#园艺# 【#荔枝#高密度SNP标记遗传图谱的构建及矮化QTL分析】
荔枝在亚热带地区广泛种植,具有重要的经济价值。高密度遗传图谱构建和相关数量性状基因座(QTL)定位是分子标记辅助育种的前提。
本研究利用矮化荔枝品种‘紫娘喜’和乔化荔枝品种‘妃子笑’之间的178个子代F1群体为材料,采用基因分型测序(GBS)技术构建基于单核苷酸多态性(SNP)的高密度连锁图谱。遗传图谱包含3027个SNP标记,分布在15个连锁群上,总的遗传距离为1711.97 cM,平均遗传距离为0.57 cM。
基于此高密度遗传图谱和三年的表型分析,共检测到37个QTL与8个矮化性状相关,包括枝梢长度(LNB)、枝梢直径(DNB)、复叶柄长度(LCP)、复叶柄直径(DCP)、节间长度(LI)、叶片长度(LSL)、叶片宽度(WSL)和株高(PH)。这些QTL可以解释8.0%至14.7%(平均= 9.7%)的表型变异。其中,发现几个QTL簇,特别是在LG04和LG11连锁群上,暗示调节荔枝矮化性状的基因可能成簇分布。
在这些QTL区间鉴定到126个候选基因,其中55个基因在‘紫娘喜’和‘妃子笑’之间的表达存在差异。这些差异表达基因(DEGs)参与细胞发育、物质运输、信号转导和植物形态发生的调控,可能在调控植物矮化性状中起重要作用。高密度遗传图谱构建及矮化性状相关QTLs分析将为荔枝分子标记辅助育种奠定坚实的基础。
文章链接https://t.cn/A6MtuHRy
>>HU Fu-chu, CHEN Zhe, WANG Xiang-he, WANG Jia-bao, FAN Hong-yan, QIN Yong-hua, ZHAO Jie-tang, HU Gui-bing. 2021. Construction of high-density SNP genetic maps and QTL mapping for dwarf-related traits in Litchi chinensis Sonn. Journal of Integrative Agriculture, 20(11): 2900–2913.
荔枝在亚热带地区广泛种植,具有重要的经济价值。高密度遗传图谱构建和相关数量性状基因座(QTL)定位是分子标记辅助育种的前提。
本研究利用矮化荔枝品种‘紫娘喜’和乔化荔枝品种‘妃子笑’之间的178个子代F1群体为材料,采用基因分型测序(GBS)技术构建基于单核苷酸多态性(SNP)的高密度连锁图谱。遗传图谱包含3027个SNP标记,分布在15个连锁群上,总的遗传距离为1711.97 cM,平均遗传距离为0.57 cM。
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《本来》
“万的物声音,自的然开始,归还你来本样子。”
摄影:Sandra Zeng@sandrazeng_ifmuseum
创制意作/策划: @IFMUSEUM STUDIO
模特:@faanshu 徐凡舒@火文石化
妆发:Helen Hu
制片:Allen Li
后期:Rock Sun
摄助影理:Benny Xiang@OH-me
文字:Mr.Early
海冲浪刷着地平线,风锤也炼着尘土,沿峭岩蜿蜒而上,我望凝着干涸,默念那是大地的原貌。
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