每个城市都有自己的微生物“分子指纹”
 
“每个城市都有自己的微生物‘分子指纹’。”美国威尔康奈尔医学院教授、定量预测倡议组织WorldQuant 主任、论文通讯作者Christopher Mason表示，“如果你把鞋给我，我就能以90%的准确率说出你来自哪个城市。”

近日，一个国际团队报告了迄今为止规模最大的全球城市微生物宏基因组学研究结果。相关论文刊登于Cell。该项目从全球60个城市的公共交通系统和医院收集了4728份样本。通过极端科学和工程发现环境（XSEDE）超级计算机，研究人员对样本进行了测序和分析，并绘制了世界上第一个系统性的城市微生物生态系统目录。研究表征了区域抗菌素耐药性标记，确定了4246种已知的城市微生物，其中有31种核心微生物物种，这些物种在97%的样本中都有发现。研究人员还发现，参考数据库中没有的10928种病毒，1302种细菌以及两种古细菌。

“地球上有无数物种，但我们此时只有10万到20万个完整、坚实的基因组参考数据。”Mason说，新物种的发现有助于建立微生物系谱，了解不同物种间的联系。作者认为，这项新研究对检测已知和未知的微生物感染暴发，以及研究不同城市环境中耐抗生素微生物的流行情况具有意义。它还有助于得到微生物生命进化的新发现。从实际应用来看，本次研究还发现了80多万种新的CRISPR序列，研究人员认为生物合成基因簇（BGC）注释的新抗生素和小分子有望推动药物开发。来源：Cellhttps://t.cn/A6Vacouc
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