#贝壳[超话]# 冷泉中的深海贻贝——Gigantidas mauritanicus (Cosel, 2002)
Gigantidas mauritanicus (Cosel, 2002)，分类上属于：
贻贝科Mytilidae Rafinesque, 1815
＞Gigantidas Cosel & B. A. Marshall, 2003
＞Gigantidas childressi (Gustafson, R. D. Turner, Lutz & Vrijenhoek, 1998)
Gigantidas coseli Saether, C. Little, K. A. Campbell, B. A. Marshall, M. Collins & Alfaro, 2010 †
Gigantidas gladius Cosel & B. A. Marshall, 2003
Gigantidas haimaensis T. Xu, D. Feng, J. Tao & J.-W. Qiu, 2019
Gigantidas horikoshii Hashimoto & Yamane, 2005
Gigantidas mauritanicus (Cosel, 2002)
Gigantidas platifrons (Hashimoto & Okutani, 1994)
Gigantidas samario Cosel & Gracia, 2018
Gigantidas taiwanensis (Cosel, 2008)
Gigantidas tangaroa (Cosel & B. A. Marshall, 2003)
Gigantidas vrijenhoeki S.-J. Jang, P.-T. Ho, S.-Y. Jun, D. Kim & Y.-J. Won, 2020
国际上一般将大于等于1000m水深的区域定义为深海：深海独特的理化环境与黑暗、高压、低氧、常富重金属等物质的极端条件，长久以来被认为不适合生物生存，被称为“生命的禁区”。直至深海热液、冷泉生态系统的发现，才打破了这一印象，重新定义了生命，为研究生命起源与适应性进化提供了更多的可能。冷泉指分布于深海活动和被动的大陆边缘斜坡，主要包含水、甲烷为主的碳氢化合物、硫化氢等物质，在特定的温度和压力下，海底储存的天然气水合物和天然气会达到一种平衡状态，使得天然气从海底深处沿着一定的通道向海底表面扩散的过程，流体喷口附近可发育出化能自养的大型底栖生物群落，由Gigantidas属构成的贻贝床就是其中之一。通过利用碳氮稳定同位素分析可知，该属均为极度依赖鳃组织中的高度专一性的共生细菌，对甲烷、硫化氢等还原性物质进行氧化从而获取能量的物种。还有些研究表明，这些深海的贻贝科物种可能是由浅海的物种通过沉木或鲸落等方式，逐步适应深海环境，从而演化成如今的模样。这些体型硕大的生活在千米之渊的木棕色贻贝，虽然外表其貌不扬；然而顽强生活在生命禁区下的它们，正向人们展示着生命的神奇与伟大。
采集信息：Off Mauritanian Coast , 1200mts diepte, by barco. M. P. Peige de Mar. 18°41’ N 16°45′ W 1/1/1994 From Jose Maria Hernandez
Ps：基本上这类深海的标本很难获取到，唯一的途径可能就是科考活动，能收入一个有点小激动
Gigantidas mauritanicus (Cosel, 2002)，分类上属于：
贻贝科Mytilidae Rafinesque, 1815
＞Gigantidas Cosel & B. A. Marshall, 2003
＞Gigantidas childressi (Gustafson, R. D. Turner, Lutz & Vrijenhoek, 1998)
Gigantidas coseli Saether, C. Little, K. A. Campbell, B. A. Marshall, M. Collins & Alfaro, 2010 †
Gigantidas gladius Cosel & B. A. Marshall, 2003
Gigantidas haimaensis T. Xu, D. Feng, J. Tao & J.-W. Qiu, 2019
Gigantidas horikoshii Hashimoto & Yamane, 2005
Gigantidas mauritanicus (Cosel, 2002)
Gigantidas platifrons (Hashimoto & Okutani, 1994)
Gigantidas samario Cosel & Gracia, 2018
Gigantidas taiwanensis (Cosel, 2008)
Gigantidas tangaroa (Cosel & B. A. Marshall, 2003)
Gigantidas vrijenhoeki S.-J. Jang, P.-T. Ho, S.-Y. Jun, D. Kim & Y.-J. Won, 2020
国际上一般将大于等于1000m水深的区域定义为深海：深海独特的理化环境与黑暗、高压、低氧、常富重金属等物质的极端条件，长久以来被认为不适合生物生存，被称为“生命的禁区”。直至深海热液、冷泉生态系统的发现，才打破了这一印象，重新定义了生命，为研究生命起源与适应性进化提供了更多的可能。冷泉指分布于深海活动和被动的大陆边缘斜坡，主要包含水、甲烷为主的碳氢化合物、硫化氢等物质，在特定的温度和压力下，海底储存的天然气水合物和天然气会达到一种平衡状态，使得天然气从海底深处沿着一定的通道向海底表面扩散的过程，流体喷口附近可发育出化能自养的大型底栖生物群落，由Gigantidas属构成的贻贝床就是其中之一。通过利用碳氮稳定同位素分析可知，该属均为极度依赖鳃组织中的高度专一性的共生细菌，对甲烷、硫化氢等还原性物质进行氧化从而获取能量的物种。还有些研究表明，这些深海的贻贝科物种可能是由浅海的物种通过沉木或鲸落等方式，逐步适应深海环境，从而演化成如今的模样。这些体型硕大的生活在千米之渊的木棕色贻贝，虽然外表其貌不扬；然而顽强生活在生命禁区下的它们，正向人们展示着生命的神奇与伟大。
采集信息：Off Mauritanian Coast , 1200mts diepte, by barco. M. P. Peige de Mar. 18°41’ N 16°45′ W 1/1/1994 From Jose Maria Hernandez
Ps：基本上这类深海的标本很难获取到，唯一的途径可能就是科考活动，能收入一个有点小激动
【冈大·科研】栽培柿子的高精度全基因组解读～阐明果实和性别的进化
（冈山大学 KAZUSA DNA研究所 农研机构）
◆发表要点
·栽培柿主要品种“太秋”全基因组信息解读。
·根据基因组信息，明确了栽培柿独自的果实性状的进化和重要的基因领域。
·明确了栽培柿中“破坏性染色体”的进化过程。
生物生存最低限度需要的一组基因信息被称为“基因组”。包括人类在内的很多生物都是拥有两套基因组的“二倍体”，但是在植物，特别是栽培的作物中，有很多拥有多套基因组的“倍数体”。我们平时吃的栽培柿子也是倍数体，是有6套基因组的“六倍体”。栽培柿子除了甜柿、涩柿之外，还有各种各样的果实形状、在一棵树中摇曳的性别（雄花、雌花、两性花）等独特的性状。这些性状在近缘野生种中并不常见.一般认为六倍体的栽培柿子是在倍数性进化和栽培化的过程中得到的。
此次，冈山大学学术研究院环境生命自然科学学域（农）赤木刚士教授和堀内绫乃研究生（硕士课程2年），高精度解读栽培柿子的主要品种「太秋」的全基因组信息，根据其DNA排列信息明确了与近缘种的分歧和栽培柿子变成六倍体的年代和使“损坏的性染色体”成立的进化过程。并且，通过使用日本国内存在的约170个栽培柿子品种群的全基因组数据，日本的栽培柿子并没有特定的栽培化根源，而是按品种群独立分化为零散的过程，以及甜柿、涩柿的不同、各种各样的果实的形状等，在栽培柿子进化中独自得到的有用性状中确定了重要的基因群的存在领域。根据本研究，制作了本来被认为很难解析的六倍体栽培柿子的遗传解析基础，得到了关于其独自的进化和有用性状的见解。本成果中有关全基因组解读及性别进化的内容刊登在进化学的国际论文杂志《Molecular Biology and Evolution》上，关于栽培柿子的品种分化和果实性状的进化的内容刊登在基因组科学的国际论文杂志《DNA Research》上。本研究是作为与KAZUSA DNA研究所、农研机构果树茶业研究部门的共同研究而进行的。
■论文信息1
论文名：Ongoing rapid evolution of a post-Y region revealed by chromosome-scale genome assembly of a hexaploid monoecious persimmon (Diospyros kaki)
刊登：Molecular Biology and Evolution
作者：Ayano Horiuchi, Kanae Masuda, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Naoko Fujita, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi*
D O I：https://t.cn/A60G2MIf
U R L：https://t.cn/A60G2MIV
■论文信息2
论文名：Genetic basis of lineage-specific evolution of fruit traits in hexaploid persimmon
刊登：DNA Research
作者：Ayano Horiuchi, Kanae Masuda, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Ryusuke Matsuzaki, Ryutaro Tao, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi*
D O I：https://t.cn/A60G2MIc
U R L：https://t.cn/A60G2MIt
■研究资金
本研究科学技术振兴机构（JST）战略性创造研究推进事业首先“为控制领域中植物生命现象创造下一代基础技术（研究总结：冈田清孝）”的研究课题“以柿属为模型的环境响应性的性表现多样化机构的阐明（JPMJPR15Q1）”（研究人员：赤木刚士，研究时间：2015年12月-2019年3月），先驱“植物分子的功能与控制（研究总结：西谷和彦）”中研究课题「基因组·基因倍化驱动的植物分子的新功能的探索和设计（JPMJPR20D1）」（研究者：赤木刚士，研究期间：2020年12月～2024年3月），学术变革领域（A）“挑战性两性花原理（22H05172）”（领域代表：赤木刚士）中的“驱动植物“可塑性”的基因组动态原理（22H05173）”（研究者：赤木刚士，研究期间：2022年7月～2027年3月）和在“从横向基因组比较俯瞰两性花多样化变迁（22H05181）”（研究者：白泽健太，研究期间：2022年7月～2027年3月）的支持下实施。
＜详细研究内容＞
栽培柿子的高精度全基因组解读～阐明果实和性别的进化
＜咨询窗口＞
冈山大学学术研究院环境生命自然科学学域（农）
教授 赤木刚士
（TEL）086-251-8337
（冈山大学 KAZUSA DNA研究所 农研机构）
◆发表要点
·栽培柿主要品种“太秋”全基因组信息解读。
·根据基因组信息，明确了栽培柿独自的果实性状的进化和重要的基因领域。
·明确了栽培柿中“破坏性染色体”的进化过程。
生物生存最低限度需要的一组基因信息被称为“基因组”。包括人类在内的很多生物都是拥有两套基因组的“二倍体”，但是在植物，特别是栽培的作物中，有很多拥有多套基因组的“倍数体”。我们平时吃的栽培柿子也是倍数体，是有6套基因组的“六倍体”。栽培柿子除了甜柿、涩柿之外，还有各种各样的果实形状、在一棵树中摇曳的性别（雄花、雌花、两性花）等独特的性状。这些性状在近缘野生种中并不常见.一般认为六倍体的栽培柿子是在倍数性进化和栽培化的过程中得到的。
此次，冈山大学学术研究院环境生命自然科学学域（农）赤木刚士教授和堀内绫乃研究生（硕士课程2年），高精度解读栽培柿子的主要品种「太秋」的全基因组信息，根据其DNA排列信息明确了与近缘种的分歧和栽培柿子变成六倍体的年代和使“损坏的性染色体”成立的进化过程。并且，通过使用日本国内存在的约170个栽培柿子品种群的全基因组数据，日本的栽培柿子并没有特定的栽培化根源，而是按品种群独立分化为零散的过程，以及甜柿、涩柿的不同、各种各样的果实的形状等，在栽培柿子进化中独自得到的有用性状中确定了重要的基因群的存在领域。根据本研究，制作了本来被认为很难解析的六倍体栽培柿子的遗传解析基础，得到了关于其独自的进化和有用性状的见解。本成果中有关全基因组解读及性别进化的内容刊登在进化学的国际论文杂志《Molecular Biology and Evolution》上，关于栽培柿子的品种分化和果实性状的进化的内容刊登在基因组科学的国际论文杂志《DNA Research》上。本研究是作为与KAZUSA DNA研究所、农研机构果树茶业研究部门的共同研究而进行的。
■论文信息1
论文名：Ongoing rapid evolution of a post-Y region revealed by chromosome-scale genome assembly of a hexaploid monoecious persimmon (Diospyros kaki)
刊登：Molecular Biology and Evolution
作者：Ayano Horiuchi, Kanae Masuda, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Naoko Fujita, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi*
D O I：https://t.cn/A60G2MIf
U R L：https://t.cn/A60G2MIV
■论文信息2
论文名：Genetic basis of lineage-specific evolution of fruit traits in hexaploid persimmon
刊登：DNA Research
作者：Ayano Horiuchi, Kanae Masuda, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Ryusuke Matsuzaki, Ryutaro Tao, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi*
D O I：https://t.cn/A60G2MIc
U R L：https://t.cn/A60G2MIt
■研究资金
本研究科学技术振兴机构（JST）战略性创造研究推进事业首先“为控制领域中植物生命现象创造下一代基础技术（研究总结：冈田清孝）”的研究课题“以柿属为模型的环境响应性的性表现多样化机构的阐明（JPMJPR15Q1）”（研究人员：赤木刚士，研究时间：2015年12月-2019年3月），先驱“植物分子的功能与控制（研究总结：西谷和彦）”中研究课题「基因组·基因倍化驱动的植物分子的新功能的探索和设计（JPMJPR20D1）」（研究者：赤木刚士，研究期间：2020年12月～2024年3月），学术变革领域（A）“挑战性两性花原理（22H05172）”（领域代表：赤木刚士）中的“驱动植物“可塑性”的基因组动态原理（22H05173）”（研究者：赤木刚士，研究期间：2022年7月～2027年3月）和在“从横向基因组比较俯瞰两性花多样化变迁（22H05181）”（研究者：白泽健太，研究期间：2022年7月～2027年3月）的支持下实施。
＜详细研究内容＞
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＜咨询窗口＞
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教授 赤木刚士
（TEL）086-251-8337
黃沙長沙屬於越南
我們不會放棄健身 China chúng mày bị thằng chủ tịch nước bịt cặc nên đéo biết gì à
China là NHÀ TÙ LỚN NHẤT THẾ GIỚI
Đã ngu còn oai biết cái cặc gì về bên ngoài mà sủa như các ông tướng
Kim Jong-Un của chúng mày bằng con bet nhà tao thôi nhá
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