NIH VRC的周同庆和Peter Kwong等在Science报道了一系列中和抗体结合和中和Omicron的结构生物学基础。同庆是中和抗体和病毒膜蛋白表位结构解析的全世界最顶级专家,这项研究应用VRC的技术优势,全面阐述了Omicron和各种单抗的相互作用的结构基础,是一项十分重要的研究。
研究应用Cryo-EM解析了17种商业化的单抗和Omicron及其他VOC突变株Spike(刺突蛋白)的复合物结构。研究发现Omicron的RBD突变使其RBD平面结构发生了16%的构象变化,这一变化聚集在与ACE2结合表面重叠的RBD脊上,使其大多数抗体无法有效结合RBD。SARS-CoV-2的单抗根据其结合表位的氨基酸残基可以分为I-IV类,I类抗体结合的氨基酸为484,501等关键RBD与ACE2结合的氨基酸,因此Omicron对这一类抗体逃逸最为严重,使这些抗体全部失效。但是部分单抗保留了显着的中和活性,包括A19-58.1,B1-182.1,COV2-2196,S2E12,A19-46.1,S309和LY-CoV1404,它们适应了这些变化并依旧可中和Omicron。研究检测了一系列抗体组合抗体组合,对Omicron中和效果最好的是礼来公司的LY-CoV1404 + Adimab公司的ADG-2,该组合对中和Omicron的IC50低达5.8。
这一结果为指导针对Omicron的抗体治疗鸡尾酒设计提供了重要的基础。
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