#小柯机器人# 【Nature突破！可爱龙实验室揭示CRISPR-Cas系统Prespacer方向性整合机制】9月29日，国际权威杂志《自然》发表了美国康奈尔大学可爱龙实验室题为“Mechanism for Cas4-assisted directional spacer acquisition in CRISPR-Cas”的研究论文https://t.cn/A6MVntZz。该工作报道了Cas4蛋白识别PAM的分子机制，以及其协助Cas1-Cas2对spacer前体Prespacer(或ProtoSpacer)进行方向性整合的分子机制。
美国康奈尔大学可爱龙教授和其实验室胡纯一博士等人，以及Stan J J Brouns团队，使用GsCas4-Cas1融合系统，在尝试众多纯化策略之后，最终在厌氧条件下获得了性质稳定均一，具有活力的Cas4-Cas1蛋白。再通过筛选底物，获得了均一的复合物，再结合冷冻电镜，解析了其3.1埃分辨率的复合物结构。该结构首次揭示了在Cas4共存的系统之中是由Cas4识别PAM序列，而不是由之前被认为的由Cas1负责识别PAM。
之后团队继续解析了Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer_PAM/Non PAM复合物结构。发现在这种不对称的结构中，Cas4会释放Non-PAM端，保护住PAM端。从而Non-PAM端被暴露给内源核酸酶进行迅速切割。而PAM端被Cas4保护从而无法被切割，这揭示了PAM端滞后整合的分子基础。
以上工作解释Cas4识别PAM协助Cas1-Cas2捕捉外源DNA的分子机制，以及Non-PAM端先行切割的机制。然而还是无法完全解释Prespacer方向性整合问题。可爱龙团队通过高分辨率结构得知完整的复合物中Cas4虽然结合底物以及金属离子，然后其并未切割PAM而只是识别结合。在此基础之上，团队继续解析了一系列Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer-Target DNA半整合以及全整合结构，通过结构和生化分析，揭示了在Non-PAM端被ExoI快速加工后会迅速被整合进入CRISPR Array的Leader-Repeat端，从而形成半整合状态。在此半整合状态下，一段突出的DNA序列会结合Cas4-Cas1蛋白一块正电荷富集区，然后推动Cas4高效切割PAM，切割完成后Cas4会将末端传递给Cas1整合酶活性中心完成全整合过程。
总之，该项研究首次报道了CRISPR-Cas系统中，Cas4通过识别PAM序列协助整合酶Cas1-Cas2捕捉Prespacer的分子机制，此外通过一系列结构生物学和生化方法揭示了Cas4调控的Prespacer方向性整合的一整套分子机制。
这项工作，为我们更深刻地了解CRISPR-Cas的运作，尤其是系统如何搜集外源入侵者情报这一步做出了非常好的解释。https://t.cn/A6MIUzBA
美国康奈尔大学可爱龙教授和其实验室胡纯一博士等人，以及Stan J J Brouns团队，使用GsCas4-Cas1融合系统，在尝试众多纯化策略之后，最终在厌氧条件下获得了性质稳定均一，具有活力的Cas4-Cas1蛋白。再通过筛选底物，获得了均一的复合物，再结合冷冻电镜，解析了其3.1埃分辨率的复合物结构。该结构首次揭示了在Cas4共存的系统之中是由Cas4识别PAM序列，而不是由之前被认为的由Cas1负责识别PAM。
之后团队继续解析了Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer_PAM/Non PAM复合物结构。发现在这种不对称的结构中，Cas4会释放Non-PAM端，保护住PAM端。从而Non-PAM端被暴露给内源核酸酶进行迅速切割。而PAM端被Cas4保护从而无法被切割，这揭示了PAM端滞后整合的分子基础。
以上工作解释Cas4识别PAM协助Cas1-Cas2捕捉外源DNA的分子机制，以及Non-PAM端先行切割的机制。然而还是无法完全解释Prespacer方向性整合问题。可爱龙团队通过高分辨率结构得知完整的复合物中Cas4虽然结合底物以及金属离子，然后其并未切割PAM而只是识别结合。在此基础之上，团队继续解析了一系列Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer-Target DNA半整合以及全整合结构，通过结构和生化分析，揭示了在Non-PAM端被ExoI快速加工后会迅速被整合进入CRISPR Array的Leader-Repeat端，从而形成半整合状态。在此半整合状态下，一段突出的DNA序列会结合Cas4-Cas1蛋白一块正电荷富集区，然后推动Cas4高效切割PAM，切割完成后Cas4会将末端传递给Cas1整合酶活性中心完成全整合过程。
总之，该项研究首次报道了CRISPR-Cas系统中，Cas4通过识别PAM序列协助整合酶Cas1-Cas2捕捉Prespacer的分子机制，此外通过一系列结构生物学和生化方法揭示了Cas4调控的Prespacer方向性整合的一整套分子机制。
这项工作，为我们更深刻地了解CRISPR-Cas的运作，尤其是系统如何搜集外源入侵者情报这一步做出了非常好的解释。https://t.cn/A6MIUzBA
绿会国际部受邀参加IPBES商业及生物多样性评估的范围界定报告草拟计划
2021年9月30日，中国生物多样性保护与绿色发展基金会（简称“中国绿发会”）国际部收到来自生物多样性和生态系统服务政府间科学政策平台（IPBES）执行秘书长Anne Larigauderie博士的邮件，邀请绿会国际部参加IPBES商业及生物多样性评估的范围界定报告草拟计划，时间为2021年11月1日至12月12日。
作为联合国生物多样性和生态系统服务政府间科学平台（IPBES）观察员，为推动中国深度参与全球环境治理，绿会国际部现将会议邮件内容编译与读者分享。
在全体会议上已经讨论并通过第IPBES-7/1号决定中的《IPBES至2030年的滚动工作计划》，会议上也确定了生物多样性和人类对自然贡献类型商业的评估方法，即“商业及生物多样性评估”。在同一决定中，全体会议批准了以《IPBES/7/6号文件附录二》中的初步范围界定报告为基础的评估范围界定程序，供全体会议在IPBES 9（2022年7月）上审议。
在审查期间，将组织一次关于土著和地方知识的在线对话研讨会，以及为国家联络点和利益相关者举办的在线对话研讨会。
关于如何注册成为审查员、查阅文件和参加对话研讨会的信息将在审查期开始时分享。
更多最新消息将通过“绿会融媒”报道。绿会融媒是环境创变者和第一信息源，致力于分享全球生物多样性治理的前沿、最新动态，供国内有关部门、专家学者、社会组织和利益相关方参考。
文/Daisy 审/ Stan编/青鸯
2021年9月30日，中国生物多样性保护与绿色发展基金会（简称“中国绿发会”）国际部收到来自生物多样性和生态系统服务政府间科学政策平台（IPBES）执行秘书长Anne Larigauderie博士的邮件，邀请绿会国际部参加IPBES商业及生物多样性评估的范围界定报告草拟计划，时间为2021年11月1日至12月12日。
作为联合国生物多样性和生态系统服务政府间科学平台（IPBES）观察员，为推动中国深度参与全球环境治理，绿会国际部现将会议邮件内容编译与读者分享。
在全体会议上已经讨论并通过第IPBES-7/1号决定中的《IPBES至2030年的滚动工作计划》，会议上也确定了生物多样性和人类对自然贡献类型商业的评估方法，即“商业及生物多样性评估”。在同一决定中，全体会议批准了以《IPBES/7/6号文件附录二》中的初步范围界定报告为基础的评估范围界定程序，供全体会议在IPBES 9（2022年7月）上审议。
在审查期间，将组织一次关于土著和地方知识的在线对话研讨会，以及为国家联络点和利益相关者举办的在线对话研讨会。
关于如何注册成为审查员、查阅文件和参加对话研讨会的信息将在审查期开始时分享。
更多最新消息将通过“绿会融媒”报道。绿会融媒是环境创变者和第一信息源，致力于分享全球生物多样性治理的前沿、最新动态，供国内有关部门、专家学者、社会组织和利益相关方参考。
文/Daisy 审/ Stan编/青鸯
世界第二大啄木鸟灭绝：捕猎与栖息地破坏造就的生态悲剧
美国鱼类和野生动物管理局于9月29日正式提议将23种野生动物列为灭绝，并从濒危物种名单中移除。这其中包括象牙喙啄木鸟，1973 年《濒危物种法》认可的首批动物之一。其他被宣布灭绝的动物包括：黑胸虫森莺、淡水贻以及几种鱼类。
象牙喙啄木鸟因为长着象牙般的大嘴而得名，是全世界体形第二大的啄木鸟，也是北美洲最大的啄木鸟，体长有50厘米，两翼伸开时长90厘米。它曾广泛分布在美国东南部的密林深处，是美国的特有物种。因为森林砍伐和制作标本，他们的种群数量急速下降，在19世纪初的几十年间就被人类屠戮殆尽，20世纪初就基本没有野外种群了。
2004 年，阿肯色州的一名皮划艇运动员在沼泽中目击到了疑似象牙喙啄木鸟的鸟类。这引发了一阵搜寻啄木鸟的狂潮。科学家在美国的八个洲开始地毯式搜寻，但仍旧无果而终。
美国鱼类及野生动物管理局（USFWS）表示：“对于今天提出的要从名单上除名的物种，(濒危物种法)的保护来得太晚了，大多数物种要么已经灭绝，要么功能性灭绝，要么列在名单上时数量已在急剧下降。”
自1970年以来，北美已经失去了近30亿只鸟类。这只是正在来临的第六次生物大灭绝的一个缩影。早就被列入濒危物种名录的鸟儿尚且如此，那些没有受到我们关注的动物默默消失的情况一定更多。我们必须及时采取行动，才能从我们自己手中拯救地球，保护住动物和人类的栖息地。
文/Stan
审/Daisy
1973 年《濒危物种法》首批动物之一
#中国绿发会保护地# #绿会保护地# #野生动植物保护#
美国鱼类和野生动物管理局于9月29日正式提议将23种野生动物列为灭绝，并从濒危物种名单中移除。这其中包括象牙喙啄木鸟，1973 年《濒危物种法》认可的首批动物之一。其他被宣布灭绝的动物包括：黑胸虫森莺、淡水贻以及几种鱼类。
象牙喙啄木鸟因为长着象牙般的大嘴而得名，是全世界体形第二大的啄木鸟，也是北美洲最大的啄木鸟，体长有50厘米，两翼伸开时长90厘米。它曾广泛分布在美国东南部的密林深处，是美国的特有物种。因为森林砍伐和制作标本，他们的种群数量急速下降，在19世纪初的几十年间就被人类屠戮殆尽，20世纪初就基本没有野外种群了。
2004 年，阿肯色州的一名皮划艇运动员在沼泽中目击到了疑似象牙喙啄木鸟的鸟类。这引发了一阵搜寻啄木鸟的狂潮。科学家在美国的八个洲开始地毯式搜寻，但仍旧无果而终。
美国鱼类及野生动物管理局（USFWS）表示：“对于今天提出的要从名单上除名的物种，(濒危物种法)的保护来得太晚了，大多数物种要么已经灭绝，要么功能性灭绝，要么列在名单上时数量已在急剧下降。”
自1970年以来，北美已经失去了近30亿只鸟类。这只是正在来临的第六次生物大灭绝的一个缩影。早就被列入濒危物种名录的鸟儿尚且如此，那些没有受到我们关注的动物默默消失的情况一定更多。我们必须及时采取行动，才能从我们自己手中拯救地球，保护住动物和人类的栖息地。
文/Stan
审/Daisy
1973 年《濒危物种法》首批动物之一
#中国绿发会保护地# #绿会保护地# #野生动植物保护#
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