#你了解多少冷知识#【分享知识帖!#橙子是橘子和柚子杂交而来#】①世界最大的苹果产地是中国,中国70%的苹果地里都种着红富士;②从植物分类的角度来看,竹子和水稻是同一个家族;③橘子和柚子杂交出了橙子,橙子和柚子杂交出了葡萄柚,柑橘家族中任意两个水果都能杂交出新物种。这些知识↓你都知道吗?(环球资讯)
#橙子是橘子和柚子杂交而来# 【橙子为何可酸可甜?[思考]】冰糖橙、锦橙、甜橙、血橙、夏橙……这些酸甜度不同的橙子在植物分类学中都属于甜橙。世界上甜橙的基因组背景完全一致,风味多样的品种主要来源于体细胞变异。
此前,《自然—植物》在线发表了华中农业大学园艺林学学院教授徐强课题组构建的高质量的甜橙参考基因组。他们首次阐明了甜橙体细胞变异的基因组基础,为芽变机制提供了理论支撑,同时也为果实风味育种提供了基因资源。论文:https://t.cn/A6fhKlW6
首先,该团队建立了高质量的甜橙参考基因组,将组装的序列挂载到甜橙的9条染色体上,平均每条染色体仅包含3个缺失。他们共鉴定出29875个基因。
“目前,该基因组为目前柑橘属最好的基因组,其质量在所有果树基因组中也位居前列。”论文并列第一作者黄跃说。
同时,他们还完成了5个甜橙芽变系的基因组,通过基因组比较,发现芽变系之间存在大片段的结构变异,多达2321个。进一步鉴定到877个转座子跳跃事件。这些转座子在低酸和无酸的突变体中插入到相关基因中,从而影响了果实的pH值及柠檬酸含量。
其次,他们收集到114个甜橙芽变群体,“数量丰富,覆盖国内外各种芽变资源,对芽变研究具有足够的代表性”。论文作者、西南大学柑橘研究所研究员江东说,这些品种包括位于我国南方栽培历史悠久的地方品种、来源于地中海沿岸以及美洲的栽培品种。
通过分析和鉴定,该团队确定了这些芽变材料为严格的克隆材料。“背景相似度高达99.99%,没有发生杂交事件,没有染色体重组,基因组之间的差异仅仅来源于体细胞变异。”王沦说。
接着,他们开发了适合甜橙芽变群体的大数据分析方案。王沦介绍,他们将114个甜橙材料随机分成4组。通过构建群体比较模型,精细挑选了体细胞变异在基因组中的信号,基于统计分析的显著性筛选高质量的候选变异,将变异信号范围缩小。
最后,基于以上结果设计PCR实验验证了转座子在芽变品种的多态性。“结果表明,验证率达87%以上,一步一步将预测结果变为实际可用的数据。”徐强说,这些数据成为甜橙群体研究的重要基础数据,为研究甜橙克隆进化规律、芽变机制、无性繁殖作物育种等提供了可靠的数据库支持。https://t.cn/A6MCLyOv
此前,《自然—植物》在线发表了华中农业大学园艺林学学院教授徐强课题组构建的高质量的甜橙参考基因组。他们首次阐明了甜橙体细胞变异的基因组基础,为芽变机制提供了理论支撑,同时也为果实风味育种提供了基因资源。论文:https://t.cn/A6fhKlW6
首先,该团队建立了高质量的甜橙参考基因组,将组装的序列挂载到甜橙的9条染色体上,平均每条染色体仅包含3个缺失。他们共鉴定出29875个基因。
“目前,该基因组为目前柑橘属最好的基因组,其质量在所有果树基因组中也位居前列。”论文并列第一作者黄跃说。
同时,他们还完成了5个甜橙芽变系的基因组,通过基因组比较,发现芽变系之间存在大片段的结构变异,多达2321个。进一步鉴定到877个转座子跳跃事件。这些转座子在低酸和无酸的突变体中插入到相关基因中,从而影响了果实的pH值及柠檬酸含量。
其次,他们收集到114个甜橙芽变群体,“数量丰富,覆盖国内外各种芽变资源,对芽变研究具有足够的代表性”。论文作者、西南大学柑橘研究所研究员江东说,这些品种包括位于我国南方栽培历史悠久的地方品种、来源于地中海沿岸以及美洲的栽培品种。
通过分析和鉴定,该团队确定了这些芽变材料为严格的克隆材料。“背景相似度高达99.99%,没有发生杂交事件,没有染色体重组,基因组之间的差异仅仅来源于体细胞变异。”王沦说。
接着,他们开发了适合甜橙芽变群体的大数据分析方案。王沦介绍,他们将114个甜橙材料随机分成4组。通过构建群体比较模型,精细挑选了体细胞变异在基因组中的信号,基于统计分析的显著性筛选高质量的候选变异,将变异信号范围缩小。
最后,基于以上结果设计PCR实验验证了转座子在芽变品种的多态性。“结果表明,验证率达87%以上,一步一步将预测结果变为实际可用的数据。”徐强说,这些数据成为甜橙群体研究的重要基础数据,为研究甜橙克隆进化规律、芽变机制、无性繁殖作物育种等提供了可靠的数据库支持。https://t.cn/A6MCLyOv
【分享知识帖!#橙子是橘子和柚子杂交而来#】①世界最大的苹果产地是中国,中国70%的苹果地里都种着红富士;②从植物分类的角度来看,竹子和水稻是同一个家族;③橘子和柚子杂交出了橙子,橙子和柚子杂交出了葡萄柚,柑橘家族中任意两个水果都能杂交出新物种。这些知识↓你都知道吗?(环球资讯)#突然吹牛都不会了#
✋热门推荐