导师引领的化学动力学模型探索之旅
1. 启发式的讨论
今天,在导师的熟练指导下,我再次踏入了构建化学动力学模型的世界,更深层次地体验到建模思维在解决复杂问题中的至关重要性。我进一步认识到,只有掌握了正确的思维方式,我们才能在研究的迷宫中找到捷径,避免走弯路。
我们的工作重点集中在双细菌模型的一部分,这部分仅仅包含了一个细菌的一条通路,但其内含的反应却多达八个。由于这些反应中大多数都是简单的催化反应,我们把研究的焦点锁定在了其中两个特别的过程上:一种是可逆的反应,另一种是可以被最终产物抑制的反应。
2. 模型构建:理解与应用
2.1 舍弃边缘:忽略微小影响的过程
理论上,所有反应都具有可逆性,但在我们关注的尺度范围内,某些反应的逆向过程速度较慢,因此可以放心忽略。这一观察揭示了一个重要的建模思维:我们需要在每个反应物节点处考虑进出的流量,并识别主导反应。在稳态条件下,反应物浓度对时间的导数为零,意味着进入的流量等于流出的流量。
2.2 主导流量:在不同条件下确定主要反应
当酶浓度较低时,我们通常会假设底物浓度是一个常数。然而,当酶浓度提高,反应速率也会随之提升,这可能会导致底物被快速消耗。在此种情况下,如果目标反应速率并不高,底物的流出量可以被忽略,因此底物浓度可以被视为常数。然而,一旦反应速度提高,这个流出的流量就不能被忽略,甚至可能变成主导流量。
2.3 模型的边界条件:建模思维的实际应用
模型的整体性质可能会因为流量关系的改变而发生变化。实际的建模过程中,我们根据不同的流量关系,对系统做出适当的简化假设。我们的目标是让模型本身成为主导,而非被得出的方程式所主导。这样,当模型需要跨越边界条件时,我们就不会受限于推导出的复杂方程。
2.4 实验结果驱动的模型确定
在理解了主要反应后,我们需要为这个反应确定合适的模型。这一步骤在处理抑制性反应过程中尤其重要:我们主要关注三种类型的抑制反应:竞争性抑制、非竞争性抑制和无竞争性抑制。确定选择哪种反应需要根据相应的实验结果,甚至可能需要对酶蛋白结构进行深入观察。
3. 总结与展望
回顾今日的工作,我们通过深入理解反应过程和建模思维的原则,以更有效的方式推动了研究进程。未来,我需要继续提升建模技巧,并在导师的引导下,通过理解和应用这些原则,更深入地探索我们的研究领域。
#浆果科研日常#
1. 启发式的讨论
今天,在导师的熟练指导下,我再次踏入了构建化学动力学模型的世界,更深层次地体验到建模思维在解决复杂问题中的至关重要性。我进一步认识到,只有掌握了正确的思维方式,我们才能在研究的迷宫中找到捷径,避免走弯路。
我们的工作重点集中在双细菌模型的一部分,这部分仅仅包含了一个细菌的一条通路,但其内含的反应却多达八个。由于这些反应中大多数都是简单的催化反应,我们把研究的焦点锁定在了其中两个特别的过程上:一种是可逆的反应,另一种是可以被最终产物抑制的反应。
2. 模型构建:理解与应用
2.1 舍弃边缘:忽略微小影响的过程
理论上,所有反应都具有可逆性,但在我们关注的尺度范围内,某些反应的逆向过程速度较慢,因此可以放心忽略。这一观察揭示了一个重要的建模思维:我们需要在每个反应物节点处考虑进出的流量,并识别主导反应。在稳态条件下,反应物浓度对时间的导数为零,意味着进入的流量等于流出的流量。
2.2 主导流量:在不同条件下确定主要反应
当酶浓度较低时,我们通常会假设底物浓度是一个常数。然而,当酶浓度提高,反应速率也会随之提升,这可能会导致底物被快速消耗。在此种情况下,如果目标反应速率并不高,底物的流出量可以被忽略,因此底物浓度可以被视为常数。然而,一旦反应速度提高,这个流出的流量就不能被忽略,甚至可能变成主导流量。
2.3 模型的边界条件:建模思维的实际应用
模型的整体性质可能会因为流量关系的改变而发生变化。实际的建模过程中,我们根据不同的流量关系,对系统做出适当的简化假设。我们的目标是让模型本身成为主导,而非被得出的方程式所主导。这样,当模型需要跨越边界条件时,我们就不会受限于推导出的复杂方程。
2.4 实验结果驱动的模型确定
在理解了主要反应后,我们需要为这个反应确定合适的模型。这一步骤在处理抑制性反应过程中尤其重要:我们主要关注三种类型的抑制反应:竞争性抑制、非竞争性抑制和无竞争性抑制。确定选择哪种反应需要根据相应的实验结果,甚至可能需要对酶蛋白结构进行深入观察。
3. 总结与展望
回顾今日的工作,我们通过深入理解反应过程和建模思维的原则,以更有效的方式推动了研究进程。未来,我需要继续提升建模技巧,并在导师的引导下,通过理解和应用这些原则,更深入地探索我们的研究领域。
#浆果科研日常#
#小家联行[超话]# 小家联行作为一家租房公司,小家联行在租赁市场上取得了一定的成功。然而,随着规模的扩大和管理问题的出现,许多租客开始抱怨服务质量下降,并且收取的费用不断增加。他们感觉自己成为了小家联行不合理收费的对象。
小家联行对此进行了反思,并加强了员工管理。然而,这些措施并不能解决与租客之间的矛盾。租客仍然需要支付许多额外费用,租房成本不断上升。
意识到提高公司声誉至关重要,小家联行决定采取更多措施来保护租客利益,并确保他们能以更少的费用获得更好的房屋。同时,在适当的时候,小家联行也会返还之前收取的不合理费用给所有受影响的租客。
我们希望小家联行能够真正履行承诺,改善服务质量,并为年轻人提供更好的租房体验。#小家联行最新消息#
小家联行对此进行了反思,并加强了员工管理。然而,这些措施并不能解决与租客之间的矛盾。租客仍然需要支付许多额外费用,租房成本不断上升。
意识到提高公司声誉至关重要,小家联行决定采取更多措施来保护租客利益,并确保他们能以更少的费用获得更好的房屋。同时,在适当的时候,小家联行也会返还之前收取的不合理费用给所有受影响的租客。
我们希望小家联行能够真正履行承诺,改善服务质量,并为年轻人提供更好的租房体验。#小家联行最新消息#
#游戏设计快乐之道#
实际上完全抽象的游戏是没人会玩的。我在本书中画的那些抽象图,你不会去玩,你只会去玩那些小型宇宙飞船游戏、激光箭游戏以及有着刺激音效的游戏。玩游戏的目的是为了得到"快乐",是为了解决难题并驾驭场景,但这并不意味着游戏就只是追求快乐,而无视其他所有方面。
人们喜欢在木制棋盘上装饰好看的珠子,也同样喜欢购买《指环王》国际象棋和玻璃做的中国跳棋。玩游戏过程中的审美体验很重要。当你拿起一个精工雕刻的木制棋子时,会有一种审美愉悦感——这也是一种享受。当你打乒乓球时,把自己的手臂伸展到极限大力扣杀时,会有一种发自内心的愉悦。最后,当你拍拍队友的后背,祝贺他在运动场上得分时,你正在加入到一场标志着人类社会地位的微妙的社会交谊舞当中。
其他媒介也同样如此,歌由谁来唱是很重要的,这就是表演。精装版的书就是比廉价的平装书值钱,尽管二者的内容是完全一样的。这正如真正的攀岩与在墙壁上假攀岩感觉是不一样的。
在很多媒介中,展示是不由内容创造者掌控的。但在另外一些媒介中,创造者则拥有决定权。一般来说,某位特定人员负责总体的体验,这与内容本身相对。也就是说,这个人对于最终结果的控制权要大于内容创建者。
比如在一部电影中,导演权力大过编剧,在交响乐团中,指挥权力大过作曲。这就是内容设计和终端用户体验设计之间的差别。
实际上完全抽象的游戏是没人会玩的。我在本书中画的那些抽象图,你不会去玩,你只会去玩那些小型宇宙飞船游戏、激光箭游戏以及有着刺激音效的游戏。玩游戏的目的是为了得到"快乐",是为了解决难题并驾驭场景,但这并不意味着游戏就只是追求快乐,而无视其他所有方面。
人们喜欢在木制棋盘上装饰好看的珠子,也同样喜欢购买《指环王》国际象棋和玻璃做的中国跳棋。玩游戏过程中的审美体验很重要。当你拿起一个精工雕刻的木制棋子时,会有一种审美愉悦感——这也是一种享受。当你打乒乓球时,把自己的手臂伸展到极限大力扣杀时,会有一种发自内心的愉悦。最后,当你拍拍队友的后背,祝贺他在运动场上得分时,你正在加入到一场标志着人类社会地位的微妙的社会交谊舞当中。
其他媒介也同样如此,歌由谁来唱是很重要的,这就是表演。精装版的书就是比廉价的平装书值钱,尽管二者的内容是完全一样的。这正如真正的攀岩与在墙壁上假攀岩感觉是不一样的。
在很多媒介中,展示是不由内容创造者掌控的。但在另外一些媒介中,创造者则拥有决定权。一般来说,某位特定人员负责总体的体验,这与内容本身相对。也就是说,这个人对于最终结果的控制权要大于内容创建者。
比如在一部电影中,导演权力大过编剧,在交响乐团中,指挥权力大过作曲。这就是内容设计和终端用户体验设计之间的差别。
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