#西安交大科研人员开发出高效的宏基因组分析新工具#细菌、古细菌等微生物作为地球上现存最古老的生命形式，在生物进化、生命健康、物质循环和环境变化的进程中扮演重要角色。绘制完整基因组序列是研究其系统分类的基础，但受限于微生物基因组序列的复杂性，基于测序技术和序列拼装算法从混合微生物样本中获得完整基因组序列非常困难，尤其对于不可培养的稀有细菌，迄今仅有少量的微生物被测序。因此，急需在聚类方法上突破，开发出从混合微生物序列集（宏基因组）中精准分类的有效工具。

近日，西安交通大学生命学院生物医学信息与基因组学中心（Biomedical Informatics & Genomics Center, BIGC）杨铁林教授团队在宏基因组序列聚类方法上取得重要进展，开发出新的工具MetaDecoder，该工具首先构建了基于GPU的样本加权狄利克雷过程高斯混合模型（DPGMM）以降低原始宏基因组复杂性，然后使用微生物序列碱基组成模型和测序数据覆盖度模型迭代处理低复杂度宏基因组序列，最终产生完整性高且污染度低的基因组水平序列集合，此方法在准确性及计算效率上领先于当前主流的宏基因组序列聚类方法。

2017年9月至2018年8月期间，研究人员在广州4个采集点（白云区雄伟村，白云区南方村，越秀区科苑社区，以及天河区陶庄社区）采集了 3346只成年白纹伊蚊，并通过宏基因组（metagenomic）技术，评估了这些蚊子中所携带的病毒。研究人员从这3346只白纹伊蚊中提取了27464028个清晰的基因读数，那么，他们究竟属于什么病毒？详情：https://t.cn/A66xDbEU

广州地区全年平均气温22-23℃，平均年降雨量约2000毫米。这种环境非常适合白纹伊蚊的生存。而白纹伊蚊是多种致病病毒的传播者，也存在着携带未知病毒的较大可能。持续对白纹伊蚊及其所携带病毒的监测，是维护保护公共健康的重要措施。

#华大智造# 最新推出了一款专注于肠道菌群基因组DNA提取的试剂盒——MGIEasy粪便基因组DNA（meta）提取试剂盒，适配华大智造自动化平台。该试剂盒使用超强吸附性的纳米磁珠捕获技术和独特的缓冲技术，有效去除样本中的杂质，同时搭配搭配MGIEasy组织研磨珠，获得高质量的微生物基因组DNA。提取的产物可用于肠道宏基因组的研究、肠道罕见菌群的挖掘、肠道菌群数据库的建立、肠道菌群的进化等场景。了解更多：https://t.cn/A66GxQgu