每周劳逸结合 吃吃喝喝
P2惊魂 回宿舍我的耳机就不见了 自闭一整天 完了第二天下午在失物招领处拿到了
P3只要这个老师一学期在! 我就一定会全勤她的Ashtanga Yoga class[开学季]
P5和cmy在宿舍捣鼓烤红薯和小红书食谱酸奶芝士蛋糕
p6今早拍的 刚想感慨春天终于来了 晚上从CAS building出来就降到-3度 谁懂[开学季]
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【Lufotrelvir】
CAS Registry Number 2468015-78-1
C24H33N4O9P
1H-Indole-2-carboxamide, 4-methoxy-N-[(1S)-3-methyl-1-[[[(1S)-2-oxo-1-[[(3S)-2-oxo-3-pyrrolidinyl]methyl]-3-(phosphonooxy)propyl]amino]carbonyl]butyl]-
Molecular Weight
552.51
Density (Predicted)
Value: 1.375±0.06 g/cm3 | Condition: Temp: 20 °C Press: 760 Torr
pKa (Predicted)
Value: 1.65±0.10 | Condition: Most Acidic Temp: 25 °C
Other Names
(3S)-3-[[N-[(4-Methoxy-1H-indol-2-yl)carbonyl]-L-leucyl]amino]-2-oxo-4-((3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)butyl dihydrogen phosphate
PF 07304814
PF-07304814
CAS Registry Number 2468015-78-1
C24H33N4O9P
1H-Indole-2-carboxamide, 4-methoxy-N-[(1S)-3-methyl-1-[[[(1S)-2-oxo-1-[[(3S)-2-oxo-3-pyrrolidinyl]methyl]-3-(phosphonooxy)propyl]amino]carbonyl]butyl]-
Molecular Weight
552.51
Density (Predicted)
Value: 1.375±0.06 g/cm3 | Condition: Temp: 20 °C Press: 760 Torr
pKa (Predicted)
Value: 1.65±0.10 | Condition: Most Acidic Temp: 25 °C
Other Names
(3S)-3-[[N-[(4-Methoxy-1H-indol-2-yl)carbonyl]-L-leucyl]amino]-2-oxo-4-((3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)butyl dihydrogen phosphate
PF 07304814
PF-07304814
#小柯机器人# 【Nature突破!可爱龙实验室揭示CRISPR-Cas系统Prespacer方向性整合机制】9月29日,国际权威杂志《自然》发表了美国康奈尔大学可爱龙实验室题为“Mechanism for Cas4-assisted directional spacer acquisition in CRISPR-Cas”的研究论文https://t.cn/A6MVntZz。该工作报道了Cas4蛋白识别PAM的分子机制,以及其协助Cas1-Cas2对spacer前体Prespacer(或ProtoSpacer)进行方向性整合的分子机制。
美国康奈尔大学可爱龙教授和其实验室胡纯一博士等人,以及Stan J J Brouns团队,使用GsCas4-Cas1融合系统,在尝试众多纯化策略之后,最终在厌氧条件下获得了性质稳定均一,具有活力的Cas4-Cas1蛋白。再通过筛选底物,获得了均一的复合物,再结合冷冻电镜,解析了其3.1埃分辨率的复合物结构。该结构首次揭示了在Cas4共存的系统之中是由Cas4识别PAM序列,而不是由之前被认为的由Cas1负责识别PAM。
之后团队继续解析了Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer_PAM/Non PAM复合物结构。发现在这种不对称的结构中,Cas4会释放Non-PAM端,保护住PAM端。从而Non-PAM端被暴露给内源核酸酶进行迅速切割。而PAM端被Cas4保护从而无法被切割,这揭示了PAM端滞后整合的分子基础。
以上工作解释Cas4识别PAM协助Cas1-Cas2捕捉外源DNA的分子机制,以及Non-PAM端先行切割的机制。然而还是无法完全解释Prespacer方向性整合问题。可爱龙团队通过高分辨率结构得知完整的复合物中Cas4虽然结合底物以及金属离子,然后其并未切割PAM而只是识别结合。在此基础之上,团队继续解析了一系列Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer-Target DNA半整合以及全整合结构,通过结构和生化分析,揭示了在Non-PAM端被ExoI快速加工后会迅速被整合进入CRISPR Array的Leader-Repeat端,从而形成半整合状态。在此半整合状态下,一段突出的DNA序列会结合Cas4-Cas1蛋白一块正电荷富集区,然后推动Cas4高效切割PAM,切割完成后Cas4会将末端传递给Cas1整合酶活性中心完成全整合过程。
总之,该项研究首次报道了CRISPR-Cas系统中,Cas4通过识别PAM序列协助整合酶Cas1-Cas2捕捉Prespacer的分子机制,此外通过一系列结构生物学和生化方法揭示了Cas4调控的Prespacer方向性整合的一整套分子机制。
这项工作,为我们更深刻地了解CRISPR-Cas的运作,尤其是系统如何搜集外源入侵者情报这一步做出了非常好的解释。https://t.cn/A6MIUzBA
美国康奈尔大学可爱龙教授和其实验室胡纯一博士等人,以及Stan J J Brouns团队,使用GsCas4-Cas1融合系统,在尝试众多纯化策略之后,最终在厌氧条件下获得了性质稳定均一,具有活力的Cas4-Cas1蛋白。再通过筛选底物,获得了均一的复合物,再结合冷冻电镜,解析了其3.1埃分辨率的复合物结构。该结构首次揭示了在Cas4共存的系统之中是由Cas4识别PAM序列,而不是由之前被认为的由Cas1负责识别PAM。
之后团队继续解析了Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer_PAM/Non PAM复合物结构。发现在这种不对称的结构中,Cas4会释放Non-PAM端,保护住PAM端。从而Non-PAM端被暴露给内源核酸酶进行迅速切割。而PAM端被Cas4保护从而无法被切割,这揭示了PAM端滞后整合的分子基础。
以上工作解释Cas4识别PAM协助Cas1-Cas2捕捉外源DNA的分子机制,以及Non-PAM端先行切割的机制。然而还是无法完全解释Prespacer方向性整合问题。可爱龙团队通过高分辨率结构得知完整的复合物中Cas4虽然结合底物以及金属离子,然后其并未切割PAM而只是识别结合。在此基础之上,团队继续解析了一系列Cas4-Cas1-Cas2-Prespacer-Target DNA半整合以及全整合结构,通过结构和生化分析,揭示了在Non-PAM端被ExoI快速加工后会迅速被整合进入CRISPR Array的Leader-Repeat端,从而形成半整合状态。在此半整合状态下,一段突出的DNA序列会结合Cas4-Cas1蛋白一块正电荷富集区,然后推动Cas4高效切割PAM,切割完成后Cas4会将末端传递给Cas1整合酶活性中心完成全整合过程。
总之,该项研究首次报道了CRISPR-Cas系统中,Cas4通过识别PAM序列协助整合酶Cas1-Cas2捕捉Prespacer的分子机制,此外通过一系列结构生物学和生化方法揭示了Cas4调控的Prespacer方向性整合的一整套分子机制。
这项工作,为我们更深刻地了解CRISPR-Cas的运作,尤其是系统如何搜集外源入侵者情报这一步做出了非常好的解释。https://t.cn/A6MIUzBA
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