【有望减缓温室气体增加,科学家用冷冻电镜全面解析微生物一氧化二氮还原酶组装过程】

无味无毒的气体一氧化二氮(N2O,nitrous oxide)可以通过生物和非生物两类过程形成,这导致大气中 N2O 浓度每年稳定增加 0.2-0.3 %。一氧化二氮是一种消耗臭氧的物质;它的全球变暖潜力超过了二氧化碳的 300 倍,因此已经被认为是 21 世纪最关键的人为排放物。

微生物可以将 N2O 转化为 N2,这是反硝化过程的最后一步,这一反应完全由一氧化二氮还原酶(N2OR 酶)催化。大气中 N2O 释放和不断积累的一个主要因素是,在高流量氮的环境下,微生物还原 N2O 的能力有限。

因此,利用 N2OR 酶的性能进行农业或生物修复应用是相当有意义的,这需要对该酶及其反应过程有一个详细的了解。除了[4Cu:2S]CuZ 簇,它还含有混合价的双铜电子转移中心 CuA,这使其成为目前已知最复杂的含铜酶。

各种真核生物和原核生物酶在涉及氧运输、电子转移或氧化还原催化的过程中都会使用过渡金属铜,但其巨大的细胞毒性、对铁硫簇代谢的不利影响以及产生活性氧的倾向性,使得细胞内必须进行严格的平衡和调节。

N2O 还原剂通过完全在细胞质外组装 CuA 和 CuZ 来规避与细胞内铜有关的风险,尽管 apo-N2OR 已经以折叠状态通过 Tat 途径被输出。

然而,这种策略导致了新的复杂情况,特别是包括在周质中没有还原当量和高能化合物,如核苷三磷酸酯。I 族 N2O还 原催化剂的共同结构包括两个核苷酸结合结构域(NosF)和两个跨膜结构域(NosY)。一些细菌输出体进一步与附属蛋白相互作用,以建立复杂的运输系统,NosD 蛋白被认为是与 NosFY 一起发挥这种作用。

由于 NosDFY 的实际货物分子尚未被确定,不能排除 CuZ 成熟所需的周质硫源。为了了解 N2OR 成熟的分子基础,这项研究制作并表征了 NosDFY 复合物,并通过冷冻电子显微镜(cryo-EM)研究了它与 NosL 和 N2OR 的相互作用,揭示了由细胞质中 ATP 水解驱动的周质酶铜位点的顺序组装线。

2022 年 7 月 27 日,#德国弗莱堡大学# 生物物化学研究所所长奥利弗·艾因斯( Oliver Einsle)与美国范·安德尔(Van Andel)研究所首席研究员杜娟合作,在 Nature 发表其最新论文,题为《一氧化二氮还原酶的组装机制中的分子相互作用》(Molecular interplay of an assembly machinery for nitrous oxide reductase)[1]。该工作详细地解析了 N2OR 酶的三维结构和组装机理。

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#图像小说[超话]# 话说,有没有人整理过现在在出图像小说的都有哪几家出版社啊,从10年前的后浪+世图+三联的「三足鼎立」,到现在看,还真就有点百花齐放那意思嘿,我先说说我知道的几家:

①后浪漫(@后浪漫 ),后浪算是国内最早做图像小说出版的公司了吧,也是当年三巨头里唯一还在坚持的一位了,在出品数量上应该稳居第一,质量上偶尔会有不稳定的发挥,尤其是早期,但这也难免,毕竟是先行者,没有什么经验可以参考,但基本还算蛮优秀(删减问题就不说了,大环境使然)。

②海星(@海星创造 ),感觉算是接替了世图的超英线出版,这个不多说了,喜欢超英的朋友应该都很熟悉啦,主要是期刊合集和图像小说这两类。

③新经典(@新经典动漫部 ),感觉新经典的量最近上来了,而且在国内原创上也始终在发力,比如高佬和左马的书都是他家做的。其实新经典是个挺大的社,在海外发展也挺厉害的,出漫画的应该不止一个部门,总之大有在漫画出版大展拳脚的意思。

④青马(@青马BOOK ),青马应该和新经典有一些关联,它家出的两套松本大洋——《卢浮宫的猫》和《星之子》都给我留下非常好的印象。后面的主攻方向好像也还是日漫为主的路子。

⑤次元(@次元书馆),最近势头挺猛的,《间谍过家家》可真是捡到宝了。他家最早是以恐怖、悬疑起家的,之前就出过伊藤润二和爱手艺的书(田边刚算合作),再往前就是和@黑马漫画 一起出过《地狱男爵》。感觉未来发展看好。

⑥新星(@新星出版社 ),次元其实和新星应该是关系密切,但新星自己也出漫画,而且都是大活儿,比如JOJO、《三国志》这种,看乔乔的宣发就知道新星和次元关系「情同一家」啦。当然,新星最近最大的爆点,还是藤本树的《蓦然回首》,据说卖爆了。

⑦中信(@中信出版集团),这是个航母级大社,不知道漫画属于哪个部门来出,印象最深的是@漫传奇 出的刘慈欣那套,据说已经出了海外版。那套的稿费应该是国内的天花板,按照国际标准来了,主要突出的一个「壕」来。但不管咋说,有人肯给漫画砸钱,我都给点赞。

⑧墨狸(@墨狸_READING )这家是中信旗下专门做漫画的一个子厂牌,但应该不是唯一一个,应该是面向年轻读者群的。之前推出了漆原友纪的《水域》,未来还有《天官赐福》《破碎的真理子》,以及另一个预定现象级爆款《再见绘梨》,看来也是财力相当雄厚,未来或许是主攻东亚漫画这块?

⑨文发(@文化发展出版社 ),这家特别低调,但其实做漫画也很早了,之前有有一套全无字的动物主题图像小说《Love》就它家出的,后来还有法漫经典《雪国列车》的重置版,欧漫有gipi的作品,田边刚的爱手艺那一套其实他们也有份,和次元合作的。

10,99(@99读书人),这家资格其实更老,《缝不起来的伤痕童年》其实算最早一批进入国内的图像小说,但他家出品数量确实不多,但断断续续在出。

11,漫编室(@漫编室),读库旗下的漫画条线,大家应该比较熟悉了,主攻日漫,《梦晕》《海兽之子》《咖啡时间》等等,藤本理、五十岚大介、丰田彻也等等。漫编室应该是所有漫画出版者中最懂得漫画文化的一家,也是最具理想主义色彩的一家,做书之用心,无人能出其右。

12,小众社(@小众社 ),也是一家与读库有关联的机构,神龙见首不见尾,这么多年了只出了一本克里斯·韦尔的《吉米·科瑞根》,但相信它还在继续,毕竟这么多人等着它的《Rusty Brown》了,别让我们失望,别让《老屋记》的悲剧重演,摆脱了。

13,明室(@明室Lucida ),这家千年等一回,头一本漫画就是拉美传奇经典《永航员》,目前众筹成功,上市指日可待。但后续有没有更多的漫画持续发布并不确定。

14,森雨漫(@森雨漫 ),独立出版起家,也是蛮有年头的一家出版社了,阿切的几本书都在它家出,《红色的皮》《海门回声》之类的。它家应该不做引进,制作原创,之前还做了以争议人物刘拓为原型的《沙漠中的十四天》,但近期漫画出版不太多,插画集比较多一些。

15,乐府文化(@乐府文化),这家大家可能不太熟悉,也是最近才开始做,之前出了blexbolex的两本书,后面还有几本欧漫,一本是玛丽昂·法约尔的《小家伙》,一本是刘易斯·特隆赫姆的《O先生》。这家也是一家非常理想主义的出版社,选品非常有艺术品位,应该是走小众精品路线。

16,天闻角川(@天闻角川)这个不说了,铁日漫为主。

17,果麦(@果麦文化 )这家也实力强悍,出过一些图像小说,比如《杀死一只知更鸟》,还有《电幻国度》这一系列(虽然不太像漫画,更像是设定集),后续比较令人期待的《草原志怪》,这将是网络漫画实体出版的一次不错的尝试。

18,有书至美(@有书至美_华中艺术分社 )这家之前出过一整套「向大师致敬」,让我这个漫画、艺术双吃的人「双厨狂喜」,但后续好像在漫画上并没有持续跟进,不知道有没有新书。

19,童书出版商,一些之前在童书领域的社似乎也在关注成人阅读领域,比如@北斗童书、@联合独创等,也都值得关注。

写不下了,就这样吧,大家评论补充。


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