#日行一善[超话]#阴历五月初六:鉴真 和尚圆寂日。(688年-763年6月25日),唐朝僧人,俗姓淳于,广陵江阳(今江苏扬州)人,律宗南山宗传人,也是日本佛教南山律宗的开山祖师 ,著名医学家。曾担任扬州大明寺主持,应日本留学僧请求先后六次东渡,弘传佛法,促进了文化的传播与交流。763年(广德元年)6月25日,鉴真在唐招提寺圆寂,终年76岁。日本人民称鉴真为"天平之甍 ",意为他的成就足以代表天平时代文化的屋脊
生信分析——t-SNE散点图(2)
我们以肿瘤异质性为例来看看t-SNE的应用,以及t-SNE散点图的读图。
肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一,是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。
如果肿瘤呈同质性,则所有肿瘤细胞对所给治疗具相同敏感性,因此只要对瘤细胞的杀灭胜过新生则可根治。但肿瘤异质性的存在,使不同亚群对化疗药物的敏感程度不同,使用化疗药物,可能对肿瘤实施短暂压制,但其所形成的选择性压力使药物敏感的亚群逐渐消失,不敏感亚群再度繁衍而致肿瘤复发或转移。所以临床治疗应更加关注肿瘤异质性而制定个体化的精准方案。
#生物信息学##生信分析##医学生[超话]#
原文节选自:医学僧的科研日记(ID:zzudoctor)
我们以肿瘤异质性为例来看看t-SNE的应用,以及t-SNE散点图的读图。
肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一,是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。
如果肿瘤呈同质性,则所有肿瘤细胞对所给治疗具相同敏感性,因此只要对瘤细胞的杀灭胜过新生则可根治。但肿瘤异质性的存在,使不同亚群对化疗药物的敏感程度不同,使用化疗药物,可能对肿瘤实施短暂压制,但其所形成的选择性压力使药物敏感的亚群逐渐消失,不敏感亚群再度繁衍而致肿瘤复发或转移。所以临床治疗应更加关注肿瘤异质性而制定个体化的精准方案。
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原文节选自:医学僧的科研日记(ID:zzudoctor)
生信分析——ELISA(2)
注意,通过ELISA实验我们得到的是一个个的样本浓度的数值,所以说文章中涉及到的ELISA结果图一般就是对这些数据的统计分析,如:(图1,2)
当然有的也是直接使用测得的OD值做统计分析,如:(图3)
通过统计分析我们可以得到因不同实验条件得到的不同组蛋白量的差异是否有统计学意义,从而得到我们需要的结论。
至此,我们分享完了蛋白检测实验三巨头,那么就来汇总一下三者的区别:
免疫组化、Western、ELISA是免疫学三大工具,分别用于定位,定性和定量。
1.定位是免疫组化最大的优势
该方法可在组织和细胞中进行抗原的准确定位,因而可同时对不同抗原在同一组织或细胞中进行定位观察,这样就可以进行形态与功能相结合的研究,相比于其他蛋白检测方法,免疫组化具有定位较直接准确、定性灵敏度高,是定位检测分析首选方法对病理学领域开展深入研究是十分有意义,尤其对于有些因子的转位研究十分有用。
2.WB与IHC技术相比,定量更加准确
当然WB也可定性和定位(通过提取膜蛋白或核蛋白、胞浆蛋白分别检测其中抗原含量,进而间接反映它们的定位),但敏感性远远低于IHC。
3.ELISA与免疫组化技术相比,定量最准确,是分泌性蛋白检测首选方法之一。
尤其对于微定量分析多个样本非常有用,所用试剂和样品量很少,结果精确。IHC针对性比较强,而且一般是以组织或者细胞为样本,而ELISA一般是使用血清或者组织磨碎液。免疫组化可以快速检测样本中抗体的阳性或者阴性,一般不用于定量检测。#生物信息学##生信分析##生物信息学[超话]##网络药理学[超话]##医学生[超话]#
原文节选自:医学僧的科研日记(ID:zzudoctor)
注意,通过ELISA实验我们得到的是一个个的样本浓度的数值,所以说文章中涉及到的ELISA结果图一般就是对这些数据的统计分析,如:(图1,2)
当然有的也是直接使用测得的OD值做统计分析,如:(图3)
通过统计分析我们可以得到因不同实验条件得到的不同组蛋白量的差异是否有统计学意义,从而得到我们需要的结论。
至此,我们分享完了蛋白检测实验三巨头,那么就来汇总一下三者的区别:
免疫组化、Western、ELISA是免疫学三大工具,分别用于定位,定性和定量。
1.定位是免疫组化最大的优势
该方法可在组织和细胞中进行抗原的准确定位,因而可同时对不同抗原在同一组织或细胞中进行定位观察,这样就可以进行形态与功能相结合的研究,相比于其他蛋白检测方法,免疫组化具有定位较直接准确、定性灵敏度高,是定位检测分析首选方法对病理学领域开展深入研究是十分有意义,尤其对于有些因子的转位研究十分有用。
2.WB与IHC技术相比,定量更加准确
当然WB也可定性和定位(通过提取膜蛋白或核蛋白、胞浆蛋白分别检测其中抗原含量,进而间接反映它们的定位),但敏感性远远低于IHC。
3.ELISA与免疫组化技术相比,定量最准确,是分泌性蛋白检测首选方法之一。
尤其对于微定量分析多个样本非常有用,所用试剂和样品量很少,结果精确。IHC针对性比较强,而且一般是以组织或者细胞为样本,而ELISA一般是使用血清或者组织磨碎液。免疫组化可以快速检测样本中抗体的阳性或者阴性,一般不用于定量检测。#生物信息学##生信分析##生物信息学[超话]##网络药理学[超话]##医学生[超话]#
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