更新目前在B站发的视频合集：

转录组分析
从raw data到下游分析（还没更完）

R绘图相关
主要是自己用到的图

分子标记相关（主要是SSR和Indel）
引物设计 聚丙烯酰胺凝胶电泳 数据分析 反正研究生期间会的全部教了

叶绿体基因组
只更了组装 后续还有注释啥的

其它：
LaTeX安装
zotero使用相关

后续：
Perl语言和生信中可能好用的脚本
单细胞相关（等工作以后吧）
植物科普！（算不上科普啦）

基因测序方法：

第一代的测序方法，主要是sanger测序，准确性高，测序长度好（1K以上），但是测序通量低，而且价格昂贵。第二代测序仪，主要有illumina的，solid和454几个常用的测序平台。

第二代测序仪最大的有点就是价格便宜，通量非常高，准确性99%。 但是illumina主要的问题是测序长度短，100bp以上错误率就会大大提高。另外两个可以更长，但是成本也略比illumina高。短序列的reads在做基因组装的时候，遇到大的重复片段就会很麻烦。

第三代的测序仪，即所谓的单分子测序，可以测的长度很高，但是会引入第二代测序很少出现的indel（插入，缺失）的情况。

#pgs# #基因检测# #pgd#

美格基因原核有参转录组全新升级、分析速度、准确度、内容丰富度均有超大提升，此次升级为免费增值，加值不加价，真香~

Part1 产品介绍
转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段，也是目前应用最为广泛的测序组学之一。而目前科研学者对于转录组的分析要求已经不仅限于获知其基因表达量和差异情况了，更多将关注点转移到分析速度提升、准确度提高和分析内容丰富。

Part2 升级亮点
01、分析流程提速
基因表达是做转录组的用户都会关注的点，目前美格基因的原核有参转录组V2.0的基因表达量定量软件更换为salmon，salmon在实现将 read 快速比对到参考序列的同时采用了一个新的双相位并行推理算法和功能丰富的偏差模型，能够在全转录组水平更准确的估算片段的GC含量偏好，可以显著提高转录本水平表达丰度估值的准确性以及后续差异表达分析的灵敏度。

02、差异分析升级
基于基因表达量的差异分析是目前常用的筛选关键基因的分析方法，但此方法在默认参数下可能会忽略一些表达量差异不显著但功能重要的基因。为了提供更全面的差异分析结果，原核有参转录组V2.0引入了GSEA的分析思路，提供另一种关键基因的分析结果，用户们可以根据自己的需求选择相应的分析结果继续深入挖掘，亦可两部分的结果相应印证。

03、结构分析内容丰富
基因的表达是科研用户重点关注的内容，但目前也越来越多用户同时关注基因结构的变化，从不同的角度解析mRNA的数据。目前原核有参转录组V2.0增加的结构分析内容包括：SNP/InDel分析、操纵子分析、转录/翻译位点分析、UTR 分析、启动子序列预测和 sRNA 分析，实现一份报告满足用户基因表达量分析和结构分析的两个需求。