【归国科学家颜宁回应研究方向正被AI取代:还停留在2017年的水平】2017年,著名结构生物学家颜宁离开任教10年的清华大学,到美国普林斯顿大学就职,备受争议。
最近,颜宁又毫无征兆地宣布选择归国,出任深圳医学科学院创始院长,再次引发热议。
有一种声音就提出,颜宁的主要研究方向,其实已经被AI所取代,其工作失去了以往的价值。
对此,忙于工作、懒得辟谣的颜宁,还是在个人微博露面,作了一番科普,也谈了自己的想法。
颜宁在回应中特别提到了AlphaFold,Google公司旗下DeepMind团队出品的AI工具,与大名鼎鼎的围棋AI AlphaGo师出同门,可以根据基因序列预测蛋白质的3D形状,而且准确性惊人。
颜宁指出,去年8月8日就曾有一份论文,讨论AlphaFold的局限性,而到了今天,这份报告仍然一张都不用改。
简单地说,颜宁专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题,包括electromechanical coupling、ion selection、MOA of drugs and toxins,AlphaFold在过去解析诸多结构的基础上,去年的预测达到了颜宁团队2017年的水平,今年依旧停留在这个水平(仅针对Nav/Cav)。
颜宁也在与专门做结构预测的AI团队合作,分别做预测和实验,测试新型小分子与蛋白的相互作用。
结果呢?迄今为止,AI的预测无一正确。
颜宁对此解释说,结构生物学不仅仅是看到蛋白质的折叠,更要理解蛋白质的动态变化,要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用,要理解在细胞原位里的状态,这些都是AI目前尚无能为力的领域,因为尚没有足够的数据库去训练它。
比如说,颜宁团队Cav2.2的结构去年发表晚了,尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练,所以它预测的模型就与实验结构严重不符。
最近,颜宁又毫无征兆地宣布选择归国,出任深圳医学科学院创始院长,再次引发热议。
有一种声音就提出,颜宁的主要研究方向,其实已经被AI所取代,其工作失去了以往的价值。
对此,忙于工作、懒得辟谣的颜宁,还是在个人微博露面,作了一番科普,也谈了自己的想法。
颜宁在回应中特别提到了AlphaFold,Google公司旗下DeepMind团队出品的AI工具,与大名鼎鼎的围棋AI AlphaGo师出同门,可以根据基因序列预测蛋白质的3D形状,而且准确性惊人。
颜宁指出,去年8月8日就曾有一份论文,讨论AlphaFold的局限性,而到了今天,这份报告仍然一张都不用改。
简单地说,颜宁专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题,包括electromechanical coupling、ion selection、MOA of drugs and toxins,AlphaFold在过去解析诸多结构的基础上,去年的预测达到了颜宁团队2017年的水平,今年依旧停留在这个水平(仅针对Nav/Cav)。
颜宁也在与专门做结构预测的AI团队合作,分别做预测和实验,测试新型小分子与蛋白的相互作用。
结果呢?迄今为止,AI的预测无一正确。
颜宁对此解释说,结构生物学不仅仅是看到蛋白质的折叠,更要理解蛋白质的动态变化,要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用,要理解在细胞原位里的状态,这些都是AI目前尚无能为力的领域,因为尚没有足够的数据库去训练它。
比如说,颜宁团队Cav2.2的结构去年发表晚了,尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练,所以它预测的模型就与实验结构严重不符。
【#颜宁回应科研被AI横刀夺爱#:该技术在多领域尚无能为力】11月1日,著名科学家颜宁宣布即将辞去美国教职回国,协助创建深圳医学科学院,引起广泛关注。在“欢迎优秀科学家回国”的声音中,也有人揣测其回国动机,称“由于颜宁所从事的结构生物学遭遇AI技术‘横刀夺爱’,工作机会和成果会日渐减少,因此只能回国”。11月11日,南都记者注意到,颜宁通过微博发文,对相关话题作出了回应。
南都记者梳理发现,连日来,部分网传版本还列出了详细的“猜测依据”:颜宁团队一年能解析几十个蛋白质结构,但谷歌旗下的英国公司凭借AlphaFold2模型一次解析上亿个蛋白。这些年,几万个生物结构学家才解析几十万个蛋白,在AI(人工智能)的碾压之下,结构生物学家即将失业。
11月11日,颜宁在微博中回应:去年8月8日,给了一个报告,讨论了AlphaFold的局限性。到今年11月11日,发现去年的报告还是可以一张都不用改。简而言之,我专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题(electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins),AlphaFold在我们过去解析的诸多结构的基础上,去年的预测达到了我们2017年的水平,今年依旧停留在我们2017年的水平(这里仅针对Nav/Cav)。在与专门做结构预测的AI团队合作,他们做预测我们做实验,测试新型小分子与蛋白的相互作用,迄今为止预测无一正确。
颜宁认为,结构生物学不仅仅是看到Fold(折叠),更要理解蛋白质的动态变化,要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用,要理解在细胞原位里的状态,这些都是AI目前尚无能为力的领域,因为尚没有足够的数据库去训练它。“举个例子,我们Cav2.2的结构去年发表晚了,尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练,所以它预测的模型就与实验结构严重不符。”
颜宁表示,真正的研究者都乐于拥抱技术进步,善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。“事实上,我期待AI越来越强大,如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现,那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。”
此外,颜宁还解释了关闭微博评论功能的原因:“因为这样就不会忍不住删黑了”。针对网上的各种揣测,颜宁说,“这两天有师友喊我辟谣,我真的很忙啊。八竿子打不着、错漏百出、但凡花一个钟头读论文也不至于那么眼瞎的碰瓷文章,给眼神都浪费时间,为啥要我辟谣啊?当然,如果将来某天SMART的法务看不下去了有什么行动,我就不拦了”。 https://t.cn/A6orikxt
南都记者梳理发现,连日来,部分网传版本还列出了详细的“猜测依据”:颜宁团队一年能解析几十个蛋白质结构,但谷歌旗下的英国公司凭借AlphaFold2模型一次解析上亿个蛋白。这些年,几万个生物结构学家才解析几十万个蛋白,在AI(人工智能)的碾压之下,结构生物学家即将失业。
11月11日,颜宁在微博中回应:去年8月8日,给了一个报告,讨论了AlphaFold的局限性。到今年11月11日,发现去年的报告还是可以一张都不用改。简而言之,我专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题(electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins),AlphaFold在我们过去解析的诸多结构的基础上,去年的预测达到了我们2017年的水平,今年依旧停留在我们2017年的水平(这里仅针对Nav/Cav)。在与专门做结构预测的AI团队合作,他们做预测我们做实验,测试新型小分子与蛋白的相互作用,迄今为止预测无一正确。
颜宁认为,结构生物学不仅仅是看到Fold(折叠),更要理解蛋白质的动态变化,要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用,要理解在细胞原位里的状态,这些都是AI目前尚无能为力的领域,因为尚没有足够的数据库去训练它。“举个例子,我们Cav2.2的结构去年发表晚了,尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练,所以它预测的模型就与实验结构严重不符。”
颜宁表示,真正的研究者都乐于拥抱技术进步,善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。“事实上,我期待AI越来越强大,如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现,那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。”
此外,颜宁还解释了关闭微博评论功能的原因:“因为这样就不会忍不住删黑了”。针对网上的各种揣测,颜宁说,“这两天有师友喊我辟谣,我真的很忙啊。八竿子打不着、错漏百出、但凡花一个钟头读论文也不至于那么眼瞎的碰瓷文章,给眼神都浪费时间,为啥要我辟谣啊?当然,如果将来某天SMART的法务看不下去了有什么行动,我就不拦了”。 https://t.cn/A6orikxt
【#颜宁撰文谈与AI团队合作#:真正的研究者都乐于拥抱技术进步】11月1日,在“2022深圳全球创新人才论坛”上,著名结构生物学家、美国国家科学院外籍院士颜宁宣布,将从普林斯顿大学辞职,加盟深圳医学科学院。
11月11日凌晨,颜宁通过个人微博@nyouyou 发文,针对近期一些相关话题作出回应。颜宁说:“去年8月8日,给了一个报告,讨论了AlphaFold的局限性;到今年的11月11日,发现去年的报告还是可以一张都不用改。简而言之,我专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题(electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins),AlphaFold在我们过去解析的诸多结构的基础上,去年的预测达到了我们2017年的水平;今年依旧停留在我们2017年的水平(这里仅针对Nav/Cav)。在与专门做结构预测的AI团队合作,他们做预测我们做实验,测试新型小分子与蛋白的相互作用,迄今为止预测无一正确。”
“结构生物学不仅仅是看到Fold(折叠),更要理解蛋白质的动态变化,要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用,要理解在细胞原位里的状态,这些都是AI目前尚无能为力的领域,因为尚没有足够的数据库去训练它。举个例子,我们Cav2.2的结构去年发表晚了,尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练,所以它预测的模型就与实验结构严重不符。”
“真正的研究者都乐于拥抱技术进步,善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。事实上,我期待AI越来越强大,如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现,那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。”(澎湃新闻)https://t.cn/A6orbUmm
11月11日凌晨,颜宁通过个人微博@nyouyou 发文,针对近期一些相关话题作出回应。颜宁说:“去年8月8日,给了一个报告,讨论了AlphaFold的局限性;到今年的11月11日,发现去年的报告还是可以一张都不用改。简而言之,我专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题(electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins),AlphaFold在我们过去解析的诸多结构的基础上,去年的预测达到了我们2017年的水平;今年依旧停留在我们2017年的水平(这里仅针对Nav/Cav)。在与专门做结构预测的AI团队合作,他们做预测我们做实验,测试新型小分子与蛋白的相互作用,迄今为止预测无一正确。”
“结构生物学不仅仅是看到Fold(折叠),更要理解蛋白质的动态变化,要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用,要理解在细胞原位里的状态,这些都是AI目前尚无能为力的领域,因为尚没有足够的数据库去训练它。举个例子,我们Cav2.2的结构去年发表晚了,尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练,所以它预测的模型就与实验结构严重不符。”
“真正的研究者都乐于拥抱技术进步,善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。事实上,我期待AI越来越强大,如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现,那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。”(澎湃新闻)https://t.cn/A6orbUmm
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