着迷你剧《我的阿勒泰》热播,阿勒泰成为不少观众心中的诗和远方。片中阿勒泰绝美的自然风光和极具特色的新疆风情,受到很多观众的好评。
近年来,阿勒泰地区两级检察机关主动服务大局,唱响生态文明的动听旋律,通过开展雪山冰川保护、野生动物保护等检察公益诉讼专项行动,全力保护雪山、冰川、河流、沙漠、绿洲、动物等生态资源,一份书写在绿水青山间的“检察答卷”直抵人心。
在《我的阿勒泰》取景地哈巴河县,检察官充分发挥“阳光检察、正义先锋”检察工作品牌效应,助力优化景区生态环境保护和旅游市场秩序。
哈巴河县地处新疆最北边缘,因境内有我国最大的天然白桦林,也被称为“中国第一白桦林”。哈巴河县人民检察院检察官定期前往白桦林景区,查看生态环境保护情况,了解景区周边商户经营情况,并通过普法宣传活动,增强游客和商户的法治意识。
吉木乃县境内萨吾尔山最高峰的冰川,有个浪漫的名字——木斯岛。这里的冰川融水是全县4万多群众、20多万头牲畜、12万亩耕地、几十万亩河谷林的生命之水。
针对破坏冰川水域生态环境、污染乡村饮用水源问题,吉木乃县人民检察院主动争取当地党委、政府的大力支持,采取一系列举措预防破坏冰川水域生态和污染水源问题的发生。
2023年,吉木乃县检察院成立驻萨吾尔冰川检察官工作室,与水利部门建立公益诉讼协作机制,常态化开展冰川水域环境保护。
《我的阿勒泰》导演、编剧滕丛丛曾说,《我的阿勒泰》没有将游牧生活描述成简单的田园牧歌,艰辛繁重的劳作是日常,是对生命厚重的咏叹与敬畏。守护好“生命之水”,牧民才能延续游牧生活。
在福海县喀拉玛盖镇北部的原始戈壁荒漠,有一条春秋牧场转夏季牧场的千里牧道。
近几年,随着农用耕地的开发,广阔无垠的原始戈壁荒漠以及国家湿地公园受到不同程度的破坏。福海县人民检察院接到线索后,邀请特邀检察官助理、福海县自然资源局工作人员参与办案,借智借力确保案件办理提质增效,通过督促相关部门充分履职,加强对戈壁荒漠以及国家湿地公园的保护。
不到喀纳斯,不知新疆美。喀纳斯湖位于阿勒泰地区布尔津县境内,布尔津县拥有令人心驰神往的自然风光和独特的人文风情,县城素有“童话边城”的美誉。
2019年,布尔津县检察院“童话边城保护者”团队成员在履职过程中发现,个别在建项目工作人员为满足生产经营和生活用水需要,通过水井、水泵取水,既未办理任何取水许可手续,也未缴纳相应的水资源费。据此,该院依法向水利部门发出检察建议书,促使县域内同类问题得到全面整改。
曾因一曲《可可托海的牧羊人》被外界所知的可可托海,位于富蕴县。这里没有“海”,但却有全球地质界公认的“天然地质博物馆”——可可托海三号矿脉。
去年,富蕴县人民检察院检察官在履职中发现,三号矿脉周边的不少绿植因缺水枯萎,灌溉滴管等配套设施损坏,不仅影响区域旅游及生态环境,也造成国有财产损失。
该院通过公开宣告送达的方式,向相关行政单位现场送达检察建议书,督促整改,切实守护国家利益和社会公共利益。
蒙新河狸属国家一级保护野生动物,是200万年前第四纪早更新世幸存的物种,被称为“活化石”。布尔根河狸国家自然保护区是我国唯一一个河狸国家级自然保护区,保护区内的蒙新河狸数量有162只。
2022年以来,青河县人民检察院检察官多次与布尔根河狸国家级自然保护区相关负责人一起,深入布尔根河流域,对河狸生存环境等进行调研并签订《合作协议》。两年来,在双方的不断努力下,布尔根河的生态环境有了明显改善,“河狸家族”重焕新生。(记者 王晨 通讯员 迪那·叶尔肯别克)
2022年至2023年,阿勒泰地区两级检察机关通过办案督促相关行政机关依法履职治理恢复被污染水源地3处,督促恢复被非法开垦和占用的草原12亩,保护被污染土壤83.62亩,清除违法堆放的各类生活垃圾2050.3吨,督促回收和清理生产类固体废物780吨,督促收回国家所有财产108.9万余元,以高质效检察履职守护好阿勒泰的青山绿水。
用心呵护阿勒泰的每一座山、每一条河、每一条路,检察官们将更加坚定写好“山水保护答卷”的信心和决心。
近年来,阿勒泰地区两级检察机关主动服务大局,唱响生态文明的动听旋律,通过开展雪山冰川保护、野生动物保护等检察公益诉讼专项行动,全力保护雪山、冰川、河流、沙漠、绿洲、动物等生态资源,一份书写在绿水青山间的“检察答卷”直抵人心。
在《我的阿勒泰》取景地哈巴河县,检察官充分发挥“阳光检察、正义先锋”检察工作品牌效应,助力优化景区生态环境保护和旅游市场秩序。
哈巴河县地处新疆最北边缘,因境内有我国最大的天然白桦林,也被称为“中国第一白桦林”。哈巴河县人民检察院检察官定期前往白桦林景区,查看生态环境保护情况,了解景区周边商户经营情况,并通过普法宣传活动,增强游客和商户的法治意识。
吉木乃县境内萨吾尔山最高峰的冰川,有个浪漫的名字——木斯岛。这里的冰川融水是全县4万多群众、20多万头牲畜、12万亩耕地、几十万亩河谷林的生命之水。
针对破坏冰川水域生态环境、污染乡村饮用水源问题,吉木乃县人民检察院主动争取当地党委、政府的大力支持,采取一系列举措预防破坏冰川水域生态和污染水源问题的发生。
2023年,吉木乃县检察院成立驻萨吾尔冰川检察官工作室,与水利部门建立公益诉讼协作机制,常态化开展冰川水域环境保护。
《我的阿勒泰》导演、编剧滕丛丛曾说,《我的阿勒泰》没有将游牧生活描述成简单的田园牧歌,艰辛繁重的劳作是日常,是对生命厚重的咏叹与敬畏。守护好“生命之水”,牧民才能延续游牧生活。
在福海县喀拉玛盖镇北部的原始戈壁荒漠,有一条春秋牧场转夏季牧场的千里牧道。
近几年,随着农用耕地的开发,广阔无垠的原始戈壁荒漠以及国家湿地公园受到不同程度的破坏。福海县人民检察院接到线索后,邀请特邀检察官助理、福海县自然资源局工作人员参与办案,借智借力确保案件办理提质增效,通过督促相关部门充分履职,加强对戈壁荒漠以及国家湿地公园的保护。
不到喀纳斯,不知新疆美。喀纳斯湖位于阿勒泰地区布尔津县境内,布尔津县拥有令人心驰神往的自然风光和独特的人文风情,县城素有“童话边城”的美誉。
2019年,布尔津县检察院“童话边城保护者”团队成员在履职过程中发现,个别在建项目工作人员为满足生产经营和生活用水需要,通过水井、水泵取水,既未办理任何取水许可手续,也未缴纳相应的水资源费。据此,该院依法向水利部门发出检察建议书,促使县域内同类问题得到全面整改。
曾因一曲《可可托海的牧羊人》被外界所知的可可托海,位于富蕴县。这里没有“海”,但却有全球地质界公认的“天然地质博物馆”——可可托海三号矿脉。
去年,富蕴县人民检察院检察官在履职中发现,三号矿脉周边的不少绿植因缺水枯萎,灌溉滴管等配套设施损坏,不仅影响区域旅游及生态环境,也造成国有财产损失。
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蒙新河狸属国家一级保护野生动物,是200万年前第四纪早更新世幸存的物种,被称为“活化石”。布尔根河狸国家自然保护区是我国唯一一个河狸国家级自然保护区,保护区内的蒙新河狸数量有162只。
2022年以来,青河县人民检察院检察官多次与布尔根河狸国家级自然保护区相关负责人一起,深入布尔根河流域,对河狸生存环境等进行调研并签订《合作协议》。两年来,在双方的不断努力下,布尔根河的生态环境有了明显改善,“河狸家族”重焕新生。(记者 王晨 通讯员 迪那·叶尔肯别克)
2022年至2023年,阿勒泰地区两级检察机关通过办案督促相关行政机关依法履职治理恢复被污染水源地3处,督促恢复被非法开垦和占用的草原12亩,保护被污染土壤83.62亩,清除违法堆放的各类生活垃圾2050.3吨,督促回收和清理生产类固体废物780吨,督促收回国家所有财产108.9万余元,以高质效检察履职守护好阿勒泰的青山绿水。
用心呵护阿勒泰的每一座山、每一条河、每一条路,检察官们将更加坚定写好“山水保护答卷”的信心和决心。
这个“酿酒”细菌有望成为下一个“细胞工厂”
炎热的天气里,一杯香甜的果汁很快就会变质,有时还会产生酒精味。这很可能是一种“擅长”将葡萄糖和果糖转化为乙醇的细菌在“作祟”。
不过这种天然能产生乙醇的“罪魁祸首”却是科学家眼中的潜力股——有资质成为像酵母、大肠杆菌那样的底盘细胞,为人类制造大宗化学品。
这就是早在1928年被人们发现的运动发酵单胞菌。5月8日,农业农村部成都沼气科学研究所研究员何明雄团队在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表研究论文。他们分析了运动发酵单胞菌为适应环境胁迫的染色体三维构象,揭示了原核生物中广泛存在的转录因子介导染色体三维构象,并调节抗逆基因表达以应对环境胁迫的分子机制。
论文审稿人认为,这是一项非常有趣的发现,因为作者发现化学分子和转录因子对细菌染色体的三维构象产生影响,从而促进或抑制基因转录。这项研究不仅为认识原核生物基因组结构与功能的关系提供新的科学依据,也为从三维基因组层面进行工程菌株的理性设计奠定了基础。
细胞工厂“潜力股”:天然产乙醇的细菌
一种能把葡萄糖和果糖变成乙醇的细菌,“运动发酵单胞菌具有一种特殊的生理生化特性。”论文通讯作者何明雄介绍,它之所以能产生乙醇,全靠其代谢途径中的特定酶系统。这些酶系统让它将碳源(如葡萄糖)转化为丙酮酸,并继续转化为乙醇和二氧化碳。
如果能把农林废弃物——例如秸秆等生物质转化成葡萄糖或者果糖,再用这种细菌处理,岂不是可以“便利”地获得工业用乙醇?
而且,有研究发现,运动发酵单胞菌在食品、健康及医药等领域也展示了广阔的应用前景。
“把运动发酵单胞菌开发成底盘细胞。”这个思路听起来很美。
何明雄说,然而,秸秆等生物质资源结构致密、难降解,难以利用。在其转化过程中,需要经过预处理来释放秸秆中的葡萄糖等营养物质。但这些预处理产生的水解液存在许多微生物发酵的抑制剂,如乙酸、呋喃甲醛、酚类和盐类化合物等。其中,乙酸和呋喃甲醛是主要的两类有毒副产物。
“这些抑制剂会导致微生物发酵的转化效率大幅下降。”何明雄说,如果能筛选出对抑制剂有抗性的菌株,有望找到相关的抗性基因。
于是,7年前,何明雄团队硕士生王薇廷开始着手做菌株突变筛选,目标就是筛选出能够耐受这些抑制剂的抗逆菌株,即能在这些胁迫环境下,高效地利用糖类产生目标产物而抵御这些抑制剂的干扰。与此同时,探索运动发酵单胞菌中可能存在的抗逆分子机制。
通过基因组重组等技术,王薇廷终于选育出具有抗逆特性的运动发酵单胞菌菌株ZM532,大幅提升了其生物转化效率。
当获得耐受菌株之后,他们就想去了解这些菌株为何会产生抗逆性状。常用的分析方法是基因组重测序、转录组学、蛋白组学等,但分析结果却有点出乎意料——尽管其中的一些基因与抗逆表型相关,但仍然不能完全解释抗逆表型发生显著改变的机制。
传统手段“失灵”:踏上基因组三维结构探秘之旅
“我们团队前期使用了基因组重测序技术和转录组学分析去揭示抗逆机制。”论文第一作者、沼科所博士陈茂说,结果发现,运动发酵单胞菌抗逆菌株的基因组上发生了单核苷酸突变(SNP)、片段的插入和缺失等突变。
他们又尝试从基因组突变关联的基因来寻找抗逆表型产生的原因。但这些突变关联的基因多与抗逆无关。
2019年,博士生Samina开始做转录组和蛋白组分析,试图挖掘关键调控因子,在转录水平上解释抗逆机制,结果亦无法解释表型发生巨大改变的原因。
“这些结果显示,在运动发酵单胞菌中,基因组突变与抗逆表型之间存在不匹配的现象。”何明雄说,在细菌中,基因组变异是其适应胁迫环境的常见现象。“人们常常认为这些突变会导致细菌抗逆表型改变,但有时在一维层面,也就是基因水平,可能无法解释这种表型为何发生转变。”
尽管人们已经知道在真核生物中,基因组突变可能会改变染色体的三维结构,导致癌症等疾病的发生。但在原核生物中,基因组突变与染色体构象之间的关系仍然知之甚少。
而染色体构象是染色体在三维空间上的组织和排列方式,包括染色体的折叠、染色体区域之间的相互作用等。这些高阶结构对基因的表达和调控有重要影响。
受真核生物三维基因组学相关研究的启发,何明雄团队提出假设,会不会是基因组突变导致了染色体三维结构的改变,从而导致抗逆表型的发生,也就使得传统方法如基因组学、转录组学、蛋白组学等一维二维的技术难以发现抗逆表型背后的机制。
2020年,正在攻读博士学位的陈茂踏上了三维基因组结构探索之旅,尝试验证关键调控因子功能,解析三维基因组动态变化,揭示抗逆调控的分子机制。
加快“细胞工厂”选育进程
究竟基因组突变和环境胁迫(如乙酸和呋喃甲醛)对运动发酵单胞菌三维染色体构象是如何产生影响的?
论文共同第一作者、沼科所副研究员吴波介绍,在三维基因组研究中,通常把DNA一维水平上相距几百kb的位点之间的互作称为长距染色体互作,而把相距几十kb甚至更小距离的互作称为短距互作。
“我们的研究发现,基因组突变仅改变了局部的短距染色体互作;当乙酸和呋喃甲醛胁迫后,不仅改变了长距互作,也改变了短距互作。这些短距互作构成了染色体结构域,这是染色体三维构象的基本结构单元。”吴波说。
他们进一步解析了结构域边界特征,并发现了一类重要的转录因子,即铁吸收调节蛋白(Fur)家族。在运动发酵单胞菌中,这个调节蛋白家族中还包括锌吸收调节蛋白(Zur)。“如果敲除这两个相关基因,会严重影响该菌的抗逆乙酸和呋喃甲醛表型。”陈茂说。
何明雄解释说,细菌的转录因子对于细菌适应逆境是至关重要的,因为这些蛋白可以调控一系列基因表达,从而影响细菌的生理代谢过程。以往的研究主要是关注转录因子最主要的功能——即调节基因表达,是从一维水平上去阐述这些调节的重要性。但转录因子结合在染色体上调节基因表达的同时,就有可能对三维构象产生影响。
“我们研究不仅表明转录因子有调节基因表达适应环境的能力,而且维持了染色体三维构象的稳定性。”何明雄说,这是首次在细菌中证实全局性转录因子具有调控染色体三维构象的能力。
该研究从全新的角度阐释了“结构决定功能”这一核心分子生物学问题,揭示了抗逆表型形成的分子机制,为认识原核生物基因组结构与功能的关系提供新的科学依据。
何明雄强调,抗逆分子机制的解析也利于对菌株直接进行理性设计。所谓理性设计是基于对微生物生物学、代谢途径和基因组学等深入的理解,通过精确的设计和调控微生物的基因组、代谢途径或生理特性,来实现特定的育种目标。从染色体结构的角度去关注染色体相互作用对理性设计的影响,可以加快表型进化的效率。
“我们的研究尚处于初级阶段,未来我们将积极探索三维基因组在合成生物学中的应用。”何明雄说,搞清楚了运动发酵单胞菌的抗逆机制,就有望高效利用秸秆等农林废弃物,甚至开发出新的“细胞工厂”。
相关论文信息:https://t.cn/A6H637Z6
图:转录因子稳定细菌染色体三维构象适应环境胁迫。中国农科院沼科所供图
来源:中国科学报
炎热的天气里,一杯香甜的果汁很快就会变质,有时还会产生酒精味。这很可能是一种“擅长”将葡萄糖和果糖转化为乙醇的细菌在“作祟”。
不过这种天然能产生乙醇的“罪魁祸首”却是科学家眼中的潜力股——有资质成为像酵母、大肠杆菌那样的底盘细胞,为人类制造大宗化学品。
这就是早在1928年被人们发现的运动发酵单胞菌。5月8日,农业农村部成都沼气科学研究所研究员何明雄团队在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表研究论文。他们分析了运动发酵单胞菌为适应环境胁迫的染色体三维构象,揭示了原核生物中广泛存在的转录因子介导染色体三维构象,并调节抗逆基因表达以应对环境胁迫的分子机制。
论文审稿人认为,这是一项非常有趣的发现,因为作者发现化学分子和转录因子对细菌染色体的三维构象产生影响,从而促进或抑制基因转录。这项研究不仅为认识原核生物基因组结构与功能的关系提供新的科学依据,也为从三维基因组层面进行工程菌株的理性设计奠定了基础。
细胞工厂“潜力股”:天然产乙醇的细菌
一种能把葡萄糖和果糖变成乙醇的细菌,“运动发酵单胞菌具有一种特殊的生理生化特性。”论文通讯作者何明雄介绍,它之所以能产生乙醇,全靠其代谢途径中的特定酶系统。这些酶系统让它将碳源(如葡萄糖)转化为丙酮酸,并继续转化为乙醇和二氧化碳。
如果能把农林废弃物——例如秸秆等生物质转化成葡萄糖或者果糖,再用这种细菌处理,岂不是可以“便利”地获得工业用乙醇?
而且,有研究发现,运动发酵单胞菌在食品、健康及医药等领域也展示了广阔的应用前景。
“把运动发酵单胞菌开发成底盘细胞。”这个思路听起来很美。
何明雄说,然而,秸秆等生物质资源结构致密、难降解,难以利用。在其转化过程中,需要经过预处理来释放秸秆中的葡萄糖等营养物质。但这些预处理产生的水解液存在许多微生物发酵的抑制剂,如乙酸、呋喃甲醛、酚类和盐类化合物等。其中,乙酸和呋喃甲醛是主要的两类有毒副产物。
“这些抑制剂会导致微生物发酵的转化效率大幅下降。”何明雄说,如果能筛选出对抑制剂有抗性的菌株,有望找到相关的抗性基因。
于是,7年前,何明雄团队硕士生王薇廷开始着手做菌株突变筛选,目标就是筛选出能够耐受这些抑制剂的抗逆菌株,即能在这些胁迫环境下,高效地利用糖类产生目标产物而抵御这些抑制剂的干扰。与此同时,探索运动发酵单胞菌中可能存在的抗逆分子机制。
通过基因组重组等技术,王薇廷终于选育出具有抗逆特性的运动发酵单胞菌菌株ZM532,大幅提升了其生物转化效率。
当获得耐受菌株之后,他们就想去了解这些菌株为何会产生抗逆性状。常用的分析方法是基因组重测序、转录组学、蛋白组学等,但分析结果却有点出乎意料——尽管其中的一些基因与抗逆表型相关,但仍然不能完全解释抗逆表型发生显著改变的机制。
传统手段“失灵”:踏上基因组三维结构探秘之旅
“我们团队前期使用了基因组重测序技术和转录组学分析去揭示抗逆机制。”论文第一作者、沼科所博士陈茂说,结果发现,运动发酵单胞菌抗逆菌株的基因组上发生了单核苷酸突变(SNP)、片段的插入和缺失等突变。
他们又尝试从基因组突变关联的基因来寻找抗逆表型产生的原因。但这些突变关联的基因多与抗逆无关。
2019年,博士生Samina开始做转录组和蛋白组分析,试图挖掘关键调控因子,在转录水平上解释抗逆机制,结果亦无法解释表型发生巨大改变的原因。
“这些结果显示,在运动发酵单胞菌中,基因组突变与抗逆表型之间存在不匹配的现象。”何明雄说,在细菌中,基因组变异是其适应胁迫环境的常见现象。“人们常常认为这些突变会导致细菌抗逆表型改变,但有时在一维层面,也就是基因水平,可能无法解释这种表型为何发生转变。”
尽管人们已经知道在真核生物中,基因组突变可能会改变染色体的三维结构,导致癌症等疾病的发生。但在原核生物中,基因组突变与染色体构象之间的关系仍然知之甚少。
而染色体构象是染色体在三维空间上的组织和排列方式,包括染色体的折叠、染色体区域之间的相互作用等。这些高阶结构对基因的表达和调控有重要影响。
受真核生物三维基因组学相关研究的启发,何明雄团队提出假设,会不会是基因组突变导致了染色体三维结构的改变,从而导致抗逆表型的发生,也就使得传统方法如基因组学、转录组学、蛋白组学等一维二维的技术难以发现抗逆表型背后的机制。
2020年,正在攻读博士学位的陈茂踏上了三维基因组结构探索之旅,尝试验证关键调控因子功能,解析三维基因组动态变化,揭示抗逆调控的分子机制。
加快“细胞工厂”选育进程
究竟基因组突变和环境胁迫(如乙酸和呋喃甲醛)对运动发酵单胞菌三维染色体构象是如何产生影响的?
论文共同第一作者、沼科所副研究员吴波介绍,在三维基因组研究中,通常把DNA一维水平上相距几百kb的位点之间的互作称为长距染色体互作,而把相距几十kb甚至更小距离的互作称为短距互作。
“我们的研究发现,基因组突变仅改变了局部的短距染色体互作;当乙酸和呋喃甲醛胁迫后,不仅改变了长距互作,也改变了短距互作。这些短距互作构成了染色体结构域,这是染色体三维构象的基本结构单元。”吴波说。
他们进一步解析了结构域边界特征,并发现了一类重要的转录因子,即铁吸收调节蛋白(Fur)家族。在运动发酵单胞菌中,这个调节蛋白家族中还包括锌吸收调节蛋白(Zur)。“如果敲除这两个相关基因,会严重影响该菌的抗逆乙酸和呋喃甲醛表型。”陈茂说。
何明雄解释说,细菌的转录因子对于细菌适应逆境是至关重要的,因为这些蛋白可以调控一系列基因表达,从而影响细菌的生理代谢过程。以往的研究主要是关注转录因子最主要的功能——即调节基因表达,是从一维水平上去阐述这些调节的重要性。但转录因子结合在染色体上调节基因表达的同时,就有可能对三维构象产生影响。
“我们研究不仅表明转录因子有调节基因表达适应环境的能力,而且维持了染色体三维构象的稳定性。”何明雄说,这是首次在细菌中证实全局性转录因子具有调控染色体三维构象的能力。
该研究从全新的角度阐释了“结构决定功能”这一核心分子生物学问题,揭示了抗逆表型形成的分子机制,为认识原核生物基因组结构与功能的关系提供新的科学依据。
何明雄强调,抗逆分子机制的解析也利于对菌株直接进行理性设计。所谓理性设计是基于对微生物生物学、代谢途径和基因组学等深入的理解,通过精确的设计和调控微生物的基因组、代谢途径或生理特性,来实现特定的育种目标。从染色体结构的角度去关注染色体相互作用对理性设计的影响,可以加快表型进化的效率。
“我们的研究尚处于初级阶段,未来我们将积极探索三维基因组在合成生物学中的应用。”何明雄说,搞清楚了运动发酵单胞菌的抗逆机制,就有望高效利用秸秆等农林废弃物,甚至开发出新的“细胞工厂”。
相关论文信息:https://t.cn/A6H637Z6
图:转录因子稳定细菌染色体三维构象适应环境胁迫。中国农科院沼科所供图
来源:中国科学报
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